| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3543953 = | 60 (0.820) | 6 (0.090) | 6/234 | NT | 9.8% | coding (1525/2607 nt) | PP_3130 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 3543976 = | 54 (0.780) | coding (1502/2607 nt) | PP_3130 | hypothetical protein | |||||
GATCATGCCGTCGCTGGTCAGCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTCA > NC_002947/3543804‑3544102 | gATCATGCCGTCGCTGGTCAGCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCAC > 2:981815‑M1/1‑150 (MQ=255) cccgccacagtgcgcgctacatgacggcggccaaggcctttgccaaacagtttgacctacccgcagacctgacctggcgtgcctgggagcatgggccgtcgaagctgttactcaacgagctggaacagcgcttcaatgccgacatgatCg < 1:981815‑M1/2‑1 (MQ=255) cgccacagtgcgcgctacatgacggcggccaaggcctttgccaaacagtttgacctacccgccgacctgacctggcgtgcctgggagcatgggccgtcgaagctgttgctcaacgagctggaacaacgcttcaatgccgacatgatCGcc < 1:98488‑M1/4‑1 (MQ=255) gCCGTCGCTGGTCAGCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCAC > 2:1184346‑M1/1‑150 (MQ=255) cGTCGCTGGTCAGCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGc > 1:796948/1‑150 (MQ=255) tGGTCAGCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATTGGGACTTTCACGCCAACGCTgcgcc > 1:869619/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCTGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCacg > 1:845471/1‑148 (MQ=255) aGCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCC > 1:1325159‑M1/1‑134 (MQ=255) aGCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGCGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCC < 2:1325159‑M1/134‑1 (MQ=255) gCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCCGTGAGCTAAGACCCTTCCCTCGCCAAGGGCGTTCAGTACCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTggg < 1:36216/150‑1 (MQ=255) cGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑Agtgggc > 2:1826364‑M2/1‑144 (MQ=255) cGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑Agtggg < 2:1174459‑M2/149‑6 (MQ=255) cGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑Agtggg > 1:1174459‑M2/1‑144 (MQ=255) gggTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑Agtgggcg < 2:382384‑M2/150‑8 (MQ=255) ggTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGa < 2:796948/150‑1 (MQ=255) ttcttcTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATc > 1:490908/1‑150 (MQ=255) cttctCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCAt > 2:98488/1‑150 (MQ=255) ttctCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTAGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCCCGCCCACGCTGCGCA‑G‑GTGGGCGCTCAtt > 1:1904024/1‑149 (MQ=255) tctcCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACAGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGt > 2:59413/1‑150 (MQ=255) tcCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCg > 2:1904336/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCgg > 2:1868/1‑150 (MQ=255) caaggcctttgccaaacagtttgacctacccgccgacctgacctggcgtgcctgggagcatgggccgtcgaagctgttgctcaacgagctggaacaacgcttcaatgccgacatgatCGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTggg > 2:501299‑M1/118‑138 (MQ=255) caaggcctttgccaaacagtttgacctacccgccgacctgacctggcgtgcctgggagcatgggccgtcgaagctgttgctcaacgagctggaacaacgcttcaatgccgacatgatCGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTggg < 1:501299‑M1/21‑1 (MQ=255) cAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCAC > 1:1449757‑M1/1‑117 (MQ=255) cAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCAC < 2:1449757‑M1/117‑1 (MQ=255) ccTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAg < 2:1689299/150‑1 (MQ=255) tCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTgc < 2:924797/115‑1 (MQ=255) tCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCgttgt < 1:1184346/150‑1 (MQ=255) tCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGACAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTgc > 1:924797/1‑115 (MQ=255) ccGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTcc > 2:1422307/1‑150 (MQ=255) ccGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTcc > 1:671675/1‑150 (MQ=255) tgtgGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGTGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACT‑TGCGCA‑Gcgtgggcgtgaaagtcc > 1:612629‑M2/1‑108 (MQ=255) tgtgGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACT‑TGCGCAGCgtgggcgtgaaagtcc < 2:612629‑M2/125‑17 (MQ=255) gtgGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGtt < 1:382384/150‑1 (MQ=255) ggggGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGAAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCAGTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGttta < 2:845471/150‑3 (MQ=255) gCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGc < 2:35490/150‑1 (MQ=255) gTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAg < 2:671970/138‑1 (MQ=255) gTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAg > 1:671970/1‑138 (MQ=255) gATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAg > 2:249571/1‑150 (MQ=255) aCATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCAGTACCCCCCGCGGGGCCGGTTGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTc < 2:1506414/150‑1 (MQ=255) cATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCg < 1:1868/150‑1 (MQ=255) aTCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGa > 1:284624/1‑150 (MQ=255) tCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGAc > 1:1489446/1‑150 (MQ=255) ccAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACT‑TGCGCA‑Gcgtgggcgtgaaagtccccatt < 1:1605973‑M2/110‑23 (MQ=255) ccAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACT‑TGCGCA‑Gcgtgggcgtgaaagtccccatt > 2:1605973‑M2/1‑88 (MQ=255) ccAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGc > 1:1385935/1‑150 (MQ=255) cAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACgg < 2:616215/148‑1 (MQ=255) cAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACgg > 1:616215/1‑148 (MQ=255) cAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGcc < 2:490908/150‑1 (MQ=255) cTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGc > 2:201021/1‑150 (MQ=255) tCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATc > 2:321301/1‑92 (MQ=255) tCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATc < 1:321301/92‑1 (MQ=255) gCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCa < 1:72573/92‑1 (MQ=255) gCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCa > 2:72573/1‑92 (MQ=255) gCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCAc > 1:1805158/1‑150 (MQ=255) gcgcTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCcag < 1:1904336/150‑1 (MQ=255) gcTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCcaggt > 1:1341745/1‑150 (MQ=255) cTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCcaggtc > 2:870983/1‑150 (MQ=255) tAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCcaggtca < 2:442886/150‑1 (MQ=255) aggCCCAGTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCGCGGCCACGCTGCTCA‑A‑GTGGGCGGTCATGTCGTGAGTGAAGCGTGGTTGCAGC‑‑TCGTGGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGGcaggtcag < 2:119664/148‑1 (MQ=255) cccATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCaggtcaggtc > 2:1786365/1‑150 (MQ=255) aTTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTcggc > 1:1346669/1‑150 (MQ=255) aTTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTcggc < 2:671675/150‑1 (MQ=255) tACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTcggcgg < 2:1341745/150‑1 (MQ=255) tACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTcggcgg < 2:1805158/150‑1 (MQ=255) tcaacgagctggaacaacgcttcaatgccgacatgatCGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGAt < 1:1086790‑M1/25‑1 (MQ=255) tcaacgagctggaacaacgcttcaatgccgacatgatCGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGAt > 2:1086790‑M1/38‑62 (MQ=255) ccGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTcc > 1:641394/1‑123 (MQ=255) ccGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTcc < 2:641394/123‑1 (MQ=255) cGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAAGAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTa > 1:1876909/1‑150 (MQ=255) cGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTa < 2:284624/150‑1 (MQ=255) tggtggTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGtt < 1:59413/150‑1 (MQ=255) gtggtAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTg < 1:97340/150‑1 (MQ=255) ggtAGCAATCGGGACTTTTACGTCCACGCTTCGCC‑A‑GTCGGCGAGCATGTCCGCAATAAAGCGTTCTTCCAGG‑‑CCCTTGAGCAACAGCTTCGACCGCCCATCCTCCCAGACACGCCAGATCAGATCGGCAGGCAGCTCAAAATGTTTCGc < 2:869619/150‑1 (MQ=255) cttcaatgccgacatgatCGCCCACT‑TGCGCA‑GCGTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGtt > 2:1821312‑M1/19‑144 (MQ=255) cttcaatgccgacatgatCGCCCACT‑TGCGCA‑GCGTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGtt < 1:1821312‑M1/126‑1 (MQ=255) aGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCaaa < 2:1904024/150‑1 (MQ=255) aaTGGGGACTTTCACGCCCACgctgcgcaagtgggcgtgaaagtccccattgctaccaccagcacctggggcggtaatgggcttagcgcactgccggcattgagcgttgg < 1:1605973‑M1/110‑90 (MQ=255) aaTGGGGACTTTCACGCCCACgctgcgcaagtgggcgtgaaagtccccattgctaccaccagcacctggggcggtaatgggcttagcgcactgccggcattgagcgttgg > 2:1605973‑M1/1‑21 (MQ=255) tGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCt > 1:692662/1‑150 (MQ=255) gggACTTTCACGCCCACGCTGCGCC‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTg > 1:1022116/1‑150 (MQ=255) gggACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAgg > 1:1216703/1‑145 (MQ=255) gggACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAgg < 2:1216703/145‑1 (MQ=255) ggACTTTCACGCCCACgctgcgcaagtgggcgtgaaagtccccattgctaccaccagcacctggggcggtaatgggcttagcgcactgccggcattgagcgttggcgatgtcatcgacgcccaca < 2:612629‑M1/125‑110 (MQ=255) ggACTTTCACGCCCACgctgcgcaagtgggcgtgaaagtccccattgctaccaccagcacctggggcggtaatgggcttagcacactgccggcattgagcgttggcgatgtcatcgacgcccaca > 1:612629‑M1/1‑16 (MQ=255) aCTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGgcc < 2:1264408/150‑1 (MQ=255) tttCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGgccgc > 1:91733/1‑150 (MQ=255) tttCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCACC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGgccgc > 2:150496/1‑150 (MQ=255) tttCACGCCCACACTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTCAGCAACAGCTTCAACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGCAGGTGAAACTGTTTGGCAAAGGCATTGgccgc > 1:950622/1‑150 (MQ=255) cACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGt < 2:1346669/150‑1 (MQ=255) aCGCCCACGCTGCGCA‑C‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCTTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTc > 2:21734/1‑150 (MQ=255) cGCCCACttgcgcagcgtgggcgtgaaagtccccattgctaccaccagcacctggggcggtaatgggcttagcgcactgccggcattgagcgttggcgatgtcatcgacgcccacagctacggcgacacaggccaactggagaagaaccc < 2:382384‑M1/150‑144 (MQ=255) cGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTG‑‑TTGTTTTTCAAGCAGACGGTGGGCAACAGCTTCGCAGATCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTCa < 1:435543/150‑1 (MQ=255) | GATCATGCCGTCGCTGGTCAGCGGGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCA‑A‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTCA > NC_002947/3543804‑3544102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |