New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1583554 | 93 (1.050) | 6 (0.070) | 6/234 | NT | 6.1% | intergenic (+68/+50) | ttgR/PP_1388 | HTH‑type transcriptional regulator TtgR/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
? | NC_002947 | = 1583575 | 95 (1.130) | intergenic (+89/+29) | ttgR/PP_1388 | HTH‑type transcriptional regulator TtgR/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGCCCCTGCGTCCCC > NC_002947/1583427‑1583724 | gAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAg < 1:1148012‑M2/150‑2 (MQ=255) cGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGc > 2:238445/1‑150 (MQ=255) acCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAgg < 1:1015267‑M2/136‑3 (MQ=255) acCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAgg > 2:1015267‑M2/1‑134 (MQ=255) gCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGc < 1:1127546/150‑1 (MQ=255) tGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCCGCTGGTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGt < 1:2371752/150‑1 (MQ=255) ctgcGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCa > 1:1653589/1‑150 (MQ=255) tgcGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAg > 2:1689439/1‑150 (MQ=255) tgcGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAg > 2:1154902/1‑150 (MQ=255) ccGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCGTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCaa > 1:1043665/1‑150 (MQ=255) tctGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCCGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGcc > 2:170700/1‑150 (MQ=255) tctGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGcc < 2:1470187/150‑1 (MQ=255) tctGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATCATGGTCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGCCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGcc < 1:782049/150‑1 (MQ=255) cgcAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGc > 2:136050/1‑124 (MQ=255) cgcAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGc < 1:136050/124‑1 (MQ=255) cAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTCTTGGGTTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCTAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCgg > 2:943729/1‑150 (MQ=255) aaaTGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGc < 1:756230/128‑1 (MQ=255) aaaTGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGc > 2:756230/1‑128 (MQ=255) aaaTGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCggg < 1:1154902/150‑1 (MQ=255) gACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAg < 1:917295/150‑1 (MQ=255) gACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAg < 1:1443593/150‑1 (MQ=255) acTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGcc > 1:1742431/1‑150 (MQ=255) cTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCa < 1:1651242/150‑1 (MQ=255) tttGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAg > 1:337297/1‑150 (MQ=255) ttAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGt > 1:1452431/1‑101 (MQ=255) ttAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCg < 1:914763/131‑1 (MQ=255) ttAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCg > 2:914763/1‑131 (MQ=255) ttAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGcc > 2:1989129/1‑150 (MQ=255) ttAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGcc > 2:790198/1‑150 (MQ=255) aGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCa > 1:839532/1‑150 (MQ=255) ggATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCATTGCCGCaa < 1:1689439/150‑1 (MQ=255) ggATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCaa < 2:1625063/150‑1 (MQ=255) ttGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTTTTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGTCCGCGCAATTGCCGATCGGGCAAGGCTAGTGCCGCAAGCa > 2:1938902/1‑150 (MQ=255) gAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCTGAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTcc > 1:23453/1‑150 (MQ=255) gAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAAtt > 1:890248/1‑112 (MQ=255) gAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAAtt < 2:890248/112‑1 (MQ=255) tttCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGctc > 1:2003306/1‑70 (MQ=255) tttCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGctc < 2:2003306/70‑1 (MQ=255) tCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGcga > 1:2388750/1‑150 (MQ=255) ccccTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGcgac > 2:700764/1‑150 (MQ=255) cccTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGcgacg > 1:1776891/1‑150 (MQ=255) cTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCgacgac > 1:2325429/1‑150 (MQ=255) cTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCgacgac > 2:1098308/1‑150 (MQ=255) tttGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGAcc > 2:1224988/1‑150 (MQ=255) gtgtTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGAAAGGCCAGTGCTGTCAGGATCTCCATCACAGCGACGACCGCa > 2:1720053/1‑150 (MQ=255) tgtTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCAc > 1:1174715/1‑150 (MQ=255) aGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTcccc < 1:961640/150‑1 (MQ=255) gggggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCa > 1:643867/1‑150 (MQ=255) ggggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCAt < 1:1989129/150‑1 (MQ=255) gggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAg > 1:1631419/1‑75 (MQ=255) gggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAg < 2:1631419/75‑1 (MQ=255) gggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAgg > 1:687709/1‑103 (MQ=255) gggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAgg < 2:687709/103‑1 (MQ=255) gggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATc > 1:1801290/1‑150 (MQ=255) gggTATAAAGGGCATGGCCACCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGCCCGCACTCCCCATc > 2:527826/1‑150 (MQ=255) ggctATTACGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCCGCCCCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATc < 1:773984/147‑1 (MQ=255) ggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATca < 1:950663/150‑1 (MQ=255) ggTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATca > 2:1886249/1‑150 (MQ=255) ttAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGt < 2:398144/57‑1 (MQ=255) ttAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGt > 1:398144/1‑57 (MQ=255) ttAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCa > 2:363917/1‑69 (MQ=255) ttAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCa < 1:363917/69‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCt < 1:1655411/150‑1 (MQ=255) agagcgtGGCCGCAATGCTGCTGTTCGTAGCACAAGGCGGCTCTTGGAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCCAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTg > 2:1133135/7‑150 (MQ=255) aGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatcca < 1:1077148‑M2/141‑107 (MQ=255) aGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatcca > 2:1077148‑M2/1‑35 (MQ=255) aGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTc < 1:295396/113‑1 (MQ=255) aGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTc > 2:295396/1‑113 (MQ=255) aGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCAGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGTAGCTg > 2:416497/1‑150 (MQ=255) gggCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAg > 2:541861/1‑59 (MQ=255) gggCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGc < 1:700764/150‑1 (MQ=255) gggCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGc > 1:795261/1‑150 (MQ=255) gCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGcc < 1:120027/149‑1 (MQ=255) gCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGcc > 2:120027/1‑149 (MQ=255) cATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaaca < 2:1168554‑M2/74‑44 (MQ=255) cATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCgg > 2:777913/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGaa < 2:643867/150‑1 (MQ=255) ccgccCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagt < 2:218199‑M2/93‑68 (MQ=255) ccgccCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggccatgcccttaatacccccttaacacaaaggggaaacactccctcacaatccttaacaaagt > 1:218199‑M2/1‑26 (MQ=255) ccgccCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGt > 2:1027284/1‑150 (MQ=255) gccCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGttt > 1:2247826/1‑150 (MQ=255) cccTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTc < 1:857854/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCa > 1:1362402/1‑150 (MQ=255) cTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCa < 2:2325429/150‑1 (MQ=255) tGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAg > 1:433776/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAAc > 1:2166764/1‑150 (MQ=255) gTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGc > 1:818391/1‑150 (MQ=255) ttCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCCTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGcc > 1:1001224/1‑150 (MQ=255) tCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGGCTTCAGCGGCCGAGCAATGGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGccc < 2:571633/150‑1 (MQ=255) gcagcaCAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGc > 2:1993041/1‑83 (MQ=255) gcagcaCAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGc < 1:1993041/83‑1 (MQ=255) gcagcaCAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCCTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACTTTTCCAGCAACCGCCCCt < 2:1001224/150‑1 (MQ=255) tctctgaggaggCTTTTTTAGCGAGTGCGTATCCTTCAGCTGCCACGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGCCCCTGc < 2:1343048/144‑1 (MQ=255) agcaCAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGCCCCTgg < 2:1653589/150‑2 (MQ=255) acaAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTccc > 2:2022879/1‑107 (MQ=255) acaAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTccc < 1:2022879/107‑1 (MQ=255) caAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCACGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGCCCCTGCgaga > 1:1343048/1‑147 (MQ=255) aaGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCt > 1:52319/1‑116 (MQ=255) aGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGCCCCTGCGTcccc < 2:839532/150‑1 (MQ=255) aGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGCCCCTGCGTcccc < 1:1938902/150‑1 (MQ=255) | GAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGTATTAAGGGCATGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCGAGTGCGTAGCCTTCAGCGGCCGCGCAATTGCCGGTCGGGCAAGGCCAGTGCCGCAAGCAGTCCCAGCACCGCGACGACCGCACTCCCCATCAGCAGCTGCCGGAACGTTTCCAGCAACCGCCCCTGCGTCCCC > NC_002947/1583427‑1583724 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |