| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 5277534 | 113 (1.280) | 8 (0.090) | 7/242 | NT | 6.9% | coding (447/1221 nt) | PP_4652 | membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 5277572 | 106 (1.220) | coding (485/1221 nt) | PP_4652 | membrane protein | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGAATCGCTGCTGGCTGG > NC_002947/5277424‑5277719 | gCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGc > 2:892998‑M2/1‑149 (MQ=255)gCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGc > 2:784304‑M2/1‑149 (MQ=255)gCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCAAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGc < 2:2335080‑M2/150‑2 (MQ=255) cTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCgg > 1:997668/1‑150 (MQ=255) tGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTcc > 2:2373932/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTACTGGCT‑GGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCt < 1:1376794/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCt < 1:2045705/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCt < 2:2190967/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCAGCCGCTCATTCGAACTGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTa < 2:17664/150‑1 (MQ=255) ggCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTAt < 1:2118653/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCtt < 1:8492/150‑1 (MQ=255) aGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCttt < 1:88282/150‑1 (MQ=255) gCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGAGGCCGAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTg > 1:1398207/1‑150 (MQ=255) ccGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTgg > 2:449158/1‑150 (MQ=255) aTTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCAt < 2:1684393/150‑1 (MQ=255) ttCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCAt > 1:1254566/1‑149 (MQ=255) gAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTgg > 2:474784/1‑150 (MQ=255) aaaTGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTggg > 2:1760430/1‑150 (MQ=255) 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ggcctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGACTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGt < 1:2108400/150‑1 (MQ=255) cctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTg > 1:1688461/1‑92 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggacccgaaggcgctgtaccaccttgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgtgcaggaa < 2:195941‑M2/150‑109 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaa < 2:735815‑M2/150‑109 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGcc < 1:418594/94‑1 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGcc > 2:418594/1‑94 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGgcgc < 1:1778531/137‑1 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGgcgc > 2:1778531/1‑137 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGc > 2:2221365/1‑150 (MQ=255) ggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacgacgcgtgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaaggc < 1:1353219‑M2/150‑112 (MQ=255) ccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTGCGCCCCGAAGGTCGCCTTGTTCGCCATTGCATGCGTGCTGACCCGGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAgc < 1:1148052/150‑1 (MQ=255) aCCCAGTGGGCGAGCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgcggcggacgccgcgactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaaggccaga > 2:1353219‑M2/1‑35 (MQ=255) ccAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCgg > 1:548156/1‑150 (MQ=255) cGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCa < 1:2335080/150‑1 (MQ=255) cGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTAAGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCa < 2:2079353/150‑1 (MQ=255) gACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAg < 2:1049655/150‑1 (MQ=255) gACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAg > 1:1463653/1‑150 (MQ=255) gACCATCGTGGCGCCAGCGTGGGGCGGATTCCTGTCTGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAg > 1:1891610/1‑150 (MQ=255) ccATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCa < 2:548156/150‑1 (MQ=255) aTCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATc > 2:2292486/1‑150 (MQ=255) tCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGc > 1:1087466/1‑85 (MQ=255) gcggTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGAATCGctgctg < 1:2040229/150‑1 (MQ=255) gggCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGAATCGCTGctggctgg < 1:2142811/150‑1 (MQ=255) | GCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGT‑CGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGAATCGCTGCTGGCTGG > NC_002947/5277424‑5277719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |