| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
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aGGAAATTGATGATGTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGCCGCTGCTGTAGCCCGTGGCAATGCCATgg > 2:13082/1‑150 (MQ=255) ggAAATTGATGATGTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGTCGCTGCTGacccatggcattgccacgggct < 2:196152‑M1/150‑23 (MQ=255) aaaTTGATGATGTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGCCGCTGCTGTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTc > 2:1856599‑M2/1‑149 (MQ=255) tgatgaTGTCGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGGCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGTCGCTGCTGacccatggcattgccacgggctacagca < 1:893511‑M1/150‑29 (MQ=255) atgTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGCCGCTGCTGTAGCCCGTGGCAAt < 1:444542/131‑1 (MQ=255) 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cgcTGCTGTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCgg > 2:1211960/1‑124 (MQ=255) gctgctGTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTcagcagcggcggcgtgcagcgcatcgagcgcggcatcaccacataccggcagaacgctctgggtcagcccgacaattcattcctggacagc > 1:261840‑M2/1‑30 (MQ=255) gctgctGTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTcagcagcggcggcgtgcagcgcatcgagcgcggcatcaccacataccggcagaacgctctgggtcagcccgacaattcattcctggacagc < 2:261840‑M2/121‑92 (MQ=255) ctgctgTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCgg < 2:1332543/150‑1 (MQ=255) tgctgTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTcagcagcgacggcgtgcagcgcatcgagcgcggcatcaccacataccggcagaacgctctgggtcagcccgacaattcattcctggccagcgagacgctgcatcagtcggccgacatcatca < 1:893511‑M2/150‑123 (MQ=255) ctgacccatggcattgccacgggctacagcagcgacggcgtgcagcgcatcgagcgcggcatcaccacataccggcagaacgctctgg < 2:653861‑M1/88‑86 (MQ=255) ctgacccatggcattgccacgggctacagcagcgacggcgtgcagcgcatcgagcgcggcatcaccacataccggcagaacgctctgg > 1:653861‑M1/1‑3 (MQ=255) ctgTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAg < 1:675817/150‑1 (MQ=255) gacccatggcattgccacgggctacagcagcggcggcgtgcagcgcatcgagcgcggcatcaccacataccggcagaacgctctgggtcagcccgacaattcattcctggacagcgagacgctgcatcagtcggcctacatcatcaattt > 2:1856599‑M1/1‑1 (MQ=255) gacccatggcattgccacgggctacagcagcggcggcgtgcagcgcatcgagcgcggcatcaccacataccggcagaacgctctgggt < 2:709696‑M1/88‑88 (MQ=255) gacccatggcattgccacgggctacagcagcggcggcgtgcagcgcatcgagcgcggcatcaccacataccggcagaacgctctgggt > 1:709696‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTGCTGGTGATTCGCCCCTTAAGGAAATTGATGATGTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGCCGCTGCTGTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGC > NC_002947/4393808‑4394106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |