New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4845374 = | 99 (1.360) | 6 (0.090) | 6/238 | NT | 6.1% | coding (79/2475 nt) | PP_4261 | cation‑transporting P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 4845403 = | 91 (1.300) | coding (108/2475 nt) | PP_4261 | cation‑transporting P‑type ATPase |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCGACGTGCAGCAAAC > NC_002947/4845258‑4845546 | cacaGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc < 2:1054963/150‑1 (MQ=255) acaGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCg > 2:853256/1‑150 (MQ=255) acaGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCg > 1:1185085/1‑150 (MQ=255) aGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGt < 2:877659/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTACCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGc < 1:233920/150‑1 (MQ=255) ccTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAg < 2:1805482/150‑1 (MQ=255) cTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGt > 2:1426285/1‑150 (MQ=255) cTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGt > 2:1554539/1‑150 (MQ=255) cTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGt > 1:1901244/1‑150 (MQ=255) tATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGt > 1:1677831/1‑149 (MQ=255) tGCCTGAGCAGTGTCTGTCCTATGACCCACCCGTCCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGAtc < 2:251746/150‑1 (MQ=255) tGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGAtc < 1:1479794/150‑1 (MQ=255) gcagggcttcggggttggcgctgttgtcgctgcggtgttggtagtaatgttccaggcctccagcgacgatcgactcggccaccgcctgaCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGt > 2:1225193‑M1/90‑127 (MQ=255) gcagggcttcggggttggcgctgttgtcgctgcggtgttggtagtaatgttccaggcctccagcgacgatcgactcggccaccgcctgaCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGt < 1:1225193‑M1/38‑1 (MQ=255) tCTGTCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGa < 2:1358000/130‑1 (MQ=255) tCTGGCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGa > 1:1358000/1‑130 (MQ=255) tCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGcc > 2:29791/1‑150 (MQ=255) cTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCt < 2:1455328/150‑1 (MQ=255) gACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATta < 1:1741402/150‑1 (MQ=255) aCCCAACCGACCTCCTTCTACCTCTTCGCCCTTCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATtac < 2:1380150/150‑1 (MQ=255) cccAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATtact > 1:1380150/1‑150 (MQ=255) cccAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATtact > 1:954807/1‑150 (MQ=255) ccAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATtacta > 1:331223/1‑150 (MQ=255) ccaCCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATtactac < 1:853256/148‑1 (MQ=255) 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cTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGcc < 2:1470287/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCACTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGcc < 2:1185085/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTAATACCAACCCCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGcc < 2:449276/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGt < 1:892860/150‑1 (MQ=255) AGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGacaac > 1:478405‑M1/1‑95 (MQ=255) AGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGacaac < 2:478405‑M1/95‑1 (MQ=255) ccggggcagcagaactgccggggctgTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACa < 1:1034344‑M2/42‑1 (MQ=255) ccggggcagcagaactgccggggctgTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACa > 2:1034344‑M2/27‑68 (MQ=255) CCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGaa > 1:1661387‑M1/1‑66 (MQ=255) CCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGaa < 2:1661387‑M1/66‑1 (MQ=255) CCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGAc > 1:1431323‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCTCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCg > 1:1875091/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTAAGGCGTTGGCCTAGTCGATCTTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAg > 1:1500278/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACa > 1:1586479/1‑121 (MQ=255) aGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACa < 2:1586479/121‑1 (MQ=255) aGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCg > 2:1147442/1‑150 (MQ=255) tCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCGACg > 2:1638669/1‑150 (MQ=255) ctgctgCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCTCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCGACGt < 2:1875091/150‑1 (MQ=255) ctgctgCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCGACGt < 2:1500278/150‑1 (MQ=255) ctgcCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCGACGTgca < 1:1147442/150‑1 (MQ=255) tgcCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCGACGTgcag < 1:1495792/150‑1 (MQ=255) ccccGGCTGTCAGGAGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCGACGTgcagca > 2:1629980/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCGACGTGCAGCaaa > 2:1880927/1‑150 (MQ=255) | CCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCCGAGTCGATCGTCGCTGGAGGCCTGGAACATTACTACCAACACCGCAGCGACAACAGCGCCAACCCCGAAGCCCTGCCCAAACAACTACAGGACGAACTGGCCCTGTACGACCGCAGCGACGTGCAGCAAAC > NC_002947/4845258‑4845546 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |