| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4682588 | 68 (1.000) | coding (832/1431 nt) | mltD | membrane‑bound lytic murein transglycosylase D | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CGAGCGCAACGAAAGGCTCGGCCTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCTCAACCCGGCATTCAAGAAACGCATGACCGTCGATGGCCCGAAACAGCTGCTG > NC_002947/4682419‑4682716 | cGAGCGCAACGAAAGGCTCGGCCTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCaa < 2:1941316/150‑1 (MQ=255) cgcAACGAAAGGCTCGGCCTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGaa < 1:852465/150‑1 (MQ=255) gcAACGAAAGGCTCGGCCTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGAGGTGTCCACGCAAGAAGCCTATGGTGTCCATCTCCCCCCGATCGCCAACGAAc < 2:1529183/150‑1 (MQ=255) cAACGAAAGGCTCGGCCTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCCCCCCGATCGCCAACGAAcc < 2:437972/150‑1 (MQ=255) cAACGAAAGGCTCGGCCTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCTAACGAAcc < 2:1392643/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCGAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGt > 1:1039501‑M2/1‑149 (MQ=255) gCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGtggc > 2:1100167‑M2/1‑146 (MQ=255) ccgacTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGt > 2:410621‑M2/1‑141 (MQ=255) ccgacTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGt < 1:410621‑M2/142‑2 (MQ=255) cgacTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAccgcttcaaagtacggttcgttggcgatcgg < 2:1239564‑M1/150‑32 (MQ=255) gacTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAAt > 2:3249/1‑150 (MQ=255) ctactGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGa < 2:1262746/150‑1 (MQ=255) actGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGAcc > 2:1245373/1‑150 (MQ=255) tGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGtggc < 1:1271167‑M2/137‑5 (MQ=255) tGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGtggc > 2:1271167‑M2/1‑133 (MQ=255) gAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCt > 2:1631818/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGAcc > 1:177711/1‑150 (MQ=255) acaGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGt > 1:1052067/1‑150 (MQ=255) 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ccGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGAcc > 2:1695914/1‑122 (MQ=255) ccGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGAcc < 1:1695914/122‑1 (MQ=255) tgcaCTACGTACCCAATAGGCTGGCACGGTCGCAGGTGCTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTg < 2:102564/147‑1 (MQ=255) cTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTGGCGGGCTTTGCCag > 2:1379414/1‑149 (MQ=255) gTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGaa < 1:1274399/93‑1 (MQ=255) gTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGaa > 2:1274399/1‑93 (MQ=255) 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aCCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATcga > 2:783541/1‑150 (MQ=255) aCCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATcga < 2:1820881/150‑1 (MQ=255) cccAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATcgac < 1:1379414/150‑1 (MQ=255) cAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATcgacga < 1:1257918/150‑1 (MQ=255) aaGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCgacgag > 1:8803/1‑150 (MQ=255) 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gCCAACGAGCCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATc > 2:1712704/1‑96 (MQ=255) gCCAACGAGCCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATc < 1:1712704/96‑1 (MQ=255) ccAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCTCAACCCGGCATTCAAGAAACGCATGACCGTCGATGGCCCGAAACAgctgc > 2:1178300/1‑150 (MQ=255) cAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCTCAACCCGGCATTCAAGAAACGCATGACCGTCGATGGCCCGAAACAgctgct > 1:1344734/1‑150 (MQ=255) accgcttcaaagtacggttcgttggcgatcggggtgagattgacaccataggcttctggcgtggacaccacctgcgacagtgccagcaacttgggtacgtagtcgcgggtttcctgtggcagcggcaggttccagtagtcgg < 1:410621‑M1/142‑142 (MQ=255) accgcttcaaagtacggttcgttggcgatcggggtgagattgacaccataggcttctggcgtggacaccacctgcgacagtgccagcaacttgggtacgtagtcgcgggtttcctgtggcagcggcaggttccagtagtcgg > 2:410621‑M1/1‑1 (MQ=255) accgcttcaaagtacggttcgttggcgatcggggtgagattgacaccataggcttctggcgtggacaccacctgcgacagtgccagcaactcgggtacgtagtcgcgggtttcctgtggcagcggcaggttccagtagtcggtcggcagg > 1:1039501‑M1/1‑1 (MQ=255) aaCGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATTATCGTCTGGACATTTTCCTGGTCGGGGCCTTTTCCAACATCGAAGAGGACGAGGTGATCCAGCTCAACCGGGCATTCTAGAAACGTATGACGGTCGATGGCCCGTAAAAGatgctg > 2:829843/1‑150 (MQ=255) aaCGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCt > 2:1423462/1‑98 (MQ=255) aaCGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCt < 1:1423462/98‑1 (MQ=255) aaCGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCTCAACCCGGCATTCAAGAAACGCATGACCGTCGATGGCCCGAAACAGctgctg < 1:1178300/150‑1 (MQ=255) aaCGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCTCAACCCGGCATTCAAGAAACGCATGACCGTCGATGGCCCGAAACAGctgctg < 2:8803/150‑1 (MQ=255) aaCGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCTCAACCCGGCATTCAAGAAACGCATGACCGTCGATGGCCCGAAACAGctgctg > 1:1811911/1‑150 (MQ=255) | CGAGCGCAACGAAAGGCTCGGCCTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCTCAACCCGGCATTCAAGAAACGCATGACCGTCGATGGCCCGAAACAGCTGCTG > NC_002947/4682419‑4682716 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |