New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4870711 = | 64 (0.880) | 10 (0.170) | 9/198 | NT | 16.0% | intergenic (+16/‑104) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
? | NC_002947 | 4870781 = | 54 (0.930) | intergenic (+86/‑34) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
CACCAGCACGCAGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4870877‑4870711 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cattcgcgggtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATGG > NC_002947/4870781‑4870929 gACCTGCACGCAGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCG < 1:1645776/149‑1 ACCAGCACGCAGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGG < 2:201325/150‑1 ACCAGCACGCAGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGG < 2:1663849/150‑1 CAGCACGCAGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGT > 2:1665562/1‑150 CAGCACGCAGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGT > 2:1539957/1‑150 GCACGCAGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAA > 1:1828939/1‑150 CGCAGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGATGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACC > 2:880736/1‑150 AGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGC > 1:163846/1‑150 AGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGC < 1:545744/150‑1 GCTTCGCCACGGGACTGGTTGTCTGCGAAGGCATTGATCCATTGTTGCATGAGGCAACGTCTGTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGACTACCAGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTC > 2:321519/1‑150 CTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCC > 1:1445955/1‑150 TCGCCACGGGACTGGTGGTTGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 1:341130/150‑1 GTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTATGAGCGGGCTTACCGGCGAATGTAGCGTCGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCGACAAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATcaat > 2:1075089/1‑146 ATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGC < 2:659598/67‑1 ATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGC > 1:659598/1‑67 CTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTG > 1:1734276/1‑150 ACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTG < 2:1734276/150‑1 ACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGT < 1:1942416/132‑1 ACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGT > 2:1942416/1‑132 CCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGT > 1:314887/1‑150 CCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGT > 2:1838414/1‑150 CGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGT < 1:243105/81‑1 CGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGT > 2:243105/1‑81 TGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGG < 1:1838414/150‑1 TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGC < 1:153780/150‑1 GGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAAC < 1:1898112/150‑1 GTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACG > 1:1715949/1‑150 TAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGC < 2:1188521/150‑1 ACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGG < 1:1663849/150‑1 CCCGCTCCTACCAGGGTCGGGAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGC < 2:838281/150‑1 CCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGC < 1:956045/150‑1 CCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGC > 2:1345074/1‑99 CCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGC < 1:1345074/99‑1 GCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCG > 2:994073/1‑150 CTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGA < 2:372113/105‑1 CTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGA > 1:372113/1‑105 TCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGATCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAA < 2:1834266/150‑1 TACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGAT < 2:528084/150‑1 ACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCTCCGACGACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGAGTCGCGCTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATG > 1:512100/1‑150 ACCAGCGTCGGCAGAATGGATTAGATAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAGCGCCCTCGCCGACCACCAGTCGCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATG < 2:341130/150‑1 CCAGGGTCGGCAGCATGGCTTCGGGAGGTTGCCTCATCCACCAAGTGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATGG < 2:1182649/150‑1 CACCAGCACGCAGGCTTCGCCACGGGACTGGTGGTCGGCGAGGGCGTTGATCCATTGGTGCATGATGCAACCTCTCTAAGCCATGCTGCCGACCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTAGCGTTGGAGCTGATATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4870877‑4870711 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cattcgcgggtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATGG > NC_002947/4870781‑4870929 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |