| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ATGGCCTTCCTCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGCACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGCACATTCTTGCCTT > NC_002947/4955717‑4956015 | gcattgccgagtacttccgcgacaaaggcaagaatgtgctgttgctgatggactcgttgacccgtttcgcccaggcccagcgggaaattgccctggccatcggcgagccgccagccacccggggttacccgccctcggtgttcgccaagc < 1:2249424‑M1/1‑1 (MQ=255)aTGGCCTTCCTCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGCACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATtgcc < 1:2231209/150‑1 (MQ=255) tGGCCTTCCTCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGCACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATtgcct > 1:2305419/1‑150 (MQ=255) 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accaccGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACgg < 2:2183889/136‑1 (MQ=255) accaccGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACgg > 1:2183889/1‑136 (MQ=255) accaccGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCAt < 2:1447669/150‑1 (MQ=255) ccaccGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATc < 2:1757918/150‑1 (MQ=255) ccaccGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATc < 1:2160683/150‑1 (MQ=255) caccGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCa < 1:1753033/150‑1 (MQ=255) caccGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGCGTGGGTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCa < 2:1665471/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGca < 1:1047288/150‑1 (MQ=255) tCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGcaca < 1:1659308/150‑1 (MQ=255) ccATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGCACATTc < 2:1469769/150‑1 (MQ=255) ccATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGCACATTc < 2:1612641/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGCACATTCtt < 1:489980/150‑1 (MQ=255) tgcctgccCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGCACATTCTTGc < 1:2327518/150‑1 (MQ=255) CTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGt > 1:311277‑M1/1‑123 (MQ=255) CTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGt < 2:311277‑M1/123‑1 (MQ=255) CTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCACGGGTGGCTGGCGGATCGCCGATGGGCAGGACAATTTACCGCTGGGCGTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTGCATAGGCAACAGGACATTCttgcatt < 2:447942‑M1/150‑4 (MQ=255) | ATGGCCTTCCTCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGCACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGAACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGCACATTCTTGCCTT > NC_002947/4955717‑4956015 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |