New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2004645 = | 50 (0.680) | 10 (0.150) | 8/230 | NT | 17.6% | intergenic (+92/+58) | PP_1787/PP_1788 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2004687 = | 47 (0.690) | intergenic (+134/+16) | PP_1787/PP_1788 | hypothetical protein/hypothetical protein |
CGGTCGAAATTTAAAAGTGAGTTTTTTGACGTGACTGAAATGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTGATAGATAAAGTACTT > NC_002947/2004497‑2004791 | cgGTCGAAATTTAAAAGTGAGTTTTTTGACGTGACTGAAATGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCt < 1:561930/150‑1 (MQ=255) aaatagttggcgacatttacaaccttatcggactcgcacaagtactttatctatcaatgtccttaatcaaaaaagatggcaccattaaaaccaatccgtattgcaagcttagatcaacactatcataaatacacatcacaaagcCTGAgg < 1:861466‑M1/6‑1 (MQ=255) aaatagttggcgacatttacaaccttatcggactcgcacaagtactttatctatcaatgtccttaagcaaaaaagatggcaccattaaaaccaagccgtattgcaagcttagatcaacactatcataaatacacatcacaaagcCTGAgg > 1:814580‑M1/145‑150 (MQ=255) tagttggcgacatttacaaccttatcggactcgcacaagtactttatctatcaatgtccttaatcaaaaaagatggcaccattaaaaccaatccgtattgcaagcttagatcaacactatcataaatacacatcacaaagcCTGAGGCGa > 2:590525‑M1/142‑150 (MQ=255) aGTGAGTTTTTTGACGTGACTGAAATGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGtttt > 2:1596442/1‑150 (MQ=255) tGAGTTTTTTGACGTGACTGAAATGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGtttttt < 2:913973/150‑1 (MQ=255) tGAGTTTTTTGACGTGACTGAAATGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGtttttt < 2:913764/150‑1 (MQ=255) gTTTTTTGACGTGACTGAAATGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGa < 2:1157965/150‑1 (MQ=255) tttGACGTGACTGAAATGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGAtgtg < 2:1261932/150‑1 (MQ=255) gACGTGAATGAAATGGCGCTTAATGTTTAATAAGATGTAGGGAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATATCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGaaa < 1:407887/150‑1 (MQ=255) gcacaagtactttatctatcaatgtccttaatcaaaaaagatggcaccattaaaaccaatccgtattgcaagcttagatcaacactatcataaatacacatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑Ca < 2:1161060‑M1/41‑1 (MQ=255) tGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACcgcccgcccaaa < 1:767323/150‑5 (MQ=255) cttaatgcttaatAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCttt < 1:185235/150‑1 (MQ=255) cttaatAAGATCTTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGAtgt > 2:477751/1‑150 (MQ=255) atctatcaatgtccttaatcaaaaaagatggcaccattaaaaccaatccgtattgcaagcttagatcaacactatcataaatacacatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGAtgt > 1:1161060‑M1/97‑150 (MQ=255) aGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGAtgt > 1:760223/1‑143 (MQ=255) aGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGAtgt < 2:760223/143‑1 (MQ=255) atTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGc > 1:876722/1‑86 (MQ=255) atTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGc < 2:876722/86‑1 (MQ=255) taGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTAt < 2:1526614/142‑1 (MQ=255) taGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTAt > 1:1526614/1‑142 (MQ=255) taGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAgtgt > 1:425395/1‑150 (MQ=255) gTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTg > 2:861466/1‑150 (MQ=255) tCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTACATGGGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGCTGGTGTTgt > 1:1104789/1‑149 (MQ=255) gtcccTCCACTTGACACGCCCCGAAAATGAAATCGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGTTATTTATAAATTTGTTAGCTTAGGCGATCGGTTTTTTCGACCGAAAACTGCTCTCCT‑CAGGCTTTGTTATTTGTATTTTTGATAGTGTTGAt < 2:271771/147‑1 (MQ=255) cTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAgtg > 1:594759/1‑141 (MQ=255) cTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAgtg < 2:594759/141‑1 (MQ=255) cTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGAtgtg < 2:450218/93‑1 (MQ=255) cTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGAtgtg > 1:450218/1‑93 (MQ=255) cTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTg > 1:669728/1‑150 (MQ=255) gACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCaa > 1:786367/1‑150 (MQ=255) accattaaaaccaatccgtattgcaagcttagatcaacactatcataaatacacatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTc > 1:566073‑M1/65‑99 (MQ=255) accattaaaaccaatccgtattgcaagcttagatcaacactatcataaatacacatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTc < 2:566073‑M1/35‑1 (MQ=255) aTGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATAc > 1:42903/1‑150 (MQ=255) gCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACgg > 2:968328/1‑150 (MQ=255) ccccGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGaaa > 1:499765/1‑87 (MQ=255) ccccGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGaaa < 2:499765/87‑1 (MQ=255) ccccGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGa > 2:300670/1‑150 (MQ=255) cccGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGAt < 1:300670/150‑1 (MQ=255) ccGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑Ca < 1:427817/97‑1 (MQ=255) ccGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑Ca > 2:427817/1‑97 (MQ=255) ttGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCt > 2:1471330/1‑150 (MQ=255) ttagatcaacactatcataaatacacatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCtt < 1:1530311‑M1/114‑1 (MQ=255) cAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCtttt > 1:1872924/1‑150 (MQ=255) aGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCttttt < 1:477751/150‑1 (MQ=255) ttGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGAt < 2:42903/150‑1 (MQ=255) tGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGAtt < 2:1104789/150‑1 (MQ=255) tGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGAtt < 1:968328/150‑1 (MQ=255) cAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTaa > 1:689171/1‑150 (MQ=255) aaTAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAg < 1:1156231/150‑1 (MQ=255) aGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGt < 1:69492/127‑1 (MQ=255) aGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGt > 2:69492/1‑127 (MQ=255) tttCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTgat < 2:786367/150‑1 (MQ=255) tctCTACATTTGTTTGCTTAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCTATAACGGGTGCGATG‑GAAGGTAGTATCGTGTTGATCGAAGATTGAACTACGGCTTGGTTTCCGCGTTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTgat < 1:1407905/148‑1 (MQ=255) ttCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGGAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTgata < 2:1323799/150‑1 (MQ=255) tCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTgatag < 2:1851252/150‑1 (MQ=255) cacatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTACGGTCATTgataga > 2:1530311‑M1/14‑150 (MQ=255) tAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCACTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTgataaga > 2:1407905/1‑147 (MQ=255) acatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGAt < 1:1135600‑M1/23‑1 (MQ=255) acatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGAt < 1:1135715‑M1/23‑1 (MQ=255) acatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGAt > 2:1135600‑M1/13‑35 (MQ=255) acatcacaaagcCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGAt > 2:1135715‑M1/13‑35 (MQ=255) aaaTTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTgatagata < 2:689171/150‑1 (MQ=255) aTTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTGATAGATaaa < 1:1596442/150‑1 (MQ=255) tttGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTgatagat > 1:1248972/1‑146 (MQ=255) tttGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTgatagat < 2:1248972/146‑1 (MQ=255) tAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTCAGGACATTGATAGATAAAGTACtt < 2:595599/150‑1 (MQ=255) CTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTtac > 2:1332433‑M1/1‑101 (MQ=255) CTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTaa < 1:1332433‑M1/102‑1 (MQ=255) | CGGTCGAAATTTAAAAGTGAGTTTTTTGACGTGACTGAAATGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCT‑CAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGATTAAGGACATTGATAGATAAAGTACTT > NC_002947/2004497‑2004791 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |