| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4931718 | 56 (0.770) | 4 (0.060) | 4/234 | NT | 6.7% | coding (545/741 nt) | fliA | RNA polymerase sigma 28 factor |
| ? | NC_002947 | = 4931729 | 58 (0.840) | coding (534/741 nt) | fliA | RNA polymerase sigma 28 factor | |||||
TTGGCTGTGCAACTGGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAATCATC > NC_002947/4931570‑4931866 | ttGGCTGTGCAACTGGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGaa < 2:1200610/150‑1 (MQ=255) gCTGTGCAACTGGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGaa > 1:274342/1‑147 (MQ=255) gCTGTGCAACTGGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGaa < 2:274342/147‑1 (MQ=255) cTGTGCAACTGGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAgcgc < 1:1517414/150‑1 (MQ=255) tgtgCAACTGGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAg < 1:424614/146‑1 (MQ=255) tgtgCAACTGGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAg > 2:424614/1‑146 (MQ=255) ggCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtcca > 2:208517‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCACTGAAGTTCAGCTCTGTGTCGTAGTACAGCCCCCGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtcca > 1:1400756‑M2/1‑146 (MQ=255) tGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggc > 2:1398108‑M2/1‑143 (MQ=255) tGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggc < 1:1398108‑M2/150‑8 (MQ=255) ccGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCcgcg > 2:1218055/1‑150 (MQ=255) gcgACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCcgcgcg > 1:1173854/1‑150 (MQ=255) gACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATCGCCTCGGGCAGGGCATCCTGGAAGCGCTCTTCCTCCAGGAAGCGCGCa > 2:1287555/1‑150 (MQ=255) aCTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCgcgcgccg > 1:571885/1‑148 (MQ=255) tCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGt < 2:571885/150‑1 (MQ=255) cGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGtt > 2:1749032/1‑150 (MQ=255) tGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGa > 1:597901/1‑150 (MQ=255) acCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTg > 2:569593/1‑150 (MQ=255) acCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTg < 2:1879255/150‑1 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtcc > 1:17155‑M2/1‑122 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtcc < 2:17155‑M2/125‑4 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTg > 1:26346/1‑148 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTg < 2:26346/148‑1 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGc < 1:700613/150‑1 (MQ=255) gCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCAc > 2:267044/1‑150 (MQ=255) cTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGgc < 1:1749032/150‑1 (MQ=255) cACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGgcgc > 1:226154/1‑150 (MQ=255) cACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGgcgc > 2:1828966/1‑150 (MQ=255) catgATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGcc > 1:1827349/4‑150 (MQ=255) aTTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATcc < 1:857345/150‑1 (MQ=255) aTTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGACGTGGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGACAGATTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATcc > 1:1807713/1‑150 (MQ=255) tCCTTGAGGTTCAGCTCACGGGCTGAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCa < 1:99301/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCAt < 1:267044/150‑1 (MQ=255) cTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAggaggagcgcttccaggctgccctgacc > 1:706189‑M1/1‑92 (MQ=255) cTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAggaggagcgcttccaggctgccctgacc < 2:706189‑M1/120‑29 (MQ=255) ttGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCCGGGGGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGc > 1:1397865/1‑150 (MQ=255) ttGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGc > 2:831110/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTcc < 1:1334412/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTcc > 2:779365/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTcc > 2:181427/1‑150 (MQ=255) cAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTc < 1:875493/150‑1 (MQ=255) gCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAggaggagcgcttccaggctgcc < 1:189089‑M1/103‑23 (MQ=255) gCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAggaggagcgcttccaggctgcc > 2:189089‑M1/1‑81 (MQ=255) gtagtaCAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTc < 1:779365/150‑1 (MQ=255) gtagtaCAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTc < 2:226154/150‑1 (MQ=255) taCAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGGAGTCCTGc > 1:681443/1‑150 (MQ=255) 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cAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGgtc < 2:1827349/150‑1 (MQ=255) aCCAGGCGCTCACGCTCCGGTAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCa > 2:1300738/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGa > 2:179430/1‑86 (MQ=255) cAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGa < 1:179430/86‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCaaa < 2:1173854/150‑1 (MQ=255) gcTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGa < 2:744998/150‑1 (MQ=255) 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ttGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAgg < 1:1828966/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAgg < 1:451122/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAgg < 1:831110/150‑1 (MQ=255) tCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCa < 2:1402578/69‑1 (MQ=255) tCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCa > 1:1402578/1‑69 (MQ=255) ggTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagctgaacctcaag < 2:706189‑M2/120‑93 (MQ=255) ggTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagctgaacctcaag > 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(MQ=255) gCCTGGAggaggagcgcttccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagctgaacctcaaggaaatcggtgaggtgctgggtgtcagcgagtcgcgggtca < 1:1398108‑M1/150‑144 (MQ=255) ccTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAat > 2:315817/1‑150 (MQ=255) tGGAggaggagcgcttccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagctgaacctcaaggaaatcggtgaggtgctgggtgtcagcgagtcgcgggtcagcc > 2:208517‑M1/1‑4 (MQ=255) tGGAggaggagcgcttccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgcgggggctgtactacgacacagagctgaacttcagtgaaatcggtgaggtgctgggtgtcagcgagtcgcgggtcagcc > 1:1400756‑M1/1‑4 (MQ=255) tGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTgg < 1:1492143/42‑1 (MQ=255) tGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTgg > 2:1492143/1‑42 (MQ=255) ggaggaggagcgcttccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagctgaacctcaaggaaatcggtgaggtgctgg < 2:17155‑M1/125‑123 (MQ=255) ggaggaggagcgcttccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagctgaacctcaaggaaatcggtgaggtgctgg > 1:17155‑M1/1‑3 (MQ=255) gAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAatcatc > 2:354708/1‑150 (MQ=255) | TTGGCTGTGCAACTGGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAATCATC > NC_002947/4931570‑4931866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |