| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 4773394 = | 89 (1.050) | coding (5918/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAC > NC_002947/4773246‑4773542 | gcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTc > 2:652934‑M1/104‑150 (MQ=255)cTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTGGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTc < 2:1689373/150‑1 (MQ=255) cACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGa < 2:2386118/150‑1 (MQ=255) aCGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACAGAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAt < 2:1531395/150‑1 (MQ=255) gCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAtct < 1:1128509/150‑1 (MQ=255) aGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCa < 2:1102297/150‑1 (MQ=255) gCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTc > 1:345607/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATa > 2:401231/1‑150 (MQ=255) 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ctcTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACGCCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCa < 2:45395/148‑1 (MQ=255) gCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATAAGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCAt > 2:2365249/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCg > 1:1828646/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGAAGAGACTTTTTACCTGGTGGACGATACTGCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCAtag > 1:45395/1‑148 (MQ=255) cGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGa > 2:1074184/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATAAGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGaa < 1:2365249/150‑1 (MQ=255) aggcagtggtgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGaa < 2:83014‑M2/137‑1 (MQ=255) gCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAAc < 1:380947/150‑1 (MQ=255) ccAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACg > 2:902898/1‑150 (MQ=255) aGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGa > 2:2327507/1‑150 (MQ=255) cGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCg < 1:1074184/150‑1 (MQ=255) tgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGc < 1:670737‑M2/129‑1 (MQ=255) tgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGc > 2:670737‑M2/5‑133 (MQ=255) tgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCggg < 2:2073933‑M2/146‑1 (MQ=255) tgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCAAGACAACGAAGAACCTGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCggg > 2:2132620‑M2/5‑150 (MQ=255) | CTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAC > NC_002947/4773246‑4773542 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |