New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4870711 = | 64 (0.880) | 10 (0.170) | 9/198 | NT | 16.0% | intergenic (+16/‑104) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
? | NC_002947 | 4870781 = | 54 (0.930) | intergenic (+86/‑34) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
TGATTACCGCGTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGC > NC_002947/4870563‑4870859 | ccatcttcgagcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatcacttggtggatgaggcaacctcccgaagccatgctgccgaccctgg < 2:1182649‑M1/1‑1 (MQ=255) catcttcgagcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcagcgcgactcaggcttcgccacgggactggtcgtcggagagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGt > 1:512100‑M1/149‑150 (MQ=255) atcttcgagcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTa < 2:528084‑M1/3‑1 (MQ=255) ccGCGTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGC > 1:101560‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGCGTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGC < 2:1034226‑M1/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGGCTG‑AACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCG > 1:1790253‑M1/1‑150 (MQ=255) gcgTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGG > 2:532244‑M1/1‑150 (MQ=255) gcgTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGG < 1:268446‑M1/150‑1 (MQ=255) cgTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGG < 1:1230533‑M1/150‑1 (MQ=255) gcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCggg < 1:956045‑M1/11‑1 (MQ=255) gcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctcccgaccctgGTAGGAGCggg < 2:838281‑M1/11‑1 (MQ=255) tGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGGGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGAAGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTT > 2:1789590‑M1/1‑150 (MQ=255) cctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGt < 1:1663849‑M1/12‑1 (MQ=255) cgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTAc > 1:1715949‑M1/135‑150 (MQ=255) gttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:1898112‑M1/17‑1 (MQ=255) gcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa < 1:153780‑M1/22‑1 (MQ=255) cgcCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGatat < 1:675435/150‑1 (MQ=255) ccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCa < 1:1838414‑M1/33‑1 (MQ=255) ggCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGAACGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAGCGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGc > 2:1676679/1‑150 (MQ=255) gCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTTGCCGCGAATGCGATATCAGCt > 1:1069415/1‑150 (MQ=255) cGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGc < 2:1840403/150‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCt > 1:838281/1‑150 (MQ=255) gggTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcatt < 2:360709‑M2/150‑5 (MQ=255) gTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAG 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< 2:1518605‑M2/122‑8 (MQ=255) gCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcggg > 2:471943‑M2/1‑114 (MQ=255) gCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg > 2:1067932/1‑143 (MQ=255) gT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGATAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGgcagca < 2:1508873/150‑1 (MQ=255) gCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATgg < 1:1565073/150‑1 (MQ=255) gCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATgg < 1:1565715/150‑1 (MQ=255) 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ggAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCAc < 1:382308/150‑1 (MQ=255) cTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAAt < 1:257086/150‑1 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATg > 2:646054/1‑150 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATg > 2:391543/1‑150 (MQ=255) gAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGa < 1:360709/150‑1 (MQ=255) aaaCCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGAt < 1:646054/150‑1 (MQ=255) aaCCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATc > 2:163846/1‑150 (MQ=255) cATCGCCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGCTATCAGCTCCAACGCTACAGCCGCGGTTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAAc < 1:723877/150‑1 (MQ=255) acctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTcgcg < 1:243105‑M1/53‑1 (MQ=255) aTCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgggtaaacc > 2:772311‑M2/1‑72 (MQ=255) aTCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGGTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACg > 1:1003378/1‑150 (MQ=255) ccccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTg > 1:1329582/1‑122 (MQ=255) ccccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTg < 2:1329582/122‑1 (MQ=255) ccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGc < 1:743192/150‑1 (MQ=255) ccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAcattcgcgggtaaaccctctcctaccagggcctttcgtaggcagggggtgttgggttccagtgcccgggcgtgcgacggtgttcc < 2:408672‑M2/150‑86 (MQ=255) cTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATCGATCAACGCCCTCGcc < 2:25625/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGAccacca > 2:1445955/1‑150 (MQ=255) gCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTccc > 1:1926481/1‑150 (MQ=255) cccTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATg > 1:964724/1‑120 (MQ=255) cccTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATg < 2:964724/120‑1 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGt > 2:956045/1‑150 (MQ=255) ttGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCAc < 2:851140/112‑1 (MQ=255) ttGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCAc > 1:851140/1‑112 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGc < 2:1926481/150‑1 (MQ=255) | TGATTACCGCGTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGT‑GGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGC > NC_002947/4870563‑4870859 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |