New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3886959 | 59 (0.670) | 13 (0.150) | 11/246 | NT | 16.7% | coding (942/2118 nt) | PP_3430 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | 3963919 = | 71 (0.800) | coding (129/933 nt) | PP_3493 | LysR family transcriptional regulator |
CGCTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGAACAGCCCGGACACTGCCAATC > NC_002947/3886813‑3887107 | cgcTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCg < 2:482347/150‑1 (MQ=255) gcTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCgg < 1:1594345/150‑1 (MQ=255) gcTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGAACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctgg < 1:913057‑M1/150‑5 (MQ=255) tGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTg < 1:981537/150‑1 (MQ=255) agcagTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATg > 1:108523/1‑150 (MQ=255) gTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGAt > 1:813464/1‑145 (MQ=255) gTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGAt < 2:813464/145‑1 (MQ=255) tCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCgg > 2:2215995/1‑150 (MQ=255) cGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCCGCCCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGc < 1:1158068/150‑1 (MQ=255) ccgccgATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTGGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgat > 1:762722‑M1/1‑126 (MQ=255) cgATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgc < 2:762722‑M1/150‑29 (MQ=255) gATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCag < 2:108523/150‑1 (MQ=255) gATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCag > 2:2090274/1‑150 (MQ=255) aCAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGc < 2:1378521/150‑1 (MQ=255) cAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGcc < 1:745518/150‑1 (MQ=255) aaGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgc > 1:2353976‑M1/1‑108 (MQ=255) ttcatttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCACCCGTCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTc < 1:2248112/150‑1 (MQ=255) ttcatttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTc > 1:1060754/1‑150 (MQ=255) ttcatttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTc < 2:1581438/150‑1 (MQ=255) tcatttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCTCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCg < 1:2251711/150‑1 (MQ=255) tcatttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCg > 1:925292/1‑150 (MQ=255) atttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCagga < 1:408362/130‑1 (MQ=255) atttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCagga > 2:408362/1‑130 (MQ=255) atGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCaaa > 2:652248/1‑138 (MQ=255) atGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCaaa < 1:652248/138‑1 (MQ=255) atGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCa > 1:2122785/1‑150 (MQ=255) cATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTAAATACACTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGaaa > 1:2268090/1‑150 (MQ=255) aTGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAAc < 2:1746784/150‑1 (MQ=255) ccgcccgcCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgcagaaatatccagagcattggcagc < 2:1089392‑M1/150‑67 (MQ=255) cgcccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTCCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGt < 1:429854/150‑1 (MQ=255) gcccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGCCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTg < 1:1998809/150‑1 (MQ=255) ccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGt > 1:746596/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAAc > 1:497660/1‑118 (MQ=255) cTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAAc < 2:497660/118‑1 (MQ=255) ccaccaCCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgcagaaatatccagagcattggcagctgcagcgaagctgcca < 2:1423020‑M1/150‑83 (MQ=255) ccaccaCCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgca > 2:1079045‑M1/1‑68 (MQ=255) ccaccaCCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgca < 1:1079045‑M1/111‑44 (MQ=255) ccaccaCCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGt < 2:578308/78‑1 (MQ=255) ccaccaCCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGt > 1:578308/1‑78 (MQ=255) ccaccaCCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATcgc > 1:256531/1‑150 (MQ=255) ccaccaCCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGACTGCAGACCAGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATcgc > 2:195731/1‑150 (MQ=255) ccaccaCCTCCATACGCGCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCCGCCTGACTGGCAGCACTC‑CCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTCGTGACCATcgc > 2:84377/1‑150 (MQ=255) caccacCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATcgcg < 1:2378037/150‑1 (MQ=255) caccacCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATcgcg < 1:2215995/150‑1 (MQ=255) caccacCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCACA‑CTCAACGCTTTCTctgttctgtctgctcgtcgacgatgcgcgaaacctgcgctgcagaaatatccagagcattggcagctgcagcgaagctgccac > 1:1499564‑M1/1‑67 (MQ=255) accTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGgtgt < 2:2122785/150‑1 (MQ=255) cTCCCTACGCTGCCTCTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGGCGCGCAGC‑CTCTTCACGGGCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCg > 2:1001116/1‑150 (MQ=255) cTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTc < 2:1447679/109‑1 (MQ=255) cTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTc > 1:1447679/1‑109 (MQ=255) cTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCg < 2:925292/150‑1 (MQ=255) ccATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCa > 1:1500202/1‑124 (MQ=255) ccATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCa < 2:1500202/124‑1 (MQ=255) aTACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGcc < 1:445548/74‑1 (MQ=255) aTACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGcc > 2:445548/1‑74 (MQ=255) aTACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAgg > 2:589164/1‑150 (MQ=255) aTACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAgg > 2:1050001/1‑150 (MQ=255) tACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGc > 1:336303/1‑150 (MQ=255) gCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgcagaaatatccagagcattggcagctgcagcgaagctgccacattccaccacccgg > 2:1618575‑M1/1‑53 (MQ=255) cTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgcagaaatatccagagcattggcagctgcagcgaagctgccacattccaccacccggg > 2:1318788‑M1/1‑52 (MQ=255) gtgCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgcagaaatatccagagcattggcagctgcagcgaagctgccacattccaccacccgggtgaaggtac < 2:1499564‑M1/150‑108 (MQ=255) gtgCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgcagaaatatccagagcattggcagctgcagcgaagctgccacattccaccacccgggtgaaggtac < 2:1951867‑M1/150‑108 (MQ=255) tCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTGCAGCTGATcag > 1:721410/1‑148 (MQ=255) tCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCCGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCcg > 1:2107301/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCcgc < 2:336303/150‑1 (MQ=255) gcgcCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCTGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGt < 2:1905481/150‑1 (MQ=255) ccTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTctggttctccagctcggcgacgatgcgcgaaacctgcgctgcagaaatatccagagcattcgcagctgcagcgaaaccgcgacattccaccccccggttgaagggacgcatggcatgt < 2:2353976‑M1/150‑119 (MQ=255) ccTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGc < 2:740469/150‑1 (MQ=255) gCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCAt < 2:1060754/150‑1 (MQ=255) gC‑CTCTTCACGATCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGAACAGCCCg < 2:2181269/150‑1 (MQ=255) tctTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGAACAGCCCGGac > 2:1236025/1‑150 (MQ=255) ttCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGa < 2:1308607/107‑1 (MQ=255) ttCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGa > 1:1308607/1‑107 (MQ=255) ttCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGAtc > 1:989698/1‑109 (MQ=255) ttCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGAtc < 2:989698/109‑1 (MQ=255) ttCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGAACAGCCCGGacac > 1:911974/1‑150 (MQ=255) cTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTAGCGCCCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGAACAGCCCGGACACTGCCAATc > 1:636323/1‑150 (MQ=255) | CGCTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGC‑CTCTTCACGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGAACAGCCCGGACACTGCCAATC > NC_002947/3886813‑3887107 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |