New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 4773394 = | 89 (1.050) | coding (5918/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
GCACCATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGT > NC_002947/4773200‑4773493 | gtgcccgatccggtcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaa > 2:385634‑M1/150‑150 (MQ=255) aCCATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGc < 2:483537/150‑1 (MQ=255) cccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGca < 2:2073933‑M1/4‑1 (MQ=255) cccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgaccaggttcttcgttgtcttgacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGca > 2:2132620‑M1/147‑150 (MQ=255) ccATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGca > 1:2386118/1‑150 (MQ=255) cATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcac > 1:357948/1‑150 (MQ=255) cATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcac > 1:580423/1‑150 (MQ=255) cATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcac < 2:526144/150‑1 (MQ=255) cATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcac > 1:1102297/1‑150 (MQ=255) aaTCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTg > 1:2236780/1‑150 (MQ=255) ttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGCACCACTGCCt < 2:83014‑M1/13‑1 (MQ=255) ggCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCAGCCAGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTcg < 1:293842/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCCTGACCGAGGAAATGAGGTAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTcgc > 1:1531395/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCacac > 1:178639/1‑150 (MQ=255) cttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTc > 1:1895240/1‑150 (MQ=255) ttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATa > 1:468052/1‑123 (MQ=255) ttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATa < 2:468052/123‑1 (MQ=255) gcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCgg > 2:1735974/1‑150 (MQ=255) ccGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCggg < 2:178639/150‑1 (MQ=255) ctcTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCa < 2:1771494/72‑1 (MQ=255) cGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCa > 1:1771494/1‑74 (MQ=255) cGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGc > 1:793872/1‑150 (MQ=255) cGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGc < 2:1959420/150‑1 (MQ=255) cTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGa < 1:401231/150‑1 (MQ=255) cGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATa < 2:122223/150‑1 (MQ=255) gggCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATcaca > 1:446620/1‑135 (MQ=255) gggCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATcaca < 2:446620/135‑1 (MQ=255) gggCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCCTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGt > 1:1624444/1‑150 (MQ=255) | GCACCATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGT > NC_002947/4773200‑4773493 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |