New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2436708 | 103 (1.160) | 5 (0.070) +TCGTTACAGAACAGATTGACCAGCCTGGAT |
4/186 | NT | 6.8% | intergenic (+243/‑416) | PP_2134/fadB | transposase/enoyl‑CoA hydratase/3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 3973164 | 79 (0.890) | intergenic (+158/+27) | PP_3502/PP_3503 | transposase/sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
CTGCAACGCAGCCCGCCCAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTCGCTGTGCCGGTTGAGCACATCGCACAGTGCCTGGCGCT > NC_002947/3973015‑3973312 | cTGCAACGCAGCCCGCCCAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGc < 2:1519434/150‑1 (MQ=32) tacAACGCAGCGCGCCCAAACTGACGGGCAGTATCCAAAGCACGGACATCACTGGCGAGCACGCTGACTCGTACCTCGAGACTGCAGAGAGCCCCCGATGGCGTTTTGAATGAAAAGTTGGCTGCGGCTATAGAATCTCCTACAGGGGcg > 2:339667/3‑149 (MQ=2) aaCGCAGCCCGCCCAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTtgt < 1:1218384/150‑1 (MQ=35) aaCGCAGCCCGCCCAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTtgt < 1:2392916/150‑1 (MQ=35) aCGCAGCCCGCCCAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTtgtg < 1:141557/150‑1 (MQ=35) aGCCCGCCCAAACTGACGGGCAGTATCCAATTCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGttt < 1:1578774/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCCCAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGttt < 1:2398912/150‑1 (MQ=39) cgcccAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCt < 1:1199397/150‑1 (MQ=255) gcccAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCtt < 1:1875997/150‑1 (MQ=255) gcccAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGAT‑GCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCttt < 2:1321003/150‑1 (MQ=255) cccAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCttt < 2:2067730/150‑1 (MQ=255) cAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCtt < 2:977727/147‑1 (MQ=255) cAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCtt > 1:977727/1‑147 (MQ=255) aaaCTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTgag > 2:2253782/1‑150 (MQ=255) aCGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCNTACCTCGAGGTTGCGGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTGCTGAAAATTTACCTCCGTCCAGAGGAGCTCCTACAGGGGCTCGAGGTTTAGCTTTGagagagat > 1:976748/1‑146 (MQ=11) aCGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGcgcc < 2:2233031/150‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTa < 1:2262172/150‑1 (MQ=255) ccAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTAt > 1:546848/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCt > 2:696880/1‑150 (MQ=255) gggAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCtt < 2:2141745/150‑1 (MQ=255) gagaAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGCTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTtgt > 1:1737116/1‑150 (MQ=255) agaAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTtgtg < 2:1739483/150‑1 (MQ=255) aaTTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGcaa < 2:387999/150‑1 (MQ=255) ttCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGcaaca > 1:1913272/1‑150 (MQ=255) ctctGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTCACTTCTGCGCAGGGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGcaacatc < 2:1771523/150‑3 (MQ=21) ctGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCg > 2:164250/1‑150 (MQ=255) gCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATa > 1:1199073/1‑150 (MQ=255) aCGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTga < 1:1762506/106‑1 (MQ=255) aCGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTga > 2:1762506/1‑106 (MQ=255) tGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGt > 1:585116/1‑150 (MQ=255) tACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGt > 2:1070774/1‑150 (MQ=255) cTCGAGGTTGCTTAGAGAGGGCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGACTCTCCTACAGGGACTTCTGCCTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTGTCTGGTTCTGGTGCAACAACCGATAGCTCGTCGGCCGTGaa > 2:66733/1‑150 (MQ=21) cTCGAGGTTGCTGAGAGAGGACGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACGGGGGCatccaggctggtcaatctcttctgtaacggcaaagcggcgacttggcaccccaccccttcagggttatgccgagc > 2:1894140‑M2/1‑75 (MQ=255) tCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGaaa < 1:164250/150‑1 (MQ=255) tCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGaaa > 1:1583283/1‑150 (MQ=255) cGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAAt < 2:1539895/150‑1 (MQ=255) ggTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGcc < 1:696880/150‑1 (MQ=255) ttGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCa < 2:1583283/150‑1 (MQ=255) tGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACGGGGGCatccaggctggtcaatctgttctgtaacgacaaagcggcgacttggcaccccaccccttcagggttatgccgagc < 1:885507‑M2/139‑76 (MQ=255) tGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACGGGGGCatccaggctggtcaatctgttctgtaacgacaaagcggcgacttggcaccccaccccttcagggttatgccgagc > 2:885507‑M2/1‑64 (MQ=255) tGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGc > 2:614027/1‑95 (MQ=255) tGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGc < 1:614027/95‑1 (MQ=255) agGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGTCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGc > 2:1216049/1‑150 (MQ=255) agGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGc > 2:2066513/1‑89 (MQ=255) agGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGc < 1:2066513/89‑1 (MQ=255) ccGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGc < 2:597078/150‑1 (MQ=255) gTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCa > 2:1460658/1‑150 (MQ=255) tttttACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTCGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAg < 1:2346508/150‑1 (MQ=255) cTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACGGGGGCatccaggctggtcaatctgttctgtaacgacaaagcggcgacttggcaccccaccccttcagggttatgccgagcc < 2:111913‑M2/116‑77 (MQ=255) cTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACGGGGGCatccaggctggtcaatctgttctgtaacgacaaagcggcgacttggcaccccaccccttcagggttatgccgagcc > 1:111913‑M2/1‑40 (MQ=255) cTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATGTGGGGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTc > 2:1771631/1‑150 (MQ=255) cTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCGGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTc < 1:2299117/150‑1 (MQ=255) cTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTc < 2:1689173/150‑1 (MQ=255) tGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTCg > 2:679279/1‑150 (MQ=255) tGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTCg > 1:1343186/1‑150 (MQ=255) gAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCg < 2:904418/105‑1 (MQ=255) gAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCg > 1:904418/1‑105 (MQ=255) gAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCGCCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTCGc < 2:546848/150‑1 (MQ=255) 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1:1650269/123‑1 (MQ=255) tcCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTg < 1:2363776/102‑1 (MQ=255) tcCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTg > 2:2363776/1‑102 (MQ=255) aCAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGtt < 1:724773/115‑1 (MQ=255) aCAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGtt > 2:724773/1‑115 (MQ=255) cAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTCGCTGTGCCGGTTGAGCACCTCGCACAGTGCCTg < 2:1199073/150‑1 (MQ=255) aGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTCGCTGTGCCGGTTGAGCACATCGCACAGTGCCTgg < 1:1806255/150‑1 (MQ=255) gggCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTACCCTGCCGCCATCAGGTTGTCGCTGTGCCGGTTGAGCACATCGCACAGTGCCTGgcg > 2:676001/1‑150 (MQ=255) gCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTCGCTGTGCCGGTTGAGCACATCGCACAGTGCCTGGCGCt > 2:1965740/1‑150 (MQ=255) | CTGCAACGCAGCCCGCCCAAACTGACGGGCAGTATCCAATGCTGGGGAGAAATTCTCTGGCACGCTGACTCGTACCTCGAGGTTGCTGAGAGAGGCCGATGGCGTTTTTACTGAAAATTTGCCTCCGGCCATAGAATCTCCTACAGGGGCTTGTGGTTTCCCTTTGAGAGCGCCGCTCAGCGTATCTGGTGCTTGTGCAACAACCGATAGAACGTCGGCCGTGAAATGCCCAGCACCTTGGCTGCCACGCTCAGGTTGTCGCTGTGCCGGTTGAGCACATCGCACAGTGCCTGGCGCT > NC_002947/3973015‑3973312 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |