New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2738232 | 73 (1.000) | 4 (0.060) | 4/230 | NT | 5.1% | coding (568/4494 nt) | PP_2395 | leucine‑rich repeat‑containing protein |
? | NC_002947 | = 2738250 | 80 (1.180) | coding (586/4494 nt) | PP_2395 | leucine‑rich repeat‑containing protein |
TAACCGCCTGCTGCTTCCCCGCCACGGCACGGTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTACAAAGCCAGGCAGGAGGGAACGCTGGATGCCAGCGAACTCAATGTGATGGTGGCTGTGTGCGAGAAGGGGGAGCTGCCGCGCCTGGCGGGCGACCTTGTG > NC_002947/2738084‑2738381 | tAACCGCCTGTTGGTTCCCCGCCACGGCACGTTCAAACCCCCTACACGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTAGGTGAGCGCTATCTATGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAAGGCCGAGCGCCTGgt < 2:378111/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTTCCCCGCCACGGCACGGTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCa < 2:630959/150‑1 (MQ=255) ctTCCCCGCCACGGCACGGTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTa > 2:482978/1‑150 (MQ=255) ccccGCCACGGCACGGTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTa < 2:568200/147‑1 (MQ=255) ccccGCCACGGCACGGTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTa > 1:568200/1‑147 (MQ=255) ccGCCACGGCACGGTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGc < 1:1800587‑M2/150‑2 (MQ=255) ccGCCACGGCACGGTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGc > 1:482978‑M2/1‑149 (MQ=255) gCCACGGCACGGTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGcca > 2:1800587‑M2/1‑147 (MQ=255) cacggcacggTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGccagg < 1:928858‑M2/150‑6 (MQ=255) ggTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTacac > 1:291242/1‑150 (MQ=255) aCCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCt > 2:1368243/1‑150 (MQ=255) cccccTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCtt < 1:1368243/150‑1 (MQ=255) cccTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTtgt < 2:291242/150‑1 (MQ=255) ccTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTtgtg > 2:1652031/1‑150 (MQ=255) tACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGa < 1:359276/150‑1 (MQ=255) aaGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGc < 1:1112976/150‑1 (MQ=255) cATCGAGGTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTa < 2:786195/150‑1 (MQ=255) tCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTAc < 1:1135560/149‑1 (MQ=255) 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cTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTACAAAGCCAGGCAGGAGGGAACGCTGGAt > 1:71632/1‑150 (MQ=255) ggACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTACAAAGCCAGGCAGGAGGGAACGCTGGATGc > 1:1386717/1‑150 (MQ=255) gACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTtgtg < 2:745224/111‑1 (MQ=255) gACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTtgtg > 1:745224/1‑111 (MQ=255) gACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTACAAAGCCAGGCAGGAGGGAACGCTGGATGcc < 1:588365/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGCTCGCCTGATTTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTACAAAGCCAGGCAGGAGGGAACGCTGGATGCCAGCGaa < 1:718203/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGcatctacaagctgagacaccaggc > 1:1067216‑M1/1‑62 (MQ=255) tGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGcatctacaagctgagacaccaggc < 2:1067216‑M1/86‑25 (MQ=255) gAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTACaaa < 1:867911/114‑1 (MQ=255) gAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTACaaa > 2:867911/1‑114 (MQ=255) gcTATCAACGTCATATGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACTATGCTTGTGGACGCCTACAAAGCCAGGCAGGAGGGAACGCTGGATGCCAGCGAACTCAAtg < 2:874982/150‑1 (MQ=255) cTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTACAAAGCCAGGCAGGAGGGAACGCTGGATGCCAGCGAACTCAAtgt < 2:1386717/150‑1 (MQ=255) tCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTgg < 2:342527/95‑1 (MQ=255) 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gcatctacaagctgagacaccaggcgctcggcattgccagcgggcgtgaggatggcatccagatgacgttgatagcgctcacccaggtccagctcacgacacagtccggcaaactcgatgcttgtagggggtttgaccgtgccgtggcgg < 1:1800587‑M1/150‑150 (MQ=255) | TAACCGCCTGCTGCTTCCCCGCCACGGCACGGTCAAACCCCCTACAAGCATCGAGTTTGCCGGACTGTGTCGTGAGCTGGACCTGGGTGAGCGCTATCAACGTCATCTGGATGCCATCCTCACGCCCGCTGGCAATGCCGAGCGCCTGGTGTCTCAGCTTGTAGATGCCAGGCGCTACACCATGCTTGTGGACGCCTACAAAGCCAGGCAGGAGGGAACGCTGGATGCCAGCGAACTCAATGTGATGGTGGCTGTGTGCGAGAAGGGGGAGCTGCCGCGCCTGGCGGGCGACCTTGTG > NC_002947/2738084‑2738381 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |