| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3543953 = | 60 (0.820) | 6 (0.090) | 6/234 | NT | 9.8% | coding (1525/2607 nt) | PP_3130 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 3543976 = | 54 (0.780) | coding (1502/2607 nt) | PP_3130 | hypothetical protein | |||||
GGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTCATGTAGCGCGCACTGTGGCGGG > NC_002947/3543827‑3544123 | ggTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGa < 2:796948/150‑1 (MQ=255) ttcttcTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATc > 1:490908/1‑150 (MQ=255) cttctCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCAt > 2:98488/1‑150 (MQ=255) ttctCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTAGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCCCGCCCACGCTGCGCAG‑GTGGGCGCTCAtt > 1:1904024/1‑149 (MQ=255) tctcCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACAGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGt > 2:59413/1‑150 (MQ=255) tcCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCg > 2:1904336/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCgg > 2:1868/1‑150 (MQ=255) ccTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAg < 2:1689299/150‑1 (MQ=255) tCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCgttgt < 1:1184346/150‑1 (MQ=255) aacagtttgacctacccgccgacctgacctggcgtgcctgggagcatgggccgtcgaagctgttgctcaacgagctggaacaacgcttcaatgccgacatgatcgcccacgctgcgcaagtgggcgATCATGTCGGCATTGAAg > 2:1821312‑M2/127‑144 (MQ=255) aacagtttgacctacccgccgacctgacctggcgtgcctgggagcatgggccgtcgaagctgttgctcaacgagctggaacaacgcttcaatgccgacatgatcgcccacgctgcgcaagtgggcgATCATGTCGGCATTGAAg < 1:1821312‑M2/18‑1 (MQ=255) ccGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTcc > 2:1422307/1‑150 (MQ=255) ccGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTcc > 1:671675/1‑150 (MQ=255) gtgGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGtt < 1:382384/150‑1 (MQ=255) ggggGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGAAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCAGTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGttta < 2:845471/150‑3 (MQ=255) gCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGc < 2:35490/150‑1 (MQ=255) gTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAg > 1:671970/1‑138 (MQ=255) gTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAg < 2:671970/138‑1 (MQ=255) gATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAg > 2:249571/1‑150 (MQ=255) aCATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCAGTACCCCCCGCGGGGCCGGTTGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTc < 2:1506414/150‑1 (MQ=255) cATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCg < 1:1868/150‑1 (MQ=255) aTCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGa > 1:284624/1‑150 (MQ=255) tCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGAc > 1:1489446/1‑150 (MQ=255) ccAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGc > 1:1385935/1‑150 (MQ=255) cAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACgg < 2:616215/148‑1 (MQ=255) cAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACgg > 1:616215/1‑148 (MQ=255) cAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGcc < 2:490908/150‑1 (MQ=255) cTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGc > 2:201021/1‑150 (MQ=255) tCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATc < 1:321301/92‑1 (MQ=255) tCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATc > 2:321301/1‑92 (MQ=255) gCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCa < 1:72573/92‑1 (MQ=255) gCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCa > 2:72573/1‑92 (MQ=255) gCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCAc > 1:1805158/1‑150 (MQ=255) gcgcTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCcag < 1:1904336/150‑1 (MQ=255) gcTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCcaggt > 1:1341745/1‑150 (MQ=255) cTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCcaggtc > 2:870983/1‑150 (MQ=255) tAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCcaggtca < 2:442886/150‑1 (MQ=255) aggCCCAGTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCGCGGCCACGCTGCTCAA‑GTGGGCGGTCATGTCGTGAGTGAAGCGTGGTTGCAGC‑‑TCGTGGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGGcaggtcag < 2:119664/148‑1 (MQ=255) cccATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCaggtcaggtc > 2:1786365/1‑150 (MQ=255) aTTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTcggc < 2:671675/150‑1 (MQ=255) aTTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTcggc > 1:1346669/1‑150 (MQ=255) tACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTcggcgg < 2:1341745/150‑1 (MQ=255) tACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTcggcgg < 2:1805158/150‑1 (MQ=255) tcaacgagctggaacaacgcttcaatgccgacatgatCGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGAt < 1:1086790‑M1/25‑1 (MQ=255) tcaacgagctggaacaacgcttcaatgccgacatgatCGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGAt > 2:1086790‑M1/38‑62 (MQ=255) ccGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTcc > 1:641394/1‑123 (MQ=255) ccGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTcc < 2:641394/123‑1 (MQ=255) cGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAAGAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTa > 1:1876909/1‑150 (MQ=255) cGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTa < 2:284624/150‑1 (MQ=255) tggtggTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGtt < 1:59413/150‑1 (MQ=255) gtggtAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTg < 1:97340/150‑1 (MQ=255) ggtAGCAATCGGGACTTTTACGTCCACGCTTCGCCA‑GTCGGCGAGCATGTCCGCAATAAAGCGTTCTTCCAGG‑‑CCCTTGAGCAACAGCTTCGACCGCCCATCCTCCCAGACACGCCAGATCAGATCGGCAGGCAGCTCAAAATGTTTCGc < 2:869619/150‑1 (MQ=255) cttcaatgccgacatgatCGCCCACT‑TGCGCAGCGTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGtt > 2:1821312‑M1/19‑144 (MQ=255) cttcaatgccgacatgatCGCCCACT‑TGCGCAGCGTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGtt < 1:1821312‑M1/126‑1 (MQ=255) aGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCaaa < 2:1904024/150‑1 (MQ=255) tGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCt > 1:692662/1‑150 (MQ=255) gggACTTTCACGCCCACGCTGCGCCA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTg > 1:1022116/1‑150 (MQ=255) gggACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAgg > 1:1216703/1‑145 (MQ=255) gggACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAgg < 2:1216703/145‑1 (MQ=255) aCTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGgcc < 2:1264408/150‑1 (MQ=255) tttCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGgccgc > 1:91733/1‑150 (MQ=255) tttCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCACC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGgccgc > 2:150496/1‑150 (MQ=255) tttCACGCCCACACTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTCAGCAACAGCTTCAACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGCAGGTGAAACTGTTTGGCAAAGGCATTGgccgc > 1:950622/1‑150 (MQ=255) cACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGt < 2:1346669/150‑1 (MQ=255) atcgcccacttgcgcagcgtgggcgATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGa > 2:1086790‑M2/26‑62 (MQ=255) atcgcccacttgcgcagcgtgggcgATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGa < 1:1086790‑M2/37‑1 (MQ=255) aCGCCCACGCTGCGCAC‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCTTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTc > 2:21734/1‑150 (MQ=255) cGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTG‑‑TTGTTTTTCAAGCAGACGGTGGGCAACAGCTTCGCAGATCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTCa < 1:435543/150‑1 (MQ=255) cccacttgcgcagcgtgggcgATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTg > 2:501299‑M2/22‑138 (MQ=255) cccacttgcgcagcgtgggcgATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTg < 1:501299‑M2/117‑1 (MQ=255) CCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAATGCCTTGGCCGCCGTCATGt < 2:77757‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTCATGTAGc > 2:1489446‑M1/1‑150 (MQ=255) ggcgATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTCATGTAGCGCGCACTGTGGCg < 1:98488‑M2/146‑1 (MQ=255) cgATCATGTCGGCATTGAAGCGCTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGTAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCTGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTCATGTAGCGCGCACTGTGGCggg < 1:981815‑M2/148‑1 (MQ=255) | GGTTCTTCTCCAGTTGGCCTGTGTCGCCGTAGCTGTGGGCGTCGATGACATCGCCAACGCTCAATGCCGGCAGTGCGCTAAGCCCATTACCGCCCCAGGTGCTGGTGGTAGCAATGGGGACTTTCACGCCCACGCTGCGCAA‑GTGGGCGATCATGTCGGCATTGAAGCGTTGTTCCAGC‑‑TCGTTGAGCAACAGCTTCGACGGCCCATGCTCCCAGGCACGCCAGGTCAGGTCGGCGGGTAGGTCAAACTGTTTGGCAAAGGCCTTGGCCGCCGTCATGTAGCGCGCACTGTGGCGGG > NC_002947/3543827‑3544123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |