New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3886959 | 59 (0.670) | 13 (0.150) | 11/246 | NT | 16.7% | coding (942/2118 nt) | PP_3430 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | 3963919 = | 71 (0.800) | coding (129/933 nt) | PP_3493 | LysR family transcriptional regulator |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCATGAAGGGGTGCTCCTTGTTTT > NC_002947/3963770‑3964067 | tGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGTTGGTGCGGTGCAGCATGCGGGTCTGCAGc < 1:92476/150‑1 (MQ=255) ggCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGATCTGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCt < 1:2000271/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCACGCGGCTCGCCGACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCACGCACGCTCCAGAAACCGCTCACGCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGGCTGCAGCTgg > 2:900963/1‑150 (MQ=255) cgcgAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGt > 1:641172/1‑150 (MQ=255) gcgAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGtt > 2:2240144/1‑150 (MQ=255) cgATGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTtc < 1:1297302/150‑1 (MQ=255) gTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGc < 2:2210984/150‑1 (MQ=255) gTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGATCCAGAAACCGCTCACACGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGc > 1:52292/1‑150 (MQ=255) gTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCACACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGc > 2:905108/1‑150 (MQ=255) gTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTgg < 2:193475/136‑1 (MQ=255) gTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTgg > 1:193475/1‑136 (MQ=255) tGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGcg > 1:1073642/1‑150 (MQ=255) gcgcCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGcga < 1:246948/150‑1 (MQ=255) gcgcCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGcga < 1:744050/150‑1 (MQ=255) cgcCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGcgac < 2:1850392/150‑1 (MQ=255) accccTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGcgacg > 2:2332563/2‑150 (MQ=255) ccccTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGcgacga > 1:1754128/1‑150 (MQ=255) ccgccgataccggacagcaagttgttcatttcatggcccatgccgcccgccaactggcccaccacctccatacgctcactgtggtgcatcagcgcctctgcctgacgcgcagcctcttcacggtctCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGAt > 1:762722‑M2/127‑150 (MQ=255) cccTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGAt > 2:944842/1‑150 (MQ=255) cccTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGAt > 1:951848/1‑150 (MQ=255) ccTCGCGCCTCGTCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATg < 1:59633/150‑1 (MQ=255) cTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATgc < 1:2302109/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATgcg < 1:2196745/150‑1 (MQ=255) cgataccggacagcaagttgttcatttcatggcccatgccgcccgccaactggcccaccacctccatacgctcactgttgtgcatcagcgcctctgcctgacgcgcagcctcttcacggtctCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATgcgc < 2:762722‑M2/28‑1 (MQ=255) cTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑cc < 1:1877108/127‑1 (MQ=255) cTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑cc > 2:1877108/1‑127 (MQ=255) cGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCt < 1:1389029/150‑1 (MQ=255) cccACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTgc > 1:1721010/1‑150 (MQ=255) ccACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTgcg > 1:1465249/1‑150 (MQ=255) aagttgttcatttcatggcccatgccgcccgccaactggcccaccacctccatacgctcactgttgtgcatcagcgcctctgcctgacgcgcagcctcttcacggtctCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGc > 1:2353976‑M2/109‑150 (MQ=255) ttcGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTgg > 2:1277215/1‑106 (MQ=255) ttcGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTgg < 1:1277215/106‑1 (MQ=255) ttcGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTgcg > 1:1950440/1‑140 (MQ=255) ttcGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAat < 2:1465249/150‑1 (MQ=255) tccgcagcaTGCTCAGCCGCGCCTGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCa < 2:1721010/147‑1 (MQ=255) agcagcATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACTCGCCTCGCACATCCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCaga > 1:1507031/1‑150 (MQ=255) agcagcATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCgg > 2:1647229/1‑112 (MQ=255) agcagcATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCgg < 1:1647229/112‑1 (MQ=255) gcaTGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCCAGGAAGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCAt > 1:1330036/1‑150 (MQ=255) caTGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCAtt < 2:1073642/150‑1 (MQ=255) caTGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTCCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCAtt < 1:968162/150‑1 (MQ=255) aTCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTTCAGAAATATCCAGAGCATTGGCa < 1:326933/150‑1 (MQ=255) ccgcccgccaactggcccaccacctccatacgctcactgttgtgcatcagcgcctctgcctgacgcgcagcctcttcacggtctCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGc < 2:1089392‑M2/66‑1 (MQ=255) tGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCt < 2:1553829/150‑1 (MQ=255) aCGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCa > 1:411926/1‑139 (MQ=255) aCGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCa < 2:411926/139‑1 (MQ=255) cGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAg < 2:1754128/150‑1 (MQ=255) gCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGTAGCTGCAGCGAAGc < 1:1192155/150‑1 (MQ=255) gCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGc < 2:2275277/150‑1 (MQ=255) gCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGc > 1:1139756/1‑150 (MQ=255) cctgctgcaccgcaccacccggcgcctgcgcatgagcgaggcgggtgagcggtGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATgc < 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tCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTTCGCCGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGCAgg > 1:410314/1‑150 (MQ=255) tCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAgg > 2:2047570/1‑150 (MQ=255) tCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAgg > 2:723158/1‑150 (MQ=255) gtgcatcagcgcctctgcctgacgcgcagcctcttcacggtctCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTAc < 2:1951867‑M2/107‑1 (MQ=255) gtgcatcagcgcctctgcctgacgcgcagcctcttcacggtctCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTAc < 2:1499564‑M2/107‑1 (MQ=255) cgcCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCATATTCCGCCACCCGAGTGAAGGTACgcatgg‑ca < 2:641172/150‑1 (MQ=255) cctctgcctgacgcgcagcctcttcacggtctCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTCGCAGCTGCAGCGAAACCGCGACATTCCACCCCCCGGTTGAAGGGAcgcatgg‑catgt < 2:2353976‑M2/118‑2 (MQ=255) gggTGGTGCGGTGGAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCACCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATgca < 2:789536/150‑1 (MQ=255) ggtggtGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATgcag < 2:365054/150‑1 (MQ=255) gtggtgCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACgcatgg > 2:1391012/1‑142 (MQ=255) ggtgcggtgcAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGCGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCAt < 1:1284419/150‑1 (MQ=255) gtgcggtgcAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAAATCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATg < 1:633371/150‑1 (MQ=255) ggtGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCACAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCa < 2:951848‑M2/147‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGGACATGCTGCATG‑CCATg < 1:1810707‑M2/149‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCATg > 1:413026‑M2/2‑150 (MQ=255) cagcagGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCATGaa < 2:1664033/150‑1 (MQ=255) ggTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCATGAAGGGGTGCTc > 1:1881328/1‑150 (MQ=255) gTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCATGAAGGGGTGCTcc > 1:969386/1‑150 (MQ=255) gCAGCTGGTTCT‑CGCGCTCGGCGACGATGCCAGAACCCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCATGAAGGGGTGCTCCTTGt < 2:1330036/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCCTTGGCAGCTGCAGAGCCGCTGAGCGATACCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCATGAAGGGGTGCTCCTTGtt > 1:1150686/1‑150 (MQ=255) aaGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGAGAAGCCTGATCTGGAGAAATTGCCAGCGCATTGGCAGCTGCAGGGAAGCTGGCACATTGCACCACCCGGGTGAAGGTACGCACGG‑TATGCAGTATGTCCATGAAGGTGTGCTCCTTGtt < 2:1494292/149‑1 (MQ=255) gCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCATGAAGGGGTGCTCCTTGtttt > 1:470387/1‑150 (MQ=255) | TGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCT‑CCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATTCCACCACCCGGGTGAAGGTACGCATGG‑CATGCAGCATGTCCATGAAGGGGTGCTCCTTGTTTT > NC_002947/3963770‑3964067 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |