| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 3610388 | 78 (0.880) | 6 (0.070) | 5/234 | NT | 7.5% | coding (3339/3396 nt) | mcoA | Mn(II) copper oxidase A |
| ? | NC_002947 | = 3610420 | 74 (0.880) | coding (3307/3396 nt) | mcoA | Mn(II) copper oxidase A | |||||
GCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATCCCAGGTGAACC > NC_002947/3610272‑3610569 | gtattatgCGGTACTAGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCT‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCggtggtg < 2:1343061/145‑1 (MQ=255)gCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTg < 2:2405175‑M2/150‑2 (MQ=255) cATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTgg < 1:1248521‑M2/150‑3 (MQ=255) atgAGGTCTTCGTGGGTTGTCGGTTGGGGGCCG‑T‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCGCTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACTGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCAGCGTGACCGTCGCTGGCGTTTCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCAc < 2:989120/150‑1 (MQ=255) tgCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCAcc > 2:514272/1‑150 (MQ=255) ggTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCt > 2:278221/1‑150 (MQ=255) ccTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTAcc < 2:1319914/150‑1 (MQ=255) cTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTAGGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTAccc > 2:1782826/1‑150 (MQ=255) gTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACg > 2:670841/1‑150 (MQ=255) gTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACg < 2:1521009/150‑1 (MQ=255) tGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGcccc > 1:707574/1‑150 (MQ=255) tGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGcccc < 1:278221/150‑1 (MQ=255) aaagcggggCCGCC‑AT‑GCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGcccc > 1:383821/6‑150 (MQ=255) aaagcggggCCGCC‑AT‑GCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGcccc > 2:2404190/6‑150 (MQ=255) agcggggccg‑CCATG‑CGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTg < 1:1809191‑M2/119‑2 (MQ=255) agcggggccg‑CCATG‑CGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTg > 2:1809191‑M2/4‑121 (MQ=255) ggggCCG‑C‑CATGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTggtcagc > 2:405931‑M2/1‑118 (MQ=255) ggggCCG‑C‑CATGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCAcc > 1:405931/1‑125 (MQ=255) gCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCg > 1:860248/1‑150 (MQ=255) 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cTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTcgcg < 2:667238/150‑1 (MQ=255) tttGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGt < 2:29446/150‑1 (MQ=255) actcactTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTcccc > 1:1073999/1‑150 (MQ=255) actTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGc > 1:1474475/1‑150 (MQ=255) ttGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCtt > 2:124175/1‑150 (MQ=255) 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cTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTgg > 1:949649/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTgg < 2:1425366/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGtt < 2:1381917/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTc < 2:1250820/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTccac > 2:977541/1‑148 (MQ=255) gggCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGc > 2:851300/1‑150 (MQ=255) gCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCa < 1:1411597/74‑1 (MQ=255) gCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCa > 2:1411597/1‑74 (MQ=255) aaaGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATc > 2:2006121/1‑150 (MQ=255) aaGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATcc > 2:1846483/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATccc < 2:860248/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATCCCa < 1:1846483/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATCCCAgg < 1:2333564/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGCCACGCTGATGCTGTTGc < 2:647155/114‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGCCACGCTGATGCTGTTGc > 1:647155/1‑114 (MQ=255) ggtggtggtCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATCCCAGGt < 2:1452590/150‑1 (MQ=255) ggtggtggtCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATCCCAGGt < 1:1782826/150‑1 (MQ=255) gtggtCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATCCCAGGTGTAc < 1:2405175/150‑1 (MQ=255) gtggtCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATCCCAGGTGGAc < 1:2404190/150‑1 (MQ=255) tggtCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATCCCAGGTGAAcc < 2:383821/150‑1 (MQ=255) | GCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCACCGTGGTTGTCCCCTGCACATCCCAGGTGAACC > NC_002947/3610272‑3610569 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |