New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3797037 = | 78 (1.070) | 6 (0.090) | 6/236 | NT | 7.4% | coding (1000/1449 nt) | vdh | vanillin dehydrogenase |
? | NC_002947 | 3797067 = | 76 (1.090) | coding (970/1449 nt) | vdh | vanillin dehydrogenase |
CTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTGGTTGAAGTAGGCACCG > NC_002947/3796925‑3797215 | accgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcgGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCAcc < 2:1570991‑M1/38‑1 (MQ=255) cgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcgGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGa > 1:1570991‑M1/111‑150 (MQ=255) gCATCGACGTTGTCGAGTAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAg < 2:152325/150‑1 (MQ=255) aTCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCACTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGt > 2:604443/1‑150 (MQ=255) cGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGc < 1:975908/150‑1 (MQ=255) cGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGc > 2:1596601/1‑150 (MQ=255) cGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGc < 2:1557779/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGc < 1:1270158/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGc < 1:1596601/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGc < 2:178620/150‑1 (MQ=255) gAGCAAGGTCGGTTGCAGGATACTGCCTTCAAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCgg > 2:746788/1‑150 (MQ=255) aaGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCgg > 2:135832/2‑150 (MQ=255) aGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGGTCACCAGGCTCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCAc > 2:1341410/1‑150 (MQ=255) ggTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCAcc > 2:1545701/1‑150 (MQ=255) ggTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCAcc > 2:602286/1‑150 (MQ=255) ggTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGCGCTGGCTTGCGGATCAcc < 1:1800436/150‑1 (MQ=255) gTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGcgagccga < 1:549568/121‑1 (MQ=255) gTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGcgagccga > 2:549568/1‑121 (MQ=255) gTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCt < 2:1845464/150‑1 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ccgccgCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGc < 1:1545701/150‑1 (MQ=255) cgccgcTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCt > 2:728781/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTcgacg > 1:587589/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGaa > 1:5290/1‑150 (MQ=255) aGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGaaa < 2:587589/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gcgcTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACAt < 1:746788/150‑1 (MQ=255) TCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAg < 2:445124‑M1/150‑1 (MQ=255) gctggtcagcgcagcggccggcgagcCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGAt > 2:92085‑M2/27‑150 (MQ=255) gctggtcagcgcagcggccggcgagcCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGAt < 1:92085‑M2/124‑1 (MQ=255) GCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTc < 2:55713‑M1/93‑1 (MQ=255) GCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTc > 1:55713‑M1/1‑93 (MQ=255) cggccgCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGGGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCt > 1:75437/1‑150 (MQ=255) cggccgCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGaaa < 2:312931/98‑1 (MQ=255) cggccgCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGaaa > 1:312931/1‑98 (MQ=255) gccgCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCCAAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGc < 1:1022050/150‑1 (MQ=255) gccgCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGc < 1:57361/150‑1 (MQ=255) tgcgctgACCAGCGAGGCGAGCACCGATGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTg > 2:1878574/1‑150 (MQ=255) gcgctgACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCATGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTgg < 1:135832/150‑1 (MQ=255) cgctgACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGaaa < 1:562301/89‑1 (MQ=255) cgctgACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGaaa > 2:562301/1‑89 (MQ=255) cgctgACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTGGt < 2:1493262/150‑1 (MQ=255) gctgACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTGGtt < 2:1421327/150‑1 (MQ=255) tgACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTGGTTGa > 2:1594765/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATg < 2:478128/127‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATg > 1:478128/1‑127 (MQ=255) gcgagcCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTGGTTGAAGTAgg < 1:1495142‑M2/144‑1 (MQ=255) gagcCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTGGTTGAAGTAGGCa < 2:1886327‑M2/146‑1 (MQ=255) gcCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTg < 2:224893‑M2/113‑1 (MQ=255) gcCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTg > 1:224893‑M2/3‑115 (MQ=255) cCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTGGTTGAAGTAGGCACCg > 2:534885‑M2/2‑150 (MQ=255) cgagcACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCATATCt > 1:1518020/1‑126 (MQ=255) cgagcACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCATATCt < 2:1518020/126‑1 (MQ=255) | CTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGCAGATCTGCCCCTGGTTGAAGTAGGCACCG > NC_002947/3796925‑3797215 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |