New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3556182 | 25 (0.790) | 8 (0.260) | 6/262 | 2.9 | 26.0% | coding (556/1188 nt) | PP_3140 | group 2 family glycosyl transferase |
? | NC_002947 | = 3556204 | 21 (0.670) | coding (578/1188 nt) | PP_3140 | group 2 family glycosyl transferase |
CCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGATCAACCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGC > NC_002947/3556034‑3556329 | ccAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGt > 1:638500/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCg > 1:75093/1‑149 (MQ=255) gTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCg < 2:75093/149‑1 (MQ=255) gAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGt < 1:497403/150‑1 (MQ=255) ggggCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGc < 2:156882/142‑1 (MQ=255) ggggCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGc > 1:156882/1‑142 (MQ=255) tCGACTGTCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGgcgc < 2:489371/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTggg > 2:149185/1‑150 (MQ=255) cgcTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCtgccatgc < 1:149185/150‑1 (MQ=255) aCGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGa > 1:318762/1‑150 (MQ=255) cGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGTTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGAt < 2:69988/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGgcg > 1:767894/1‑150 (MQ=255) ccgcccgGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGcgcgcccagccacgtggccgcaccaggt < 1:132766‑M1/123‑29 (MQ=255) ccgcccgGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGcgcgcccagccacgtggccgcaccaggg > 2:132766‑M1/1‑95 (MQ=255) cgcccgGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGcgcgcccagccacgtggccgcaccaggttcttga < 1:663791‑M1/128‑35 (MQ=255) cgcccgGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGcgcgcccagccacgtggccgcaccaggttcttga > 2:663791‑M1/1‑94 (MQ=255) cgcccgGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGcgcgcccagccacgtggccgcaccaggttcttga < 2:127322‑M1/128‑35 (MQ=255) cgcccgGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGcgcgcccagccacgtggccgcaccaggttcttga > 1:127322‑M1/1‑94 (MQ=255) tCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCtg < 1:427844/114‑1 (MQ=255) tCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGAGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCtg > 2:427844/1‑114 (MQ=255) gATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCt < 2:767894/150‑1 (MQ=255) cccagCACCTGCCGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAg > 2:478753/5‑150 (MQ=255) aCCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGAt < 1:756008/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGATCAACCTGGCCAATg < 2:638500/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGATCAACCTGGCCAATGGTCATCTgg < 1:344981/150‑1 (MQ=255) gCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGATCAACCTGGCCAATGGTCATCTGGt > 2:81820/1‑150 (MQ=255) ccGTGTTTGCCTGGGGTGTCGAGGAACGGGTTTGGGCACTCTGCCCGGCTCGCCTGTGCCTGCCATGCCAACTGCTGGGCGCGGGCATGGCCTTCGGCACACCCTCTCGGACTCGCTTCATCCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGAtg > 2:773206/1‑150 (MQ=255) cGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGcgcgcccagccacgtggccgcac < 1:714876‑M1/52‑24 (MQ=255) cGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGcgcgcccagccacgtggccgcac > 2:714876‑M1/1‑29 (MQ=255) tttGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGATCAACCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAg < 2:318762/150‑1 (MQ=255) tCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGccaggttcttgacccgccaggcaaactcggcaacctgcaccctcaacccagcacctgccggtgcacgcatcagatacagcgactgtaccgggcg < 2:127322‑M2/128‑95 (MQ=255) tCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGccaggttcttgacccgccaggcaaactcggcaacctgcaccctcaacccagcacctgccggtgcacgcatcagatacagcgactgtaccgggcg > 2:663791‑M2/1‑34 (MQ=255) tCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGccaggttcttgacccgccaggcaaactcggcaacctgcaccctcaacccagcacctgccggtgcacgcatcagatacagcgactgtaccgggcg < 1:663791‑M2/128‑95 (MQ=255) tCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGccaggttcttgacccgccaggcaaactcggcaacctgcaccctcaacccagcacctgccggtgcacgcatcagatacagcgactgtaccgggcg > 1:127322‑M2/1‑34 (MQ=255) tCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGATCAAc > 2:630567/1‑104 (MQ=255) tCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGATCAAc < 1:630567/104‑1 (MQ=255) ccctGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGccaggttcttgacccgccaggcaaactcggcaacctgcaccctcaacccagcacctgccggtgcacgcatcagatacagcgactgtaccgggcgg > 2:132766‑M2/2‑28 (MQ=255) aCCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGccaggttcttgacccgccaggcaaactcggcaacctgcaccctcaacccagcacctgccggtgcacgcatcagatacagcgactgtaccgggcgg < 1:132766‑M2/123‑96 (MQ=255) tGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGATCAACCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCcagc > 1:672644/1‑150 (MQ=255) gTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGccaggttcttgacccgccaggcaaactcg < 1:714876‑M2/52‑30 (MQ=255) gTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGccaggttcttgacccgccaggcaaactcg > 2:714876‑M2/1‑23 (MQ=255) | CCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGATCAACCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGC > NC_002947/3556034‑3556329 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |