| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4845374 = | 99 (1.360) | 6 (0.090) | 6/238 | NT | 6.1% | coding (79/2475 nt) | PP_4261 | cation‑transporting P‑type ATPase |
| ? | NC_002947 | 4845403 = | 91 (1.300) | coding (108/2475 nt) | PP_4261 | cation‑transporting P‑type ATPase | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTAC > NC_002947/4845225‑4845523 | ccAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGcc > 2:1625417/1‑150 (MQ=255) gtttgctgcacgtcgctgcggtcgtacagggccagttcgtcctgtagttgtttgggcagggcttcggggttggcgctgttgtcgctgcggtgttggtagtaatgttccaggcctccagcgacgatcgactcggccaccgcctgaCagcgg < 1:1645646‑M1/6‑3 (MQ=255) tGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCg > 2:307213/1‑150 (MQ=255) aCGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCACCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCCCCGCCGTGGTGCTCGGCCATCCCCCGc > 2:293982/1‑150 (MQ=255) cATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGt > 2:1824001/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTACTCGGCCAGCCCCGGCAGTTct < 2:1640168/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCTGCCGGCAGCCGCTTCCCCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctg < 1:353936/150‑1 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctgc < 1:172526/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCtgctgc < 2:49094/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCACCCACTGCGCCCTTCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCtgctgc < 1:1691232/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCTACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCt > 1:1594594/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCt < 1:1625417/150‑1 (MQ=255) ccACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAgg < 2:585363/150‑1 (MQ=255) cacaGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc < 2:1054963/150‑1 (MQ=255) acaGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCg > 1:1185085/1‑150 (MQ=255) acaGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCg > 2:853256/1‑150 (MQ=255) aGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGt < 2:877659/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTACCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGc < 1:233920/150‑1 (MQ=255) 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ccGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGc < 1:307213/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGcc < 2:1429956/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGc < 1:1601582/92‑1 (MQ=255) gCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGc > 2:1601582/1‑92 (MQ=255) aGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCaaa < 2:1227387/150‑1 (MQ=255) aGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCaaa < 1:595211/150‑1 (MQ=255) ccGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCGGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAaaca > 1:321150/1‑150 (MQ=255) gCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAaacaac < 2:823104/150‑1 (MQ=255) cTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAAc < 2:1445626/92‑1 (MQ=255) tCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTAc < 1:1831907/150‑1 (MQ=255) tCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTAc < 1:641169/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAg < 1:1554539/150‑1 (MQ=255) cgccgTTATCCTCCGCCCTCCCCGGCAGCGCTGCTGCCGTGGATGTCAGGCGGTAGCCGCGCCGATCGTGCCTGGAGGCCTGGCACATTACTACGAACACCGCAGCTACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACACCTACAGGa > 2:298451/1‑150 (MQ=255) tGGTCGTCGTCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACCCCGCAGCCACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAAc < 1:293982/150‑1 (MQ=255) tGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAAc < 1:29791/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGcc < 2:1470287/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGcc > 1:521271/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCACTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGcc < 2:1185085/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGt < 1:892860/150‑1 (MQ=255) CAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGCCGCTGCTGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTAc > 1:1476825‑M1/1‑150 (MQ=255) | CCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTAC > NC_002947/4845225‑4845523 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |