| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4583538 | 76 (0.860) | 6 (0.080) | 5/206 | NT | 7.8% | intergenic (‑67/+104) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 4583599 | 79 (1.070) | intergenic (‑128/+43) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCA > NC_002947/4583393‑4583686 | tgcgCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCcg > 1:756000/4‑150 (MQ=255) aGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAg > 2:2258279/1‑150 (MQ=255) gCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGa < 2:257809/150‑1 (MQ=255) ggTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGa < 1:1567476/150‑1 (MQ=255) gTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGac > 1:811864/1‑150 (MQ=255) cGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACcgcagc < 1:1552648/150‑4 (MQ=255) cGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGAATGGACAGGGGCGACTGAGTGGAGGTGCGGGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGt > 1:1499142/1‑150 (MQ=255) gCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGc < 2:811864/150‑1 (MQ=255) gCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGc > 2:1810758/1‑150 (MQ=255) cGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGcc < 2:785639/150‑1 (MQ=255) gTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCg > 1:1435014/1‑150 (MQ=255) tCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGa < 1:844551/150‑1 (MQ=255) ccTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAg < 1:854351/150‑1 (MQ=255) cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGt > 1:757628/1‑143 (MQ=255) cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGt < 2:214519/143‑1 (MQ=255) cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGt < 2:757628/143‑1 (MQ=255) cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGt > 1:214519/1‑143 (MQ=255) cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAgg > 2:1177276/1‑150 (MQ=255) ttGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGt > 1:525113/1‑150 (MQ=255) ttGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGt < 1:2004825/150‑1 (MQ=255) aCCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCAt < 1:2260166/150‑1 (MQ=255) aCCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCAt < 1:2044406/150‑1 (MQ=255) ccACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATg > 1:1643526/1‑150 (MQ=255) ccACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATg > 1:369385/1‑150 (MQ=255) cacaGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGt < 1:2002146/136‑1 (MQ=255) cacaGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGt > 2:2002146/1‑136 (MQ=255) cacaGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATgg > 2:1761343/1‑150 (MQ=255) aGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCAc > 2:2250572/1‑150 (MQ=255) aGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCAc < 1:1761343/150‑1 (MQ=255) ggTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGc < 2:347693/150‑1 (MQ=255) tcgATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGc > 1:836011/1‑150 (MQ=255) gATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCg < 2:47571/150‑1 (MQ=255) gATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCg < 2:48372/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcg < 2:2192319‑M1/150‑58 (MQ=255) tGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTc‑gcg > 1:963093/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCAcc > 1:1883418/1‑129 (MQ=255) ggcgggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGACCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaa < 2:576‑M1/150‑65 (MQ=255) cgggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaac > 2:756000‑M2/1‑145 (MQ=255) cgggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaac > 2:772480‑M2/1‑145 (MQ=255) gggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCgg < 1:165880/143‑1 (MQ=255) gggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCgg > 2:165880/1‑143 (MQ=255) ggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaaccc < 2:1835940‑M2/150‑8 (MQ=255) gAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:873038/1‑89 (MQ=255) gAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:873038/89‑1 (MQ=255) gAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccg < 2:1111199‑M2/150‑9 (MQ=255) aaCGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgc > 1:1584332‑M2/1‑141 (MQ=255) aaCGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgc < 1:2079731‑M2/150‑10 (MQ=255) ttGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctccta > 2:859559‑M2/1‑136 (MQ=255) gCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctcctacgg > 1:1835940‑M2/1‑133 (MQ=255) aTGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctcctacggggg > 2:1616588‑M2/1‑130 (MQ=255) gtgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGGACATCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑ggggggg > 1:149357/1‑150 (MQ=255) gcgcCTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑ggggggggg < 1:2080918/150‑1 (MQ=255) cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATGCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGGGCATGGCACCGGCGTCGCCGGTACTC‑GCGCGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGcaccg > 2:1396735/1‑148 (MQ=255) cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgg > 1:923497‑M1/1‑58 (MQ=255) cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑ggggggggggggcaca > 1:1480553/1‑145 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgg > 1:1508637‑M1/1‑57 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGt < 1:675466/87‑1 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGa < 1:261614/67‑1 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGt > 2:675466/1‑87 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGt > 1:413153/1‑150 (MQ=255) ttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTc < 2:369385/150‑1 (MQ=255) tCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCt > 1:99358/1‑150 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGGACAGTCTgg > 1:240784/1‑149 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAggcgga > 2:1023299/1‑145 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGACCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACGGGCTTCGCGGGTGTTC‑GCGGATAATCCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGaa < 2:671690/150‑1 (MQ=255) aTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAACCCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGaa < 1:521160/150‑1 (MQ=255) aTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGaa < 1:2258279/150‑1 (MQ=255) ttGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAACCCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAAc < 2:1435014/150‑1 (MQ=255) ttGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGGACAGTCTGAAc > 1:2268869/1‑150 (MQ=255) atgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgc > 1:2336358‑M2/1‑108 (MQ=255) atgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgc < 2:2336358‑M2/117‑10 (MQ=255) atgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTg > 2:1857757/1‑150 (MQ=255) cacaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCGGCTTGTC‑GCGGATAAACCCGCGCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTa > 1:25463/1‑150 (MQ=255) aGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGc < 1:115719/73‑1 (MQ=255) aGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGc > 2:115719/1‑73 (MQ=255) gACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAACCCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACgg < 2:253030/150‑1 (MQ=255) aTCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCtt > 1:971318/1‑150 (MQ=255) ccccGACCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCTCAAAGATGACACCGCGGTGCCAAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGTATAAACCCGCTCCTCC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATgc < 2:525113/147‑1 (MQ=38) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATgcgc > 1:2358074/1‑150 (MQ=255) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAAACCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATgcgc > 1:1837363/1‑150 (MQ=255) gATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgg < 1:1839162‑M1/83‑61 (MQ=255) gATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgg > 2:1839162‑M1/1‑23 (MQ=255) tCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAg > 2:1740023/1‑150 (MQ=255) tCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTGACGGGCTTTTTCGATGCCCCAGa > 2:375182/1‑150 (MQ=255) cccccGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacat > 2:1616588‑M1/1‑20 (MQ=255) ccccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTGCGATGCGccgggtg > 2:1947748/1‑145 (MQ=255) cccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGGTTTTTTGATGCGCCAgctcc > 2:843650/1‑146 (MQ=255) cccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCCAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGc < 1:1111199/150‑1 (MQ=255) ccGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggc > 1:1835940‑M1/1‑17 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaa > 2:859559‑M1/1‑14 (MQ=255) gCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgtt < 1:2079731‑M1/150‑142 (MQ=255) gCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcat < 2:2336358‑M1/117‑109 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGGGCCAGATTCCGAACGGCa > 2:1043723/1‑150 (MQ=255) gggggTTACCCGGGAAAGAGACCCCGGGGGGCCGGGGGGCATGGCCCCGGCTT‑TCCGGGGTTCTGGGGAAAAACCCCGTCCCTC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTCGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAg < 1:1746934/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttc < 2:1111199‑M1/150‑143 (MQ=255) cGGGTTTACCCGGGAAGAGGACCCCGCGGTGCCGAGGTGCCGGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAg < 1:1177276/150‑1 (MQ=39) gggTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcc < 2:1835940‑M1/150‑144 (MQ=255) gTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccg > 2:772480‑M1/1‑5 (MQ=255) ttACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctcctacggggggtcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcc < 2:576‑M2/150‑87 (MQ=255) tACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCa < 2:100317/150‑1 (MQ=255) | TGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCA > NC_002947/4583393‑4583686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |