| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1797361 = | 86 (0.970) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 5.7% | coding (20/777 nt) | lpxA | acyl‑[acyl‑carrier‑protein]‑‑UDP‑N‑ acetylglucosamine O‑acyltransferase |
| ? | NC_002947 | 1797413 = | 82 (0.970) | coding (72/777 nt) | lpxA | acyl‑[acyl‑carrier‑protein]‑‑UDP‑N‑ acetylglucosamine O‑acyltransferase | |||||
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CTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGACACCCCGGACCTTAAGTACAA > NC_002947/1797264‑1797562 | cTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCt > 1:2215025/1‑150 (MQ=255) ggAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTg < 2:2271934/150‑1 (MQ=255) ggAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCAGTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTg < 1:2363197/150‑1 (MQ=255) gggcgtgccgatgcgggtcgggcctgtgagcacaacatgcgggccgataacggtgccctccccgatttctacatcagggccaacgatcgacgaaGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGGCGGCGTCGAGGTCGGCCCTTgg > 2:662435‑M1/95‑150 (MQ=255) aaGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGt < 1:1570403/150‑1 (MQ=255) aaGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGt < 2:1282219/150‑1 (MQ=255) gTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCg > 1:283921/1‑150 (MQ=255) tCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGAt < 1:1553783/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGtt < 1:520117/150‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGATCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGt > 1:789600/1‑150 (MQ=255) tGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTa < 2:1682382/150‑1 (MQ=255) tGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTa < 2:1995522/150‑1 (MQ=255) aTGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAAt > 1:1136274/1‑150 (MQ=255) 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cctccccgatttctacatcagggccaacgatcgaccaaGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTc < 2:589048‑M1/58‑1 (MQ=255) cTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCAtgtt > 2:98075/1‑150 (MQ=255) gcgcGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCAtgttgt < 1:1651217/150‑1 (MQ=255) gcgGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGc > 2:786175/1‑150 (MQ=255) aaCGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCt < 2:970311/147‑1 (MQ=255) aaCGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCaa < 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cGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGacac < 1:2297168/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCGTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGACACCCCg > 2:1482352/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGACACCCCg < 1:1101895/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGACACCCCGGACCtt > 2:2259758/1‑150 (MQ=255) tCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGaa > 2:473539/1‑134 (MQ=255) tCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGaa < 1:473539/134‑1 (MQ=255) ggcccTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGACACCCCGGACCTTAAg < 1:390580‑M2/145‑1 (MQ=255) ggcccTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGACACCCCGGACCTTAAg < 2:511369‑M2/145‑1 (MQ=255) gcccTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGACACCCCGGACCTTAAGt > 2:1102531‑M2/5‑150 (MQ=255) ccTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTcc < 2:110006‑M2/115‑1 (MQ=255) ccTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTcc > 1:110006‑M2/3‑117 (MQ=255) ttGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGACACCCCGGACCTTAAGTACaa < 1:566844/150‑1 (MQ=255) | CTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGC‑TGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGATCGGTGAAGACACCCCGGACCTTAAGTACAA > NC_002947/1797264‑1797562 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |