New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4931718 | 56 (0.770) | 4 (0.060) | 4/234 | NT | 6.7% | coding (545/741 nt) | fliA | RNA polymerase sigma 28 factor |
? | NC_002947 | = 4931729 | 58 (0.840) | coding (534/741 nt) | fliA | RNA polymerase sigma 28 factor |
GGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAATCATCGAGACTCAATT > NC_002947/4931584‑4931877 | ggCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtcca > 2:208517‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCACTGAAGTTCAGCTCTGTGTCGTAGTACAGCCCCCGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtcca > 1:1400756‑M2/1‑146 (MQ=255) tGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggc > 2:1398108‑M2/1‑143 (MQ=255) tGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggc < 1:1398108‑M2/150‑8 (MQ=255) ccGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCcgcg > 2:1218055/1‑150 (MQ=255) gcgACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCcgcgcg > 1:1173854/1‑150 (MQ=255) gACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATCGCCTCGGGCAGGGCATCCTGGAAGCGCTCTTCCTCCAGGAAGCGCGCa > 2:1287555/1‑150 (MQ=255) aCTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCgcgcgccg > 1:571885/1‑148 (MQ=255) tCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGt < 2:571885/150‑1 (MQ=255) cGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGtt > 2:1749032/1‑150 (MQ=255) tGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGa > 1:597901/1‑150 (MQ=255) acCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTg > 2:569593/1‑150 (MQ=255) acCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTg < 2:1879255/150‑1 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtcc < 2:17155‑M2/125‑4 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtcc > 1:17155‑M2/1‑122 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTg < 2:26346/148‑1 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTg > 1:26346/1‑148 (MQ=255) ccAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGc < 1:700613/150‑1 (MQ=255) gCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCAc > 2:267044/1‑150 (MQ=255) cTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGgc < 1:1749032/150‑1 (MQ=255) cACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGgcgc > 1:226154/1‑150 (MQ=255) cACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGgcgc > 2:1828966/1‑150 (MQ=255) catgATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGcc > 1:1827349/4‑150 (MQ=255) aTTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATcc < 1:857345/150‑1 (MQ=255) aTTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGACGTGGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGACAGATTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATcc > 1:1807713/1‑150 (MQ=255) tCCTTGAGGTTCAGCTCACGGGCTGAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCa < 1:99301/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCAt < 1:267044/150‑1 (MQ=255) ttGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCCGGGGGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGc > 1:1397865/1‑150 (MQ=255) ttGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGc > 2:831110/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTcc < 1:1334412/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTcc > 2:181427/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTcc > 2:779365/1‑150 (MQ=255) cAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTc < 1:875493/150‑1 (MQ=255) gtagtaCAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTc < 1:779365/150‑1 (MQ=255) gtagtaCAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTc < 2:226154/150‑1 (MQ=255) taCAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGGAGTCCTGc > 1:681443/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCcgcgcg < 2:1081771/87‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCcgcgcg > 1:1081771/1‑87 (MQ=255) gcgcCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACa < 2:996317/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACa > 1:189224/1‑150 (MQ=255) cgcCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAg < 2:762550/150‑1 (MQ=255) cAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGgtc > 1:744998/1‑150 (MQ=255) cAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGgtc < 2:1827349/150‑1 (MQ=255) aCCAGGCGCTCACGCTCCGGTAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCa > 2:1300738/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGa > 2:179430/1‑86 (MQ=255) cAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGa < 1:179430/86‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCaaa < 2:1173854/150‑1 (MQ=255) gcTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGa < 2:744998/150‑1 (MQ=255) tCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAggcgg < 2:189224/150‑1 (MQ=255) cggtaGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCt < 1:1300738/146‑1 (MQ=255) ggCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTg > 2:451122/1‑150 (MQ=255) ggTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCa < 2:457907/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTGCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAg < 2:1397865/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAgg < 1:1828966/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAgg < 1:831110/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAgg < 1:451122/150‑1 (MQ=255) tCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCa < 2:1402578/69‑1 (MQ=255) tCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCa > 1:1402578/1‑69 (MQ=255) ggTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagctgaacctcaag > 1:706189‑M2/1‑28 (MQ=255) ggTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagctgaacctcaag < 2:706189‑M2/120‑93 (MQ=255) aGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCg < 2:597901/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagc > 2:189089‑M2/1‑22 (MQ=255) ggCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCtccaggctgccctgaccgaggccatcgccaacctgccggagcgtgagcgcctggtgctggcgctgtactacgacgaagagc < 1:189089‑M2/103‑82 (MQ=255) ggCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCgta < 1:1286700/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCgtagta > 1:343630/1‑150 (MQ=255) ccTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAat > 2:315817/1‑150 (MQ=255) tGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTgg < 1:1492143/42‑1 (MQ=255) tGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTgg > 2:1492143/1‑42 (MQ=255) gAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAatcatc > 2:354708/1‑150 (MQ=255) tcctccAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAATCATCGAGACTCAAt > 1:53735/1‑150 (MQ=255) cctccAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAATCATCGAGACTCAAtt < 2:343630/150‑1 (MQ=255) | GGCTGACCCGCGACTCGCTGACACCCAGCACCTCACCGATTTCCTTGAGGTTCAGCTCTTCGTCGTAGTACAGCGCCAGCACCAGGCGCTCACGCTCCGGCAGGTTGGCGATGGCCTCGGTCAGGGCAGCCTGGAAGCGCTCCTCCTCCAGGCCGCGCGCAGGTTCGACCTGGCCACTGGCGCCATCCTCATGCAGTCCTTCGTGCTCGCCGTCCTGCAACAGGTCGTCAAAGCTGAACAGGCGGCTGCCCAGGGTATCGTTCAAGATCCCGTAGTAATCATCGAGACTCAATT > NC_002947/4931584‑4931877 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |