| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 6137631 | 106 (1.200) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 5.7% | coding (30/1254 nt) | czcC | CzcC family metal RND transporter outer membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 6137641 | 97 (1.140) | coding (40/1254 nt) | czcC | CzcC family metal RND transporter outer membrane protein | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGTTGTGCCAGCG > NC_002947/6137492‑6137790 | tGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTtgctg > 1:1030097/1‑150 (MQ=255) gcCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccgc < 1:2124796‑M2/150‑5 (MQ=255) gcCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccgc < 2:2183506‑M2/150‑5 (MQ=255) gcCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTACTGccgc < 2:2184471‑M2/150‑5 (MQ=255) cccTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccgcc < 1:955658‑M2/150‑6 (MQ=255) cctcctCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccccct < 2:775242‑M2/150‑7 (MQ=255) ctcctcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCtt < 1:2183506/150‑1 (MQ=255) tcctcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTg < 2:1571766/150‑1 (MQ=255) tcctcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTg > 2:54011/1‑150 (MQ=255) ggagggcgcCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTg < 2:482014/145‑1 (MQ=255) tcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCtt > 2:1784421/1‑146 (MQ=255) tcGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCtt < 1:1784421/146‑1 (MQ=255) cgcgCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTAc < 1:54011/150‑1 (MQ=255) cTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCctg < 2:2124796/150‑1 (MQ=255) cTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCCATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCctg > 1:52006/1‑150 (MQ=255) ttCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCtgctgc < 1:1645369/150‑1 (MQ=255) gTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCTgcgcc > 2:1005910/1‑149 (MQ=255) tAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTa > 2:689865/1‑150 (MQ=255) 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ggcTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGa < 2:1616114/150‑1 (MQ=255) tGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGa > 1:646607/1‑150 (MQ=255) gATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATgcgc < 2:1970952/150‑1 (MQ=255) gATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATgcgc > 1:2240904/1‑150 (MQ=255) aTGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCt > 1:863451/1‑150 (MQ=255) 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ccATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTGGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgc > 2:1686737/1‑150 (MQ=255) ccATTCAGGGCGGATGCTTGCTGACGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACCCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgc < 1:775242/150‑1 (MQ=255) cATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagc > 1:1240837‑M2/1‑22 (MQ=255) cATTCAGGGCGGATGCTTGCTGccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagc < 2:1240837‑M2/78‑57 (MQ=255) cATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgcg < 1:546359/150‑1 (MQ=255) cATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAgcg > 1:388839/1‑150 (MQ=255) ttCAGGGCGGATGCTTGCTGccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagcgcacaggcgcgtgtcatcgttca < 1:1575501‑M2/99‑80 (MQ=255) ttCAGGGCGGATGCTTGCTGccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagcgcacaggcgcgtgtcatcgttca > 2:1575501‑M2/1‑20 (MQ=255) ttCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTc > 2:138288/1‑119 (MQ=255) ttCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTc < 1:138288/119‑1 (MQ=255) ggCGGATGCTTGCTGccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagcgcacaggcgcgtgtcatcgttcagccgccgaggcagagcaatggtgtgagttttacgaaggaatcaggcgcgaggag < 2:2253105‑M2/148‑134 (MQ=255) ggCGGATGCTTGCTGccgccctgaatgggagcataggggagtcatggagatgattcctcgaaaaaaccagcgcacaggcgcgtgtcatcgttcagccgccgaggcagagcaatggtgtgagttttacgaaggaatcaggcgcgaggag > 1:2253105‑M2/1‑15 (MQ=255) aTGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGtt < 2:1604127/150‑1 (MQ=255) aTGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGtt < 2:1517837/150‑1 (MQ=255) gcttgctGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGTtgt < 1:142356/150‑1 (MQ=255) cttgctGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGTtgtg < 1:1026088/150‑1 (MQ=255) ttgctGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGc < 1:824535/124‑1 (MQ=255) ttgctGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGc > 2:824535/1‑124 (MQ=255) ttgctGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGTTGTGc > 1:1305069/1‑150 (MQ=255) ttgctGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGTTGTGc > 2:1857738/1‑150 (MQ=255) gctgcCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGTTGTGCCa > 1:2392191/1‑150 (MQ=255) gccgccTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGTTGTGCCAGCg < 1:1857738/150‑1 (MQ=255) | TGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTCTGGACGATGCGCTGCAACTCGCCGAGCGCAACGCACCTTCGCTTCAAGCACGCCAGGAGCAGGCGTCCGCAGCGCGCCACTCAGTTGTGCCAGCG > NC_002947/6137492‑6137790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |