New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3797037 = | 78 (1.070) | 6 (0.090) | 6/236 | NT | 7.4% | coding (1000/1449 nt) | vdh | vanillin dehydrogenase |
? | NC_002947 | 3797067 = | 76 (1.090) | coding (970/1449 nt) | vdh | vanillin dehydrogenase |
CACCGGGCCGAAGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACAT > NC_002947/3796888‑3797184 | cggtgcctacttcaaccaggggcagatctgcatgtccaccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcgg > 2:534885‑M1/150‑150 (MQ=255) tgcctacttcaaccaggggcagatctgcatgtccaccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcggctc < 2:1886327‑M1/4‑1 (MQ=255) cctacttcaaccaggggcagatctgcatgtccaccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcgGCTCgc < 1:1495142‑M1/6‑1 (MQ=255) ccGAAGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccg > 1:201212/1‑150 (MQ=255) cGAAGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccgg > 2:1495142/1‑150 (MQ=255) gAAGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccggc < 1:1832369/150‑1 (MQ=255) aaGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGTAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccggcc > 1:152325/1‑150 (MQ=255) ctcGCGGTACAGGCGCATGCTGGAATAGACGTTGTTGAGACCGGTGGGTTGCAGGTAGCTGCCGTCCAGCTGGCCGCCGCGGACCAGGCGGGCGCCCTGGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCcgctgcgct > 2:1191080/1‑150 (MQ=255) gcgGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGAc > 2:55272/1‑150 (MQ=255) gcgGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGAc < 2:1237938/150‑1 (MQ=255) gcgGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCAAAGCCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGAc < 1:448410/150‑1 (MQ=255) atctgcatgtccaccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcgGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGc < 1:92085‑M1/26‑1 (MQ=255) atctgcatgtccaccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcgGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGc > 2:92085‑M1/125‑150 (MQ=255) ggCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGcgagc > 1:178620/1‑150 (MQ=255) caccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcggc > 1:224893‑M1/114‑115 (MQ=255) caccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcggc < 2:224893‑M1/2‑1 (MQ=255) accgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcgGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCAcc < 2:1570991‑M1/38‑1 (MQ=255) cgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcgGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGa > 1:1570991‑M1/111‑150 (MQ=255) gCATCGACGTTGTCGAGTAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAg < 2:152325/150‑1 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gAGCAAGGTCGGTTGCAGGATACTGCCTTCAAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCgg > 2:746788/1‑150 (MQ=255) aaGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCgg > 2:135832/2‑150 (MQ=255) aGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGGTCACCAGGCTCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCAc > 2:1341410/1‑150 (MQ=255) ggTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCAcc > 2:1545701/1‑150 (MQ=255) ggTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCAcc > 2:602286/1‑150 (MQ=255) 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aTCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGCACAGCGAAATGCGTCTCGAGGTGCTGGCTTGCGGAGCACCTGCCCGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAgg > 1:1493262/1‑150 (MQ=255) aGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGgcgc < 2:1847117/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGaaa < 2:253272/116‑1 (MQ=255) gTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGaaa > 1:253272/1‑116 (MQ=255) tGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTc > 1:1421327/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTc > 2:1623002/1‑150 (MQ=255) gCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCg < 1:1623002/150‑1 (MQ=255) ccTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCgg > 1:788394/1‑150 (MQ=255) cTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGt < 1:330503/150‑1 (MQ=255) cTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGt < 2:1113227/150‑1 (MQ=255) ttGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTg < 1:1702461/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACAt < 1:746788/150‑1 (MQ=255) | CACCGGGCCGAAGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACAT > NC_002947/3796888‑3797184 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |