| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3059570 = | 59 (0.810) | 4 (0.060) | 4/234 | NT | 7.2% | coding (806/1275 nt) | PP_2671 | sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | 3059604 = | 47 (0.680) | coding (840/1275 nt) | PP_2671 | sensor histidine kinase | |||||
CCAGGCCCTGCTGGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGCCAGTGGCAGGCCAGCCAGGGCATC > NC_002947/3059421‑3059715 | ccAGGCCCTGCTGGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGt < 1:1810592/150‑1 (MQ=255)ccAGGCCCTGCTGGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGt > 1:1099156/1‑150 (MQ=255)ccAGGCCCTGCTGGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGt > 2:1810592/1‑150 (MQ=255)ccAGGCCCTGCTGGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTCGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGt > 2:1699746/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCTGGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAg < 1:107823/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGcc > 2:623128/1‑150 (MQ=255) tgctgGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGccc < 2:1099156/150‑1 (MQ=255) tgctgGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGccc > 1:90882/1‑150 (MQ=255) ctgGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATGTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCtt < 1:1289735/150‑1 (MQ=255) ctgGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGACGAACAGCCCGAAATGGTGACGTAATCGTTGCAGTCCCtt < 2:1089028/150‑1 (MQ=255) tGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCa > 1:1338268/1‑150 (MQ=255) gagcaggagcGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGc < 1:1368696/150‑1 (MQ=255) gagcaggagcGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGc < 2:276135/150‑1 (MQ=255) gagcaggagcGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGc > 1:681576/1‑150 (MQ=255) gagcGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGa > 2:1532234/1‑146 (MQ=255) gagcGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGa < 1:1532234/146‑1 (MQ=255) agcGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGcc < 2:655313/150‑1 (MQ=255) tACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTgca < 2:361580/150‑1 (MQ=255) tACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTgca < 2:90882/150‑1 (MQ=255) tACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGGATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGCGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTgca > 2:1224968/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAg > 1:1346172/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAg > 2:736587/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGt > 2:1818393/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGt < 2:39130/150‑1 (MQ=255) gcgcAGACCCTGCACGATGATCTAGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGtttt < 2:1771176/150‑1 (MQ=255) cgcAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTc < 1:1649221/150‑1 (MQ=255) cccTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCgcgcgc < 2:1346172/150‑1 (MQ=255) gCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGt < 1:1818393/150‑1 (MQ=255) cactggctcaccaacagcccgaaggcctcggccagcggcatgtagtgcagcgccaccggatacaagttgtgcaccagcgcgcgaaaaccttgcTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTgca > 1:1799055‑M1/94‑127 (MQ=255) cactggctcaccaacagcccgaaggcctcggccagcggcatgtagtgcagcgccaccggatacaagttgtgcaccagcgcgcgaaaaccttgcTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTgca < 2:1799055‑M1/34‑1 (MQ=255) tCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTACTGCATATGGTAGCAGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCACGCCCTTGAACTCAACTGCGTGCGCCTGCAGCAAGATTTTCGCGCGCTGGTGCACAACtt < 2:683128/150‑1 (MQ=255) aTACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAAc < 2:1855324/92‑1 (MQ=255) aTACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAAc > 1:1855324/1‑92 (MQ=255) aTACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGt > 1:1871974/1‑150 (MQ=255) tACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTg < 2:1803146/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTg < 2:452591/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTg < 2:1338268/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTg > 2:455993/1‑150 (MQ=255) ctccTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTg < 1:700778/148‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGt > 1:1603883/1‑128 (MQ=255) cTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGt < 2:1603883/128‑1 (MQ=255) ctcggccagcggcatgtagtgcagcgccaccggatacaagttgtgcaccagcgcgcgaaaaccttgcTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAg > 2:1536278‑M1/68‑106 (MQ=255) ctcggccagcggcatgtagtgcagcgccaccggatacaagttgtgcaccagcgcgcgaaaaccttgcTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAg < 1:1536278‑M1/39‑1 (MQ=255) aTGCGTGCCCAGCCATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTAc > 2:1275861/1‑150 (MQ=255) ccaTGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGcc < 1:1275861/148‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAgg > 1:1693970/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGc > 1:1431462/1‑150 (MQ=255) gctgcGTATCGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCtt < 2:601778/150‑1 (MQ=255) ctgcGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTc < 2:1871974/150‑1 (MQ=255) tgcGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGGCGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCg < 2:961701/150‑1 (MQ=255) gTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAACAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGc < 1:623128/150‑1 (MQ=255) ggtggCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGtt < 1:1382280/150‑1 (MQ=255) gCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGACGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTg > 1:1527531/1‑150 (MQ=255) cGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAg > 1:502551/1‑150 (MQ=255) gAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTc > 1:1487659/1‑135 (MQ=255) gAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTc < 2:1487659/135‑1 (MQ=255) gAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGc > 1:1803784/1‑150 (MQ=255) gAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTAACGGCCGGTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGc > 2:1609303/1‑150 (MQ=255) cAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAg > 2:232093/1‑64 (MQ=255) cAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAg < 1:232093/64‑1 (MQ=255) gCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGTTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTg > 2:438348/1‑142 (MQ=255) gCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGTTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTg < 1:438348/142‑1 (MQ=255) ggAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGCCAGTGGCa < 1:1699746/150‑1 (MQ=255) gAAATGGTGACGCAGATGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGCCAGTGGCAg < 1:1327090/150‑1 (MQ=255) aCGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCAGTCGCGTTCGGGCTGTTGGTGAGCCAGTGGCAGGccagccag > 1:1070078/1‑150 (MQ=255) cGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGCCAGTGGCAGGCCAGCCAgg < 2:553414/150‑1 (MQ=255) cGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGCGCTGTCGGTGCGCCAGTGGCCGGccagccagc > 2:1642772/1‑149 (MQ=255) gCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGCCAGTGGCAGGCCAGCCAggg > 2:1576651/1‑150 (MQ=255) aCGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGCCAGTGGCAGGCCAGCCAGGGCATc < 1:1224968/150‑1 (MQ=255) aCGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGACGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGCCAGTGGCAGGCCAGCCAGGGCATc < 2:1527531/150‑1 (MQ=255) | CCAGGCCCTGCTGGCAGTGCAGGAGCAGGAGCGTACACAGCTGGCGCAGACCCTGCACGATGATCTTGGGCAATACCTGGCAGGCATGCGTGCCCAGCTATGCCTGCTGCGTATGGTGGCCGAACAGCCGGAAATGGTGACGCAGACGGTGCAGGCCCTTGAACTCAACTGCGAGCGCCTGCAGCAAGGTTTTCGCGCGCTGGTGCACAACTTGTATCCGGTGGCGCTGCACTACATGCCGCTGGCCGAGGCCTTCGGGCTGTTGGTGAGCCAGTGGCAGGCCAGCCAGGGCATC > NC_002947/3059421‑3059715 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |