New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3163781 = | 64 (0.880) | 9 (0.130) | 8/238 | NT | 12.6% | coding (528/1278 nt) | PP_2778 | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
? | NC_002947 | 3163807 = | 63 (0.900) | coding (554/1278 nt) | PP_2778 | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
GTTCCTGGATAACCACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCAAGAACAGAGCCGGC > NC_002947/3163661‑3163956 | gTTCCTGGATAACCACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAgcgc < 1:1121519/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGATAACCACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGcc > 2:1037910/1‑150 (MQ=255) tGGATAACCACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATc > 2:1239341/1‑150 (MQ=255) tGGATAACCACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATc < 1:1072912/150‑1 (MQ=255) tGGATAACCACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATc < 1:1909684/150‑1 (MQ=255) gATAACCACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGa < 2:1863265/150‑1 (MQ=255) agagtgcgcccagcccatcaaagctgtagtaggacaattcatgggccatcaactccaccgcgccacacaacgccaggtcgatctcgccacgggcgatcgctcgataggcgctgccgccggcaccatggccatcggcaGCGCCTATCGAGc > 1:532974‑M2/138‑150 (MQ=255) ccACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGAt > 1:1104727/1‑150 (MQ=255) cacaCCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATc < 2:1724457/142‑1 (MQ=255) cacaCCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATc > 1:1724457/1‑142 (MQ=255) cacaCCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATc > 2:81567/1‑150 (MQ=255) agtgcgcccagcccatcaaagctgtagtaggacaattcatgggccatcaactccaccgcgccacacaacgccaggtcgatctcgccacgggcgatcgctcgataggcgctgccgccggcaccatggccatcggcaGCGCCTATCGAGCGa < 2:532974‑M2/15‑1 (MQ=255) acCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGcc > 2:1224446/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCNCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCg > 1:344905/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGc > 1:68105/1‑147 (MQ=255) ccTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGc < 2:68105/147‑1 (MQ=255) aGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGc < 1:1224446/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCAGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCg > 2:590820/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGa < 1:1037910/150‑1 (MQ=255) cAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAg > 1:1281971/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGtt < 1:590820/150‑1 (MQ=255) aCCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTg > 1:1402652/1‑150 (MQ=255) gcGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCga > 2:485999/2‑114 (MQ=255) ccGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCga < 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aCCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGAtg < 1:678730/150‑1 (MQ=255) cATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGAtggg > 1:738525/1‑150 (MQ=255) tatTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGAtgggct < 1:1045771/150‑1 (MQ=255) ttCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGAtgggctggg < 1:56523/150‑1 (MQ=255) tCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGAtgggctgggc > 1:594094/1‑150 (MQ=255) 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cgatggccatggtgccggcggcaGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCctact > 1:890017‑M2/24‑107 (MQ=255) cACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGAGCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCACACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTcccc < 1:545250/150‑1 (MQ=255) gccatggtgccggcggcaGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTccc > 1:1412854‑M2/19‑150 (MQ=255) ccATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGc > 1:887024/1‑150 (MQ=255) aTGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCaa < 1:937166/150‑1 (MQ=255) tGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGa > 2:130894/1‑75 (MQ=255) tGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGa < 1:130894/75‑1 (MQ=255) ccATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCAAGAAc < 1:1766575/150‑1 (MQ=255) cATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCAAGAACa > 2:246481/1‑150 (MQ=255) aTCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCAAGAACag > 2:117420/1‑150 (MQ=255) tCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCAAGAACaga < 1:246481/150‑1 (MQ=255) tCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCAAGAACaga < 2:257866/150‑1 (MQ=255) tCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCAAGAACaga < 2:1104727/150‑1 (MQ=255) gcgcCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCAAGAACAGAGCCGGc > 2:41938/1‑150 (MQ=255) | GTTCCTGGATAACCACACCCTCAGCGGTGGGGCGTTTGCCCGGCGGGTTGATCAGCAAACCCGCCATCTCGCCGAATGGCTGGGTGTACGTGACCATATTTCCACACATTCCGATGCCTGTGCCGCCGGCACCATGG‑‑CCATCGGCAGCGCCTATCGAGCGATCGCCCGTGGCGAGATCGACCTGGCGTTGTGTGGCGCGGTGGAGTTGATGGCCCATGAATTGTCCTACTACAGCTTTGATGGGCTGGGCGCACTCTGCCAGCGCGTGGACTTTTCCCCGCAAGAACAGAGCCGGC > NC_002947/3163661‑3163956 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |