New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 4682588 | 68 (1.000) | coding (832/1431 nt) | mltD | membrane‑bound lytic murein transglycosylase D |
CCTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTGCCAACATCGACGAGGACGAGCTGATCCAGCTCAACCCGGCATTCAAGAAACGCATGACCGTCGATGGCCCGAAACAGCTGCTGGTGCCCACCGCCAAGGC > NC_002947/4682440‑4682733 | ccTGCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCGAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGt > 1:1039501‑M2/1‑149 (MQ=255) gCCGACCGACTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGtggc > 2:1100167‑M2/1‑146 (MQ=255) ccgacTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGt > 2:410621‑M2/1‑141 (MQ=255) ccgacTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGt < 1:410621‑M2/142‑2 (MQ=255) gacTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAAt > 2:3249/1‑150 (MQ=255) gacTACTGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAAt < 2:1062033/150‑1 (MQ=255) ctactGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGa < 2:1262746/150‑1 (MQ=255) actGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGAcc > 2:1245373/1‑150 (MQ=255) tGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGtggc < 1:1271167‑M2/137‑5 (MQ=255) tGGAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGtggc > 2:1271167‑M2/1‑133 (MQ=255) gAACCTGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCt > 2:1631818/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGCCACAGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGAcc > 1:177711/1‑150 (MQ=255) acaGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGt > 1:1052067/1‑150 (MQ=255) acaGGAAACCCGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGt > 1:882251/1‑150 (MQ=255) ccGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGAcc < 1:1695914/122‑1 (MQ=255) ccGCGACTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGAcc > 2:1695914/1‑122 (MQ=255) tgcaCTACGTACCCAATAGGCTGGCACGGTCGCAGGTGCTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCTTTg < 2:102564/147‑1 (MQ=255) cTACGTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTGGCGGGCTTTGCCag > 2:1379414/1‑149 (MQ=255) gTACCCAAGTTGCTGGCACTGTCGCAGGTGGTGTCCACGCCAGAAGCCTATGGTGTCAATCTCACCCCGATCGCCAACGAACCGTACTTTGAAGCGGTGGCGATCAATGACCGTCTGGACCTTTCCCGGGTCGCGGCCt > 1:1317091/1‑139 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |