New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4541345 = | 75 (0.850) | 8 (0.090) | 6/236 | NT | 9.6% | coding (18/1503 nt) | nhaB | Na(+)/H(+) antiporter NhaB |
? | NC_002947 | 4541382 = | 78 (0.920) | coding (55/1503 nt) | nhaB | Na(+)/H(+) antiporter NhaB |
AGGTTCATGACACCGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCCGGTTGCGACCGGCTGGGCACTGGTGCTCGAATTCATCTTCA > NC_002947/4541200‑4541490 | aGGTTCATGACACCGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGgcg > 1:439270/1‑150 (MQ=255) ggTTCATGACACCGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGgcgc > 2:2004245/1‑150 (MQ=255) tGACACCGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGc < 1:1769660/150‑1 (MQ=255) cacCGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCa < 1:2004245/150‑1 (MQ=255) acCTATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACTGGCGCCCTCGCCCAc < 1:406704/150‑1 (MQ=255) acCGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCCACCACCCGGCTGTGCGACTTGCCCAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCAc > 2:1892033/1‑150 (MQ=255) acCGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGCTTAGTATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCAc > 1:635456/1‑150 (MQ=255) acCGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCAc > 1:2207867/1‑150 (MQ=255) cGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATCTTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACgg < 2:149064/150‑1 (MQ=255) cGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACgg > 1:221976/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGc > 2:346173/1‑150 (MQ=255) aGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTgg > 1:1777085/1‑146 (MQ=255) aGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTgg < 2:1777085/146‑1 (MQ=255) ccgatctgCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGATGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGt < 1:1730300/143‑1 (MQ=255) ggccagggtgaagatgaattcgagcaccagtgcccagccggtcgcaaccgggccaatggttaccaacaacagcgggttgagcaccaaaaacaggcagatgaccaccttgtaccaaatCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTc > 1:1760189‑M1/118‑150 (MQ=255) ggCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGa < 1:32635/150‑1 (MQ=255) gtgaagatgaattcgagcaccagtgcccagccggtcgcaaccgggccaatggttaccaacaacagcgggttgagcaccaaaaacaggcagatgaccaccttgtaccaaatCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGAtt > 1:2250541‑M1/111‑150 (MQ=255) gCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAgg < 1:468799/150‑1 (MQ=255) 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aaaCGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTc < 2:54892/150‑1 (MQ=255) gtgACTGTGCGCCTTGCCCAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGGTTCCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGCCACGCCCCCTGACCGGTGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCt < 1:263479/148‑1 (MQ=255) cagtgcccagccggtcgcaaccgggccaatggttaccaacaacagcgggttgagcaccaaaaacaggcagatgaccaccttgtaccaaatCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTc < 2:907672‑M1/33‑1 (MQ=255) cagtgcccagccggtcgcaaccgggccaatggttaccaacaacagcgggttgagcaccaaaaacaggcagatgaccaccttgtaccaaatCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTc > 1:907672‑M1/91‑123 (MQ=255) cagtgcccagccggtcgcaaccgggccaatggttaccaacaacagcgggttgagcaccaaaaacaggcagatgaccaccttgtaccaaatCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTgg < 1:2038377‑M1/43‑1 (MQ=255) cagtgcccagccggtcgcaaccgggccaatggttaccaacaacagcgggttgagcaccaaaaacaggcagatgaccaccttgtaccaaatCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTgg > 2:2038377‑M1/91‑133 (MQ=255) 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ataAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTg > 1:547439/1‑93 (MQ=255) ataAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTTTTTTTGGTGCTCAACCCGCTgttgtt < 1:64368/123‑1 (MQ=255) ataAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTgttgtt > 2:64368/1‑123 (MQ=255) aGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGc < 1:1781186/104‑1 (MQ=255) aGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGc > 2:1781186/1‑104 (MQ=255) aGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCCGGTTGCGACCGGCTg < 1:1908716/150‑1 (MQ=255) aTACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCAc > 1:1738404/1‑43 (MQ=255) aTACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCAc < 2:1738404/43‑1 (MQ=255) 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ttATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCCGGTTGCGACCGGCTGGGCACTGGTGc < 2:1905063/150‑1 (MQ=255) tGTCACTCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCCGGTTGCGACCGGCTGGGCACTGGTGCTCg > 1:353929/1‑150 (MQ=255) aCGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCtgttgt > 1:2106758/1‑101 (MQ=255) aCGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCtgttgt < 2:2106758/101‑1 (MQ=255) cccTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCCGGTTGCGACCGGCTGGGCACTGGTGCTCGAATTCATCt > 2:1136730/1‑150 (MQ=255) ccTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCCGGTTGCGACCGGCTGGGCACTGGTGCTCGAATTCATCtt > 1:1218727/1‑150 (MQ=255) cTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCGTGGGGCGACCGGCTGGGCACTGGTGCTCGAATTCATCTTc > 1:1231961/1‑150 (MQ=255) tGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCCGGTTGCGACCGGCTGGGCACTGGTGCTCGAATTCATCTTCa < 2:2335665/150‑1 (MQ=255) tGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCCGGTTGCGACCGGCTGGGCACTGGTGCTCGAATTCATCTTCa < 1:2115560/150‑1 (MQ=255) | AGGTTCATGACACCGATGGTAACCCAGCCCAATGGCCGTACATGTGCCAAAAACGGGACTGTGCGCCTTGCCTAAGACGCGTATATCCGGCACCGTGCGCCATCGCTGAATTATAAGGATACATATTTATGTCACGCCCCCTGACCGGCGCCCTCGCCCACGGTTTTCTGGGCAAGTCGCCGATTTGGTACAAGGTGGTCATCTGCCTGTTTTTGGTGCTCAACCCGCTGTTGTTGGTAACCATTGGCCCGGTTGCGACCGGCTGGGCACTGGTGCTCGAATTCATCTTCA > NC_002947/4541200‑4541490 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |