New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4870711 = | 64 (0.880) | 10 (0.170) | 9/198 | NT | 16.0% | intergenic (+16/‑104) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
? | NC_002947 | 4870781 = | 54 (0.930) | intergenic (+86/‑34) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATGG > NC_002947/4870632‑4870929 | gATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcc > 2:257086/1‑150 (MQ=255) gATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcc > 2:1185998/1‑150 (MQ=255) cacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAg > 1:1734276‑M1/78‑150 (MQ=255) cgcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAggg > 2:382308/1‑150 (MQ=255) gcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACCAGGGt > 2:582285/1‑150 (MQ=255) gcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGt > 2:1219298/1‑150 (MQ=255) cAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCAGCTCGTACGAGGGTc > 2:1565073/1‑150 (MQ=255) gCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg < 1:1067932/143‑1 (MQ=255) gCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGgca < 1:961940/150‑1 (MQ=255) gCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATgg < 1:1565073/150‑1 (MQ=255) tGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGCTATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCt < 2:1040698/150‑1 (MQ=255) tGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCACCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCt > 1:1855454/1‑150 (MQ=255) ccaGTCGCGCGAACGGGAACTGGAACCCATCACCGCCTGACAACGCAAGGCCCTTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTagaga < 2:1671193/149‑1 (MQ=255) gTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTATACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAGCACGGTCCTACCAGGGTCGACAGCATGGCTTACAGAGGt > 2:153780/1‑150 (MQ=255) gcgcgcgAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGCtt < 1:1937709/149‑1 (MQ=255) cgcgcgAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTg < 2:1790253/150‑1 (MQ=255) gcgcgAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg < 2:976558/123‑1 (MQ=255) gcgcgAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg > 1:976558/1‑123 (MQ=255) gcgAACGGGAACTTGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGcat < 1:182328/150‑1 (MQ=255) gAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGt > 2:373353/1‑143 (MQ=255) gAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGt < 1:373353/143‑1 (MQ=255) gggAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCa > 1:880736/1‑150 (MQ=255) gggAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCa > 1:1182649/1‑150 (MQ=255) gtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctggtatgagcgggcttaccggcgaatgtagcgtcggagctgatatcgcattcgcgggtgaacccgctccgacAAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGgttgcatcatcaat > 2:1075089‑M2/111‑146 (MQ=255) 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< 1:62277/109‑1 (MQ=255) gAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGt > 2:62277/1‑109 (MQ=255) gAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGa > 1:1539957/1‑150 (MQ=255) gAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGa < 1:360709/150‑1 (MQ=255) aaaCCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGAt < 1:646054/150‑1 (MQ=255) aaCCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATc > 2:163846/1‑150 (MQ=255) cATCGCCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGCTATCAGCTCCAACGCTACAGCCGCGGTTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAAc < 1:723877/150‑1 (MQ=255) aTCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGGTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACg > 1:1003378/1‑150 (MQ=255) tCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACCAAAGATGGCAGGCTGGCCGAGGAAGGTGGCATCATGCACCAATGGATCAACGc > 1:1884816/1‑150 (MQ=255) ccccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTg > 1:1329582/1‑122 (MQ=255) ccccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTg < 2:1329582/122‑1 (MQ=255) ccccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTc < 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tACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTAc < 1:391543/150‑1 (MQ=255) tACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATAATCGAAGAGCGCGGCTCTAc > 1:590704/1‑150 (MQ=255) tcgcgggtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCcgc < 1:153780‑M2/128‑1 (MQ=255) ggtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAAc < 1:1898112‑M2/133‑1 (MQ=255) gtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACg > 1:1715949‑M2/17‑150 (MQ=255) taaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGc < 2:1188521‑M2/135‑1 (MQ=255) acccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAgg < 1:1663849‑M2/138‑1 (MQ=255) cccgctcctacCAGGGTCGGGAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGc < 2:838281‑M2/139‑1 (MQ=255) cccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGc < 1:1345074‑M2/88‑1 (MQ=255) cccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGc > 2:1345074‑M2/12‑99 (MQ=255) cccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGc < 1:956045‑M2/139‑1 (MQ=255) ctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGa < 2:372113‑M2/98‑1 (MQ=255) ctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGa > 1:372113‑M2/8‑105 (MQ=255) tacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGAt < 2:528084‑M2/147‑1 (MQ=255) acCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCTCCGACGACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGAGTCGCGCTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATg > 1:512100‑M2/3‑150 (MQ=255) acCAGCGTCGGCAGAATGGATTAGATAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAGCGCCCTCGCCGACCACCAGTCGCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATg < 2:341130‑M2/148‑1 (MQ=255) cCAGGGTCGGCAGCATGGCTTCGGGAGGTTGCCTCATCCACCAAGTGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATgg < 2:1182649‑M2/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAAc > 2:58622/1‑133 (MQ=255) cAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAAc < 1:58622/133‑1 (MQ=255) cAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGAtg > 1:327193/1‑148 (MQ=255) cAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGAtg < 2:327193/148‑1 (MQ=255) | GATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATGG > NC_002947/4870632‑4870929 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |