New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4583538 | 76 (0.860) | 6 (0.080) | 5/206 | NT | 7.8% | intergenic (‑67/+104) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | NC_002947 | = 4583599 | 79 (1.070) | intergenic (‑128/+43) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAG > NC_002947/4583455‑4583746 | cgggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaac > 2:756000‑M2/1‑145 (MQ=255) cgggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaac > 2:772480‑M2/1‑145 (MQ=255) ggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaaccc < 2:1835940‑M2/150‑8 (MQ=255) aaCGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgc > 1:1584332‑M2/1‑141 (MQ=255) aaCGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgc < 1:2079731‑M2/150‑10 (MQ=255) ttGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctccta > 2:859559‑M2/1‑136 (MQ=255) gCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctcctacgg > 1:1835940‑M2/1‑133 (MQ=255) aTGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctcctacggggg > 2:1616588‑M2/1‑130 (MQ=255) gtgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGGACATCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑ggggggg > 1:149357/1‑150 (MQ=255) gcgcCTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑ggggggggg < 1:2080918/150‑1 (MQ=255) cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATGCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGGGCATGGCACCGGCGTCGCCGGTACTC‑GCGCGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGcaccg > 2:1396735/1‑148 (MQ=255) cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑ggggggggggggcaca > 1:1480553/1‑145 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGt > 1:413153/1‑150 (MQ=255) ttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTc < 2:369385/150‑1 (MQ=255) tCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCt > 1:99358/1‑150 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGGACAGTCTgg > 1:240784/1‑149 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAggcgga > 2:1023299/1‑145 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGACCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACGGGCTTCGCGGGTGTTC‑GCGGATAATCCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGaa < 2:671690/150‑1 (MQ=255) aTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAACCCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGaa < 1:521160/150‑1 (MQ=255) aTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGaa < 1:2258279/150‑1 (MQ=255) ttGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAACCCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAAc < 2:1435014/150‑1 (MQ=255) ttGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGGACAGTCTGAAc > 1:2268869/1‑150 (MQ=255) atgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgc < 2:2336358‑M2/117‑10 (MQ=255) atgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgc > 1:2336358‑M2/1‑108 (MQ=255) atgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTg > 2:1857757/1‑150 (MQ=255) cacaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCGGCTTGTC‑GCGGATAAACCCGCGCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTa > 1:25463/1‑150 (MQ=255) gACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAACCCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACgg < 2:253030/150‑1 (MQ=255) aTCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCtt > 1:971318/1‑150 (MQ=255) ccccGACCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCTCAAAGATGACACCGCGGTGCCAAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGTATAAACCCGCTCCTCC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATgc < 2:525113/147‑1 (MQ=38) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATgcgc > 1:2358074/1‑150 (MQ=255) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAAACCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATgcgc > 1:1837363/1‑150 (MQ=255) tCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTGACGGGCTTTTTCGATGCCCCAGa > 2:375182/1‑150 (MQ=255) ccccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTGCGATGCGccgggtg > 2:1947748/1‑145 (MQ=255) cccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGGTTTTTTGATGCGCCAgctcc > 2:843650/1‑146 (MQ=255) cccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCCAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGc < 1:1111199/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGGGCCAGATTCCG‑AACGGCa > 2:1043723/1‑150 (MQ=255) gggggTTACCCGGGAAAGAGACCCCGGGGGGCCGGGGGGCATGGCCCCGGCTT‑TCCGGGGTTCTGGGGAAAAACCCCGTCCCTC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTCGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAg < 1:1746934/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTACCCGGGAAGAGGACCCCGCGGTGCCGAGGTGCCGGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAg < 1:1177276/150‑1 (MQ=39) ttACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCCCCGGCTTCGCCGGTGTTG‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGTGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGcc < 1:1947748/150‑1 (MQ=255) ttACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctcctacggggggtcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcc < 2:576‑M2/150‑87 (MQ=255) tACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGCCa < 2:100317/150‑1 (MQ=255) ttgcgcgAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACAGCCTGAAACTTGTTAAAGGGCTTTTTCGCAGCGGCCGATTCCG‑AACCGCAGGTGCCa > 1:1289635/4‑150 (MQ=37) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaag < 2:923497‑M2/118‑59 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaag > 1:923497‑M2/1‑60 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaa < 2:1508637‑M2/117‑58 (MQ=255) 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ccGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCACATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTgg > 2:1492550/1‑150 (MQ=255) ggTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGcc > 1:406590/1‑150 (MQ=255) ggTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGcc > 1:1587273/1‑150 (MQ=255) gtgtTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCg < 2:1587273/150‑1 (MQ=255) gtgtTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGt < 1:127093/150‑1 (MQ=255) 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ggATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAg < 1:329947/150‑1 (MQ=255) | CGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTC‑GCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCG‑AACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAG > NC_002947/4583455‑4583746 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |