New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
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gcgcCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTc > 1:1369424/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTc > 1:686363/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTGTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGGCATGCGATTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGcgcc > 1:1953572/1‑150 (MQ=255) cGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCa > 2:1226460/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCAc < 1:1042059/150‑1 (MQ=255) gccgggcaTGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGt < 2:490101‑M2/142‑1 (MQ=255) cgtgcaTGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGc < 1:116238‑M2/144‑1 (MQ=255) ggcaTGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAg < 1:1226460‑M2/146‑1 (MQ=255) ggcaTGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTAGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAg < 2:194688‑M2/146‑1 (MQ=255) caTGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGa < 1:2061968‑M2/148‑1 (MQ=255) caTGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGa < 1:179081‑M2/148‑1 (MQ=255) caTGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGa < 2:1017649‑M2/148‑1 (MQ=255) aTGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGAc < 1:934566‑M2/149‑1 (MQ=255) aTGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGAAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGAc < 1:1742026‑M2/149‑1 (MQ=255) | GGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTCACCACGGTCCTTGACGTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGAC > NC_002947/5115345‑5115642 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |