| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 6137641 | 97 (1.140) | coding (40/1254 nt) | czcC | CzcC family metal RND transporter outer membrane protein | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTC > NC_002947/6137486‑6137777 | gATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGAtgc < 2:2293041/150‑1 (MQ=255) tCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCCCCCATTCAGGGCGGAtgctt < 2:784333/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGAtgcttgct < 1:747131/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTtgctg > 1:1030097/1‑150 (MQ=255) gcCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccgc < 1:2124796‑M2/150‑5 (MQ=255) gcCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccgc < 2:2183506‑M2/150‑5 (MQ=255) gcCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTACTGccgc < 2:2184471‑M2/150‑5 (MQ=255) cccTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccgcc < 1:955658‑M2/150‑6 (MQ=255) ctcctcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCtt < 1:2183506/150‑1 (MQ=255) ctcctcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGCTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGcagcaagcatccgcc > 1:2253105‑M1/1‑133 (MQ=255) tcctcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCGATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCttt > 2:66318/1‑149 (MQ=255) tcctcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTg < 2:1571766/150‑1 (MQ=255) tcctcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTg > 2:54011/1‑150 (MQ=255) 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ccATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAAATCGCAAGATCGTTGTGTTGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgc > 2:2373093/1‑150 (MQ=255) ccATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTGGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgc > 2:1686737/1‑150 (MQ=255) cATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagc < 2:1240837‑M2/78‑57 (MQ=255) cATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgcg < 1:546359/150‑1 (MQ=255) cATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgcg > 1:388839/1‑150 (MQ=255) aTTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgcgc < 1:193153/150‑1 (MQ=255) ttCAGGGCGGATGCTTGCTGccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagcgcacaggcgcgtgtcatcgttca < 1:1575501‑M2/99‑80 (MQ=255) ttCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTc > 2:138288/1‑119 (MQ=255) ttCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTc < 1:138288/119‑1 (MQ=255) tCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgcgcgc < 1:53204/150‑1 (MQ=255) agggggcagcaagcatccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagcgcacaggcgcgtgtcatcgttcagccgccgaggcagaacaatggtgtgagttttacgaaggaatcaggcgcgaggagg < 2:775242‑M1/146‑145 (MQ=255) ggCGGATGCTTGCTGccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagcgcacaggcgcgtgtcatcgttcagccgccgaggcagagcaatggtgtgagttttacgaaggaatcaggcgcgaggag < 2:2253105‑M2/148‑134 (MQ=255) gcggcagcaagcatccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagcgcacaggcgcgtgtcatcgttcagccgccgaggcagaacaatggtgtgagttttacgaaggaatcaggcgcgaggagggc < 2:2183506‑M1/150‑147 (MQ=255) | GATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTC > NC_002947/6137486‑6137777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |