New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 4393980 | 82 (1.200) | coding (1036/1488 nt) | PP_3869 | sheath protein |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
AAATTGATGATGTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGCCGCTGCTGTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGCATAGCCAGCCGCTTGACGCCAC > NC_002947/4393832‑4394128 | atgTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGCCGCTGCTGTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGAc < 1:220707/150‑1 (MQ=255) gTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGCCGCTGCTGTAGCCCGTGGCACTGACATGGGAAAGCAGGGACTg > 2:1379998/1‑150 (MQ=255) gTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGCCGCTGCTGTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTg < 1:1915072/150‑1 (MQ=255) 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gacccatGGCATTGCCACGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTGGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGCTGAGCACCGCAGTGAGGGCGACAt > 1:521294/7‑150 (MQ=255) aGCCCGTGGCAATGCCATGGGTcagcagcgacggcgtgcagcgcatcgagcgcggcatcaccacataccggcagaacgctctgggtcagcccgacaattcattcctggacagcgagacgctgcatcagtcggcctacatcatcaatttcc < 2:196152‑M2/150‑129 (MQ=255) cccGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCGGCCACGCCAGGATGATAATAGCACCCGACGGCTCCGGTTGGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGCATag > 1:1493780/1‑150 (MQ=255) cccGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGCATag < 2:1271642/150‑1 (MQ=255) ggCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGCATagccagc < 2:1172657/150‑1 (MQ=255) aaTGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGCATAGCCAGCCGc > 1:1602259/1‑150 (MQ=255) tGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGAAGGCATAGCCAGCCTCtt < 1:537127/150‑1 (MQ=255) cATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGAGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGCATAGCCAGCCGCTTGAc < 1:712777/150‑1 (MQ=255) aTGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGCATAGCCAGCCGCTTGACg < 2:770290/150‑1 (MQ=255) gTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGCATAGCCAGCCGCTTGACGCcac > 1:1165546/1‑150 (MQ=255) tCAGCAGCGACTGGCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGc > 1:347327/1‑127 (MQ=255) tCAGCAGCGACTGGCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGc < 2:347327/127‑1 (MQ=255) tCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCa > 2:1353863/1‑116 (MQ=255) | AAATTGATGATGTAGGCCGACTGATGCAGCGTCTCGCTGTCCAGGAATGAATTGTCGGGCTGACCCAGAGCGTTCTGCCGGTATGTGGTGATGCCGCGCTCGATGCGCTGCACGCCGCCGCTGCTGTAGCCCGTGGCAATGCCATGGGTCAGCAGCGACTGCCGCTCGGTCAGCATGAAGCGATCACCCGACGGCGCCGGGGTGATGCCGTTGAGCTCACCGGTTTGCGTCGGCCGCGCCGGGTCAGCCGAGATGAACACCGCAGTGCGGGAGGCATAGCCAGCCGCTTGACGCCAC > NC_002947/4393832‑4394128 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |