New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ATGGCGCGCATCGTGCCCTTCACTCAGCGCAGCTTCTTGATACGTTCGCTGGGGCTGATCACGTCGGTCAGGCGGATGCCGAACTTTTCGTTGACCACGACCACTTCGCCATGGGCGATCAGCGTGCCGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAGGATCACGTCCAGGTTCGGGCCTTCGAGGCTGA > NC_002947/4948882‑4949176 | aTGGCGCGCATCGTGCCCTTCACTCAGCGCAGCTTCTTGATACGTTCGCTGGGGCTGATCACGTCGGTCAGGCGGATGCCGAACTTTTCGTTGACCACGACCACTTCGCCATGGGCGATCAGCGTGCCGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGc < 1:1724919/150‑1 (MQ=255) gcgcATCGTGCCCTTCACTCAGCGCAGCTTCTTGATACGTTCGCTGGGGCTGATCACGTCGGTCAGGCGGATGCCGAACTTTTCGTTGACCACGACCACTTCGCCATGGGCGATCAGCGTGCCGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGcc > 1:1831800/1‑150 (MQ=255) gcgcATCGTGCCCTTCACTCAGCGCAGCTTCTTGATACGTTCGCTGGGGCTGATCACGTCGGTCAGGCGGATGCCGAACTTTTCGTTGACCACGACCACTTCGCCATGGGCGATCAGCGTGCCGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGcc > 1:1812721/1‑150 (MQ=255) 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2:1698770/1‑77 (MQ=255) tGGGCGATCAGCGTGCCGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTg < 1:1698770/77‑1 (MQ=255) ggCGATCAGCGTGCCGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑Gggctcgccggccaggcggtcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagc > 1:390228‑M1/1‑34 (MQ=255) ggCGATCAGCGTGCCGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAg < 1:862153/150‑1 (MQ=255) cGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCgg < 1:1988694/127‑1 (MQ=255) cGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCgg > 2:1988694/1‑127 (MQ=255) cGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAGGATCACGTCCAGGt > 1:332092/1‑150 (MQ=255) gTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATgg > 1:1774097/1‑113 (MQ=255) gTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAGGATCACGTCCAGGtt < 2:1994715/150‑1 (MQ=255) gACCAGCACGTCGAGCGGCtcgccggccaggcggtcgagccgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagcgaacgtat < 1:1865560‑M1/149‑131 (MQ=255) gACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAGGATCACGTCCAGGTTCgg < 1:268631/150‑1 (MQ=255) gACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAGGATCACGTCCAGGTTCgg < 1:2197218/150‑1 (MQ=255) gACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGGCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGGTGCGGATGTTGATCTCGGTGCGGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCCAGGTGTCCAGGATCACGTCCAGGTTCgg < 1:65438/150‑1 (MQ=255) aCCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAGGATCACGTCCAGGTTCggg > 1:1033834/1‑150 (MQ=255) cAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAGGATCACGTCCAGGTTCGGGcc > 1:1507500/1‑150 (MQ=255) gCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtg > 1:1783152‑M2/1‑33 (MQ=255) gCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtg < 2:1783152‑M2/85‑53 (MQ=255) gCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCgg > 2:1518710/1‑87 (MQ=255) gCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCgg < 1:1518710/87‑1 (MQ=255) cACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagcgaa > 2:1208818‑M2/1‑32 (MQ=255) cACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagcgaa < 1:1208818‑M2/135‑104 (MQ=255) cACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAcgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagcgaacgtatcaagaagctgcgctga > 2:390228‑M2/1‑32 (MQ=255) tCGA‑‑‑TCTGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGTGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAGGATCACGTCCAGGTTCGGGCCTTCGAgg < 1:941452/150‑1 (MQ=255) tCGA‑‑‑GCtcgaccgcctggccggcgagccgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagcgaacgtatcaagaagctgcgct < 2:724556‑M1/150‑145 (MQ=255) gA‑‑‑GCtcgaccgcctggccggcgagccgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagcgaacgtatcaagaagctgcgctga > 1:248201‑M1/1‑4 (MQ=255) gA‑‑‑GCtcgaccgcctggccggcgagccgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagcgaacgtatcaagaagctgcgctga < 1:1356528‑M1/150‑147 (MQ=255) gA‑‑‑GCtcgaccgcctggccggcgagccgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggcgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagcgaacgtatcaagaagctgcgctga < 1:192503‑M1/150‑147 (MQ=255) gCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAgccgctcgacgtgctggtcaacggcacgctgatcgcccatggtgaagtggtcgtggtcaacgaaaagttcggcatccgcctgaccgacgtgatcagccccagcgaacgtatcaagaagctgcgctg < 2:2044613‑M2/150‑127 (MQ=255) | ATGGCGCGCATCGTGCCCTTCACTCAGCGCAGCTTCTTGATACGTTCGCTGGGGCTGATCACGTCGGTCAGGCGGATGCCGAACTTTTCGTTGACCACGACCACTTCGCCATGGGCGATCAGCGTGCCGTTGACCAGCACGTCGA‑‑‑GCGGCTCGCCGGCCAGGCGGTCGAGCTCGATCACCGAGCCCTGGTTGAGCTGCAGCAGGTTGCGGATGTTGATCTCGGTGCTGCCCACTTCCATGGAAATGTTCACCGGGATGTCCAGGATCACGTCCAGGTTCGGGCCTTCGAGGCTGA > NC_002947/4948882‑4949176 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |