| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 3163781 = | 64 (0.880) | 9 (0.130) | 8/238 | NT | 12.6% | coding (528/1278 nt) | PP_2778 | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
| ? | NC_002947 | 3163807 = | 63 (0.900) | coding (554/1278 nt) | PP_2778 | 3‑oxoacyl‑ACP synthase | |||||
GACGATCAGGGGCGGGTCGATCTCGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGA > NC_002947/3163632‑3163930 | gACGATCAGGGGCGGGTCGATCTCGACCAGTTACTGCACACCGTAAATGGTGTG‑GGGGTTGCGTTTGCCCGGCGGTTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑tg‑t < 1:918363/150‑1 (MQ=255) gATCAGGGGCGGGTCGATCTCGACCAGTTCCTGGATAAC‑CGCACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGGTCAGCAAACCCGCCATCTCCCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑Tgcc > 1:1853482/1‑150 (MQ=255) gggCGGGTCGATCTCGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGc > 2:1072912/1‑150 (MQ=255) gggCGGGTCGATCTCGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGc > 2:1121519/1‑150 (MQ=255) gggCGGGTCGATCTCGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGc > 1:129983/1‑150 (MQ=255) gTCGATCTCGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATg < 2:1198483/150‑1 (MQ=255) tCGATCTCGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACTTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATgg > 2:898220/1‑150 (MQ=255) tctcGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACTTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑Ccat > 1:898220‑M2/1‑147 (MQ=255) gggaaaagtccacgcgctggcagagtgcgcccagcccatcaaagctgtagtaggacaattcatgggccatcaactccaccgcgccacacaacgccaggtcgatctcgccacgggcgatcgctcgataggcgcTGCCGCCGGCACCATGG‑‑c > 1:1412854‑M1/133‑150 (MQ=255) ctcGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑Ccatc > 2:974591‑M2/1‑146 (MQ=255) ctcGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑Ccatc > 2:696604‑M2/1‑146 (MQ=255) gTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAgcgc < 1:1121519/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGcc > 2:1037910/1‑150 (MQ=255) tGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATc > 2:1239341/1‑150 (MQ=255) tGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATc < 1:1909684/150‑1 (MQ=255) tGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATc < 1:1072912/150‑1 (MQ=255) gATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGa < 2:1863265/150‑1 (MQ=255) c‑cACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGAt > 1:1104727/1‑150 (MQ=255) 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acacaTTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCa > 2:675212/1‑150 (MQ=255) cacaTTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTtgtgtg > 1:741876/1‑90 (MQ=255) cacaTTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTtgtgtg < 2:741876/90‑1 (MQ=255) acaTTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCAct > 2:581656/1‑150 (MQ=255) aTTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑Ccatcggaatgtgtggaaatatggtcacgtacacccagccattcggcgagatggcgggtttgctgatcaacccgccgggcaaacgccccaccgctgagg < 1:1522187‑M2/129‑99 (MQ=255) aTTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑Ccatcggaatgtgtggaaatatggtcacgtacacccagccattcggcgagatggcgggtttgctgatcaacccgccgggcaaacgccccaccgctgagg > 2:1522187‑M2/1‑31 (MQ=255) tcgctcgataggcgcTGCCGATGGC‑‑CATGGTGCCGGCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCAct < 2:532974‑M1/135‑1 (MQ=255) tCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGc < 1:96067/150‑1 (MQ=255) gctcgataggcgcTGCCGATGGC‑‑CATGGTGCCGGCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCActct > 1:532974‑M1/14‑150 (MQ=255) cGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGCTCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCa > 2:960038/1‑150 (MQ=255) cGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCa < 1:385194/150‑1 (MQ=255) c‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGt > 2:1284158/1‑150 (MQ=255) c‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGt > 1:687221/1‑150 (MQ=255) g‑tgCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTgg > 2:90395/1‑150 (MQ=255) TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGa > 1:472496‑M1/1‑150 (MQ=255) | GACGATCAGGGGCGGGTCGATCTCGACCAGTTCCTGGATAAC‑CACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATG‑CC‑TG‑TGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGA > NC_002947/3163632‑3163930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |