| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5277534 | 113 (1.280) | 8 (0.090) | 7/242 | NT | 6.9% | coding (447/1221 nt) | PP_4652 | membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 5277572 | 106 (1.220) | coding (485/1221 nt) | PP_4652 | membrane protein | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
GCCACCGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCA > NC_002947/5277385‑5277683 | gCCACCGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCG < 2:2165279‑M1/150‑1 (MQ=255) cACCGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCTCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGtcggcctcggc > 2:2108400/1‑150 (MQ=255) cGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCAc > 2:2118653/1‑150 (MQ=255) cGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCAc > 1:1684393/1‑150 (MQ=255) gACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCAcc > 1:2155098/1‑150 (MQ=255) aCAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTACTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCAccc > 1:116295/1‑150 (MQ=255) aaCGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAg > 2:1363867/1‑150 (MQ=255) cGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTc < 1:1865046/150‑1 (MQ=255) cGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGAGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTc > 1:897822/1‑150 (MQ=255) gTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTACCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGGCg > 1:1013625/1‑150 (MQ=255) cccGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCAAGTCGGCGa < 2:454498/150‑1 (MQ=255) ccGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGAc > 1:766196/1‑150 (MQ=255) cTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTg < 1:2005864/150‑1 (MQ=255) cTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAGATGCCGGCAACCCAGGCGTTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGcc < 1:592234/150‑1 (MQ=255) cTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGcc > 1:1006175/1‑150 (MQ=255) tttGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCATCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCAGCCCGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGGCTGCCTCGGCCACCCAGCCCGCGACCATCCGGGCCCcg > 2:592234/1‑150 (MQ=255) gCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCcggcg < 2:1586070/150‑1 (MQ=255) tctGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTCGCGGCGTCCGCCGCGcccaccgccggcgccacgatgctcgcccactgggt > 2:1353219‑M1/1‑115 (MQ=255) ctGGCCTTCCTACTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTg < 2:116295/150‑1 (MQ=255) tGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTgg < 2:1670049/150‑1 (MQ=255) gCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGc > 2:784304‑M2/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGCCCACCCAGTCGGGGACCAGCGTGGCGCCGGTGGTgggg > 1:1187612/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCACGCGTCGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggcc < 1:1353219‑M1/150‑40 (MQ=255) gCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCAAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGc < 2:2335080‑M2/150‑2 (MQ=255) cTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCgg > 1:997668/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGTCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTg < 1:2224369/132‑1 (MQ=255) ttCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggccgag < 2:735815‑M1/150‑43 (MQ=255) ttCCTGCACGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAAGGTGGTACAGCGCCTTCGGGTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggccgag < 2:195941‑M1/150‑43 (MQ=255) 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< 2:1684393/150‑1 (MQ=255) ttCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGgccacccagtcggcgccacgatggtcgccgactggg > 2:480094‑M1/1‑84 (MQ=255) ttCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCAtg > 1:2079353/1‑150 (MQ=255) gAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggccgaggccgacgccgc > 1:616771‑M1/1‑81 (MQ=255) gAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggccgaggccgacgccgc < 2:616771‑M1/134‑54 (MQ=255) gAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTgg > 2:278057/1‑150 (MQ=255) 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1:665775/1‑150 (MQ=255) ttCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCAGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTTGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCATGCTGAGCCtc > 2:867010/1‑149 (MQ=255) ccGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTgg > 1:760578/1‑52 (MQ=255) ccGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTgg < 2:760578/52‑1 (MQ=255) ccGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGc > 1:1049655/1‑150 (MQ=255) ccGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGc > 1:383628/1‑150 (MQ=255) ccGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGc > 2:744822/1‑150 (MQ=255) cgcgGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGgca > 2:1219978/1‑87 (MQ=255) gcgGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCCCCCACTCCGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCt < 2:1398207/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCa > 2:1790204/1‑150 (MQ=255) ggCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCa > 1:1218340/1‑150 (MQ=255) gCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAg < 1:1589593/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAg < 2:665775/150‑1 (MQ=255) aGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGgt > 2:49284/1‑90 (MQ=255) aGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGgt < 1:49284/90‑1 (MQ=255) cggcgTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGcgcgcg < 2:2155098/150‑1 (MQ=255) cggcgTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACAGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGcgcgcg < 1:449158/150‑1 (MQ=255) cgTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGcc < 2:306248/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCa < 2:1218340/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCAGACGGTGGCCGTGTACGCGCTTGCCTGCGCGCTGACCCTGCGCCCGCAGCCGCGCGGccc > 2:570006/1‑149 (MQ=255) tcggcctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAg > 1:21767/1‑150 (MQ=255) ccggcctctgccACCCAGTCGGCGCCCCTCGTGGCGCCGGCGGTGGGCCGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTTACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAg < 2:1187612/149‑1 (MQ=255) ggcctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGACTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGt < 1:2108400/150‑1 (MQ=255) cctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTg > 1:1688461/1‑92 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggacccgaaggcgctgtaccaccttgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgtgcaggaa < 2:195941‑M2/150‑109 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGgcgc > 2:1778531/1‑137 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGc > 2:2221365/1‑150 (MQ=255) ggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacgacgcgtgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaaggc < 1:1353219‑M2/150‑112 (MQ=255) gcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggccgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaaggc > 2:784304‑M1/1‑1 (MQ=255) gcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggccgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaaggc > 2:892998‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCCACCGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCA > NC_002947/5277385‑5277683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |