| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1976254 | 122 (1.670) | 7 (0.110) | 7/222 | NT | 5.7% | intergenic (+39/‑126) | pheA/PP_1770 | bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase/3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 1976306 | 121 (1.850) | intergenic (+91/‑74) | pheA/PP_1770 | bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase/3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
ACTTCGTCGGCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCAAAAACCAA > NC_002947/1976106‑1976402 | aCTTCGTCGGCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCa > 1:756214/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGGCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATg > 2:602755/1‑150 (MQ=255) caccacCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTccc > 1:1280653/1‑150 (MQ=255) caccGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca > 2:245677/1‑150 (MQ=255) accGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:470255/1‑144 (MQ=255) gcgACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGa < 1:294450/150‑1 (MQ=255) gcgACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGa < 1:1874129/150‑1 (MQ=255) gACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGCGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATACGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGc < 1:1583953/150‑1 (MQ=255) gACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGc < 1:602755/150‑1 (MQ=255) ccGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCTGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCAtg > 1:1404192/1‑150 (MQ=255) ccGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGa < 1:1248155/145‑1 (MQ=255) cGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCAtgt > 1:748592/1‑150 (MQ=255) cGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCAt < 1:1029155/148‑1 (MQ=255) cGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCAt > 2:1029155/1‑148 (MQ=255) tCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGcc < 2:1364092/150‑1 (MQ=255) aGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGAt > 2:1645868/1‑150 (MQ=255) aGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGAt < 2:673566/150‑1 (MQ=255) gCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCtgtg < 2:1090303/150‑1 (MQ=255) gAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAg > 2:457035/1‑150 (MQ=255) gCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCg > 2:1087303/1‑150 (MQ=255) aTCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCt > 2:358801/1‑108 (MQ=255) aGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAgc > 1:1797977‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAgcc < 2:1312943‑M2/150‑4 (MQ=255) aggaggCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATTCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAgcccgc < 1:957246‑M2/150‑7 (MQ=255) gCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAgcccgcgaagg < 1:133979‑M2/150‑12 (MQ=255) gtgGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGgcc < 1:1312943/150‑1 (MQ=255) cgcgGAATGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGc < 1:228164/88‑1 (MQ=255) cgcTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGc > 2:228164/1‑88 (MQ=255) gcTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGgccgcgcc > 1:1830794/1‑150 (MQ=255) gcTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGgccgcgcc > 2:1609642/1‑150 (MQ=255) gcTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGgccgcgcc < 2:1280653/150‑1 (MQ=255) tGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGgccgcgccgc < 2:748592/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCCTGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCgg < 1:541952/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGTTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGAtc < 2:1629439/108‑1 (MQ=255) ggTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGTTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGAtc > 1:1629439/1‑108 (MQ=255) ggTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGcc > 2:112181/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGGCGCGGccctt < 2:549059/150‑3 (MQ=255) gCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCa > 1:547968/1‑150 (MQ=255) ggCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCaa < 2:1034816/147‑1 (MQ=255) ggCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATgg < 2:1830794/150‑1 (MQ=255) ggCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATgg < 1:1130070/150‑1 (MQ=255) ctctTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGTGCCGCGGCCCCAATGGcc < 2:1370448/150‑1 (MQ=255) ctctTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCACCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTgg > 1:652910/1‑106 (MQ=255) ctTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCt < 2:577395/150‑1 (MQ=255) ttATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACTGTGAGCATGTGATGCCGATCTCCCTGGGCGCGGCCAAAGGCGCGATGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTc > 1:1399126/1‑150 (MQ=38) ttATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGCTTTTTGCCCGGACTGGCTAGCCCGCGGAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTc > 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ccTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGt < 1:425501/150‑1 (MQ=255) cTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTa > 2:1825122/1‑150 (MQ=255) cTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTa > 2:446602/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTg < 1:435974/146‑1 (MQ=255) tGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTaaa < 1:1609642/150‑1 (MQ=255) tGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTaaa < 1:1118528/150‑1 (MQ=255) atctgCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGATACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTaaa < 1:155570/146‑1 (MQ=255) gCCCTTCGCGGGCtagcccgctcccacagagatcggcatcacatgctcactgtgggagcgggcatgcccgcgaagggctgcaaggcagccccaaggcccctgaatcaaagcaccgccttcggataagagcccagcaccttcagcgccaca < 2:1570500‑M1/150‑138 (MQ=255) cccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCtgt < 2:334039/52‑1 (MQ=255) cccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCtgt > 1:334039/1‑52 (MQ=255) cccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCa > 1:192731/1‑134 (MQ=255) cccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATgcag > 1:563654/1‑150 (MQ=255) cccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATgcag < 1:799760/150‑1 (MQ=255) cccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACATATATCGCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAAtagat > 2:155570/1‑146 (MQ=255) cccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGATACCTCGGGTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATgcag > 2:1124178/1‑150 (MQ=255) ccTTCGCGGGCtagcccgctcccacagagatcggcatcacatgctcactgtgggagcgggcatgcccgcgaagggctgcaaggcagccccaaggcccctgaatcaaagcaccgccttcggataagagcccagcaccttcagcgccacagc < 1:133979‑M1/150‑140 (MQ=255) ttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGt > 1:849643/1‑126 (MQ=255) ttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCAAGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCaa > 2:1195529/1‑150 (MQ=255) gcgGGCtagcccgctcccacagagatcggaatcacatgctcactgtgggagcgggcatgcccgcgaagggctgcaaggcagccccaaggcccctgaatcaaagcaccgccttcggataagagcccagcaccttcagcgccacagcctcct < 1:957246‑M1/150‑145 (MQ=255) cgGGCtagcccgctcccacagagatcggcatcacatgctcactgtgggagcgggcatgcccgcgaagggctgcaaggcagccccaaggcccct > 2:960530‑M1/1‑5 (MQ=255) cgGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAgcccgcgaagggccgcaaggcagccccaaggcccctgaatcaaagcaccgccttcggataagagcccagcaccttcagcgccacagcctcctg < 1:199260‑M2/150‑94 (MQ=255) cgGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCAAaaac < 2:405054/150‑1 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAgcccgcgaagggctgcaaggcagccccaaggcccctgaatcaaa < 1:1546074‑M2/100‑45 (MQ=255) gCtagcccgctcccacagagatcggcatcacatgctcactgtgggagcgggcatgcccgcgaagggctgcaaggcagccccaaggcccctgaatcaaagcaccgccttcggataagagcccagcaccttcagcgccacagcctcctggct > 1:1797977‑M1/1‑2 (MQ=255) | ACTTCGTCGGCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCAAAAACCAA > NC_002947/1976106‑1976402 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |