| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3947984 | 30 (0.340) | 8 (0.120) | 8/190 | NT | 23.1% | coding (109/1797 nt) | PP_3483 | type II secretion system protein |
| ? | NC_002947 | = 3948013 | 30 (0.440) | coding (80/1797 nt) | PP_3483 | type II secretion system protein | |||||
GGTGAAGGTGTCGGGGGTGTCGCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCG > NC_002947/3947835‑3948133 | ggTGAAGGTGTCGGGGGTGTCGCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGG > 1:2238139‑M1/1‑150 (MQ=255) gTGAAGGTGTCGGGGGTGTCGCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGTGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGt > 2:2048126/1‑150 (MQ=255) gTGAAGGTGTCGGGGGTGTCGCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGt < 1:189943/150‑1 (MQ=255) ggggaatagcggcgcccgcacccctggccgagccagcctgcgacgcgcccctgagcggagtcgcaggccatgccagaagcattcgatgcaaccccggaatctgcaaagcctgcaccgacgTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTa < 1:1322119‑M1/30‑1 (MQ=255) gtgtCGGGGGTGTCGCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGTGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATca < 1:2048126/150‑1 (MQ=255) gggggTGTCGCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGt < 1:1042205/150‑1 (MQ=255) gtgtCGCAGGCCAGGAGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTAAGTGGCTTGCAGACGGGTCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCtgt < 2:157526/150‑1 (MQ=255) tgtCGCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCtgtg < 1:123294/150‑1 (MQ=255) tCGCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTggg < 2:2238139/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCt < 1:2048921/150‑1 (MQ=255) aggccaggcGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGc < 1:200419/150‑1 (MQ=255) ccctggccgagccagcctgcgacgcgcccctgagcggagtcgcaggccatgccagaagcattcgatgcaaccccggaatctgcaaagcctgcaccgacgTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGc < 2:2161917‑M1/51‑1 (MQ=255) gccaggcGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCAt > 2:1088142/1‑150 (MQ=255) gCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATc > 2:1926819‑M2/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgt > 2:1614762‑M2/1‑145 (MQ=255) cAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgg > 1:1183470‑M2/1‑143 (MQ=255) ggCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtggga > 2:2107907‑M2/1‑141 (MQ=255) cctgcgacgcgcccctgagcggagtcgcaggccatgccagaagcattcgatgcaaccccggaatctgcaaagcctgcaccgacgTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGa > 1:2161917‑M1/85‑150 (MQ=255) cctgcgacgcgcccctgagcggagtcgcaggccatgccagaagcattcgatgcaaccccggaatctgcaaagcctgcaccgacgTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGa > 1:1708298‑M1/85‑150 (MQ=255) tgcgacgcgcccctgagcggagtcgcaggccatgccagaagcattcgatgcaaccccggaatctgcaaagcctgcaccgacgTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGc > 2:1322119‑M1/83‑150 (MQ=255) gcgacgcgcccctgagcggagtcgcaggccatgccagaagcattcgatgcaaccccggaatctgcaaagcctgcaccgacgTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTgg < 2:2297833‑M1/64‑1 (MQ=255) gcgacgcgcccctgagcggagtcgcaggccatgccagaagcattcgatccaaccccggaatctgcaaagcctgcaccgacgTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTgg > 1:2297833‑M1/82‑145 (MQ=255) gTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgg < 1:1039134‑M1/150‑43 (MQ=255) ggCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggc < 2:12409‑M1/144‑45 (MQ=255) ggCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggc > 1:12409‑M1/1‑100 (MQ=255) cgcTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTTCCACAGGTACATCAAAGGTCTGTGTGGTGGAGACAAcctgagggaggggggatgcccgc < 1:292829‑M2/150‑24 (MQ=255) gcTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcg < 1:1107496‑M2/150‑25 (MQ=255) cTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAg > 2:1342844/1‑106 (MQ=255) cTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAg < 1:1342844/106‑1 (MQ=255) tCGTCAGTGGCTGGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTCCCGCCGAA‑TTTTTGCCGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTATGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaa > 1:149455‑M2/1‑124 (MQ=255) aGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGGTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgttatgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacc < 1:784523‑M1/150‑61 (MQ=255) tGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCg < 1:1705173/150‑1 (MQ=255) ttGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCGGTGGTCCACAGGTACATCACAGGTATGTGGACTGAATACATACTGTGGGGGCGGGCGTGCCCGCGAAGACGTCGGTgg > 2:2268539/1‑149 (MQ=255) ttGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGTTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTAGTTGc > 2:1211328/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGc < 2:1107496/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACa > 2:1042343/1‑79 (MQ=255) ggCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACa < 1:1042343/79‑1 (MQ=255) cTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCa > 2:2097798/1‑96 (MQ=255) cTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCa < 1:2097798/96‑1 (MQ=255) cAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCgg < 1:1088142/150‑1 (MQ=255) cggTCGCGGGGGTAG‑GCGCAAATTTTTGCTGCGTTCTTCGCGGGCATGCCCGTCCCCACAGGTACATCACAGGTCCGTGGGCTTCATCCATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGtt < 2:292829/149‑1 (MQ=255) aggTGGCGCGGGTGG‑GCGGAAATGTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGGATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGACTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGtt < 1:2268539/150‑1 (MQ=39) gTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtg > 2:2154940‑M1/1‑60 (MQ=255) gTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtg < 1:2154940‑M1/95‑36 (MQ=255) gcgGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTc > 2:950823/1‑118 (MQ=255) gcgGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTc < 1:950823/118‑1 (MQ=255) ggggTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCCCAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACCTCCTGTGGTAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGaa < 1:854810/150‑1 (MQ=255) gAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCCCAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGc < 1:1758500/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACTGGGAAATTACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGCAGCGGGGATGCGTGCGAAGACGTCGGTGCGGGCTTGGCAGATTCCGGGGTTGGCAGGGATGCGTCTGGCATAGCCt > 2:1004663/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtggga > 1:1980417‑M1/1‑34 (MQ=255) cTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtggga < 2:1980417‑M1/72‑39 (MQ=255) cTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGc < 1:2128151/140‑1 (MQ=255) cTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGc > 2:2128151/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCGGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGa > 1:1981089/1‑150 (MQ=255) tGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCGCCCACAGCTACGGCGCCGGTGGCTGGGCCGCATACATCCTGCTGGAGCGCGCATGCGCGGGCCGCGGTGGTTTCAGGCTTTGCCGATTCCAGCGTTGCATCGAATGCTTGTGGCATCGCCTGCGa > 2:32025/1‑150 (MQ=255) ggTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTGGCCAAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCTTACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACt < 1:1211328/150‑1 (MQ=255) ggTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaa < 1:1713550‑M2/86‑27 (MQ=255) ggTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaa > 2:1713550‑M2/1‑60 (MQ=255) ggTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATAACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaccccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccact < 1:784523‑M2/150‑91 (MQ=255) TCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGaa < 2:1619932‑M1/124‑1 (MQ=255) TCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGaa > 1:1619932‑M1/1‑124 (MQ=255) ttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcatcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggc > 2:2353145‑M1/1‑26 (MQ=255) ttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcatcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggc < 1:2353145‑M1/70‑45 (MQ=255) ttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacatacctgtgatgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccggcaaaaattcggcgggacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgccagccactgacga > 1:149455‑M1/1‑26 (MQ=255) ttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacc < 1:1713550‑M1/86‑61 (MQ=255) ttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacc > 2:1713550‑M1/1‑26 (MQ=255) gagcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACGTCACAGGTCGGTGGGCCGCATACATCCTGAGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCATTGCAGAGTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCAGGGCCTGCGCCTCCGCTc > 1:1659109/3‑150 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaaaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagc < 1:1107496‑M1/150‑127 (MQ=255) gcgGGCATCCCCCCTCCCTCAGGttgtctccaccacacagacctttgatgtacctgtggaagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagcg < 1:292829‑M1/150‑128 (MQ=255) GCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCAGACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAg < 2:1620818‑M1/150‑1 (MQ=255) GCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGgc < 1:2282877‑M1/150‑1 (MQ=255) ATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGgcgc < 2:1413149‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagcgcc > 1:12409‑M2/1‑44 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagcgcc < 2:12409‑M2/144‑101 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGATGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaa < 1:2353145‑M2/70‑27 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGATGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaa > 2:2353145‑M2/1‑44 (MQ=255) CCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTc < 2:2226564‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagcgcctgctcgac < 1:1039134‑M2/150‑109 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGGATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCGTGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCg < 2:1563565‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGc > 2:730763‑M1/1‑128 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGc < 1:730763‑M1/128‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCg < 1:690182‑M1/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagcgcctgctcgactgcc > 2:2107907‑M1/1‑9 (MQ=255) tCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccag < 2:1980417‑M2/72‑35 (MQ=255) tCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccag > 1:1980417‑M2/1‑38 (MQ=255) TCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCgg < 2:1051468‑M1/93‑1 (MQ=255) TCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCgg > 1:1051468‑M1/1‑93 (MQ=255) ccACAGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagcgcctgctcgactgcctg > 1:1183470‑M1/1‑7 (MQ=255) cacaGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgac > 2:2154940‑M2/1‑35 (MQ=255) cacaGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgac < 1:2154940‑M2/95‑61 (MQ=255) CACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAggctg < 2:1585153‑M1/150‑1 (MQ=255) acaGGatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagcgcctgctcgactgcctgga > 2:1614762‑M1/1‑5 (MQ=255) ACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAAt > 1:514201‑M1/1‑102 (MQ=255) ACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAAt < 2:514201‑M1/102‑1 (MQ=255) gatgtatgcagcccacagacctgtgatgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagcgcctgctcgactgcctggaacgc > 2:1926819‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGTGAAGGTGTCGGGGGTGTCGCAGGCCAGGCGTTCCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAG‑GCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCG > NC_002947/3947835‑3948133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |