| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4933218 = | 59 (0.810) | 4 (0.060) | 4/234 | NT | 6.3% | coding (1276/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
| ? | NC_002947 | 4933250 = | 63 (0.920) | coding (1244/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF | |||||
CTGTACGGGATGCATGCTACCCATGTCTGTTCTTTACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGA > NC_002947/4933069‑4933366 | cTGTACGGGATGCATGCTACCCATGTCTGTTCTTTACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATc > 2:845687/1‑150 (MQ=255)cTGTACGGGATGCATGCTACCCATGTCTGTTCTTTACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATc > 1:1609266/1‑150 (MQ=255) tGTACGGGATGCATGCTACCCATGTCTGTTCTTTACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCGTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCa < 1:1846001/150‑1 (MQ=255) gccttggcgatgtgttgagccttgccatcagtcatgaactgccagtggcctatcttaccgatggcccacgcattcctgacgacctgcacttgccgcggggccaccagttggtcacgcgggcggtgaatgtgcagcagcaggacgagccCa < 2:346382‑M1/2‑1 (MQ=255) tACGGGATGCATGCTACCCATGTCTGTTCTTTACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGc < 2:1813410/150‑1 (MQ=255) tACGGGATGCATGCTACCCATGTCTGTTCTTTACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGc > 1:1778028/1‑150 (MQ=255) cGGGATGCATGCTACCCATGTCTGTTCTTTACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACTCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGa > 2:38896/1‑150 (MQ=255) ggcgatgtgttgagccttgccatcagtcatgaactgccagtggcctatcttaccgatggcccacgcattcctgacgacctgcacctgccgcggggccaccagttggtcacgcgggcggtgaatgtgcagcagcaggacgagccCAGCGaa < 2:1400659‑M1/7‑1 (MQ=255) gcatgcTACCCATGTCTGTTCTTTACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGt < 1:480736/150‑1 (MQ=255) tACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGc > 1:1612451/1‑150 (MQ=255) ctccTTGTCTCGCTGGCACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCTTCCCTCTTCAAACAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGc < 1:823019/148‑1 (MQ=255) atgaactgccagtggcctatcttaccgatggcccacgcattcctgacgacctgcacctgccgcggggccaccagttggtcacgcgggcggtgaatgtgcagcagcaggacgagccCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGc < 2:1062699‑M1/35‑1 (MQ=255) cTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGc > 2:861773/1‑134 (MQ=255) cTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCACCTTGGCATAGCGACTTTGGACACGCTTCATGGTCAACACGTTGGAAGTGTGTTGTGTTAGAGATCAGGGAACATATC‑‑GGCCATGGTCTCGTGGCTGGGCtag > 2:823019/1‑148 (MQ=255) cTTCTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGc < 1:861773/134‑1 (MQ=255) cTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCctgctgc > 2:1492541/1‑150 (MQ=255) aCTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGcac > 2:1819450/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACAt > 2:206016/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACAt > 2:1591367/1‑150 (MQ=255) ggCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCa < 2:1410694/150‑1 (MQ=255) gCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAc > 2:1034169/1‑150 (MQ=255) gCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCAGAGCGACTTTGCACACGCTTGATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAc < 2:822886/150‑1 (MQ=255) cacaCGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAccg > 2:781262/1‑150 (MQ=255) gTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAccgcccgc > 2:1709913/1‑150 (MQ=255) aGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGt < 1:206016/150‑1 (MQ=255) gCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCAAGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTACTGCACATTCACCGCCCGCGTGAc > 2:1801473/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCa > 2:336522/1‑150 (MQ=255) ttCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTTCACATTCACCGCCCGCGTGACCAAc > 2:893258/1‑150 (MQ=255) ttCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAAc > 2:962562/1‑150 (MQ=255) tGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTTATGGTCAACCCGCTCTCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTATTGGCTGGGCTCGTCCTGCTACTTCACATTCACCGCCCGCGTGATCAACttg > 2:243289/1‑148 (MQ=255) gCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACtggt < 2:1844852/150‑1 (MQ=255) gTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACtggtgg < 2:970099/150‑1 (MQ=255) ctgcacctgccgcggggccaccagttggtcacgcgggcggtgaatgtgcagcagcaggacgagccCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTTTTCGCTgg > 2:619129‑M1/66‑98 (MQ=255) ctgcacctgccgcggggccaccagttggtcacgcgggcggtgaatgtgcagcagcaggacgagccCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTTTTCGCTgg < 1:619129‑M1/33‑1 (MQ=255) ccatGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCcg > 1:1941119/4‑150 (MQ=255) ccTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCcg > 2:164019/1‑150 (MQ=255) cTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCcgc > 2:1727900/1‑150 (MQ=255) cTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCcgc > 1:90373/1‑150 (MQ=255) gCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgca > 2:1102026/1‑150 (MQ=255) gaTAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GCCCATAGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCTCGgcag > 2:281092/2‑150 (MQ=255) aTAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcagg > 2:1619843/1‑150 (MQ=255) tAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggt < 1:1709913/150‑1 (MQ=255) tAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCATCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggt < 1:1591367/150‑1 (MQ=255) gCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGt < 1:554730/122‑1 (MQ=255) gCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGt > 2:554730/1‑122 (MQ=255) cTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACtggtg < 1:1401183/130‑1 (MQ=255) cTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATGCACCGCCCGCGTGACCAACtggtg > 2:1401183/1‑130 (MQ=255) cGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGaa < 1:1727900/150‑1 (MQ=255) aTGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTg < 1:1034169/150‑1 (MQ=255) tGGTCAACCCGCTCTCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGATCTTGGGACCAACTGGTGCCTCTTCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTgg < 1:243289/150‑1 (MQ=255) tGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTgg < 1:962562/150‑1 (MQ=255) gTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGgtc < 2:1539600/133‑1 (MQ=255) gTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGgtc > 1:1539600/1‑133 (MQ=255) aaCCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCAt < 1:1619843/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTACAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCAt < 2:1778028/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCgg > 1:979515/1‑150 (MQ=255) tCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAg < 1:467738/128‑1 (MQ=255) tCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAg > 2:467738/1‑128 (MQ=255) cGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCCCCTTGACCGCCCGCGTGACCACCTGGTAACCCCGCGTCAGGTGCAGGGCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAg > 1:1400659/1‑150 (MQ=255) gcagcagcaggacgagccCAGCGAAGAGGCCATGGCC‑‑GACATGTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAgg < 1:1062699‑M1/132‑1 (MQ=255) gTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAgg < 1:781262/150‑1 (MQ=255) ggTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCa < 1:1102026/150‑1 (MQ=255) gTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCAc < 2:1742257/150‑1 (MQ=255) ccgatcttAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCAc < 1:216979/143‑1 (MQ=255) tgATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCACGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGc > 1:1455756/1‑150 (MQ=255) aTAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAg > 2:1796973/1‑150 (MQ=255) agagATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAc < 2:191005/64‑1 (MQ=255) agagATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAc > 1:191005/1‑64 (MQ=255) agagATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGtt > 2:1655148/1‑150 (MQ=255) agagATCAGCGAACATGGC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCTTCCGCGAGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGAAGGGCATGAGGAATAAGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACtagagcgg > 2:216979/1‑143 (MQ=255) gagaTCAGCGAACATTTC‑‑GGCCATGGCCTCTGCGTTGTGTTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTTACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTc < 1:336522/150‑1 (MQ=255) tCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGa < 2:979515/150‑1 (MQ=255) | CTGTACGGGATGCATGCTACCCATGTCTGTTCTTTACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGA > NC_002947/4933069‑4933366 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |