| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4933218 = | 59 (0.810) | 4 (0.060) | 4/234 | NT | 6.3% | coding (1276/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
| ? | NC_002947 | 4933250 = | 63 (0.920) | coding (1244/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF | |||||
TACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGC > NC_002947/4933103‑4933397 | tACCTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGc > 1:1612451/1‑150 (MQ=255)ctccTTGTCTCGCTGGCACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCTTCCCTCTTCAAACAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGc < 1:823019/148‑1 (MQ=255)atgaactgccagtggcctatcttaccgatggcccacgcattcctgacgacctgcacctgccgcggggccaccagttggtcacgcgggcggtgaatgtgcagcagcaggacgagccCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGc < 2:1062699‑M1/35‑1 (MQ=255) cTTGTCTCGCTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCACCTTGGCATAGCGACTTTGGACACGCTTCATGGTCAACACGTTGGAAGTGTGTTGTGTTAGAGATCAGGGAACATATC‑‑GGCCATGGTCTCGTGGCTGGGCtag > 2:823019/1‑148 (MQ=255) cTGGGACTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCctgctgc > 2:1492541/1‑150 (MQ=255) cctatcttaccgatggcccacgcattcctgacgacctgcacctgccgcggggccaccagttggtcacgcgggcggtgaatgtgcagcagcaggacgagcccagcgaacatgtcggccatggcctcttcgctgGGCTCGTCCtgctgctgc < 1:1062699‑M2/18‑1 (MQ=255) aCTCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGcac > 2:1819450/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACAt > 2:206016/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACAt > 2:1591367/1‑150 (MQ=255) ggCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCa < 2:1410694/150‑1 (MQ=255) gCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAc > 2:1034169/1‑150 (MQ=255) gCCACACGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCAGAGCGACTTTGCACACGCTTGATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAc < 2:822886/150‑1 (MQ=255) cacaCGTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAccg > 2:781262/1‑150 (MQ=255) 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gaTAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GCCCATAGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCTCGgcag > 2:281092/2‑150 (MQ=255) aTAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcagg > 2:1619843/1‑150 (MQ=255) tAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggt < 1:1709913/150‑1 (MQ=255) tAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCATCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggt < 1:1591367/150‑1 (MQ=255) gCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGt > 2:554730/1‑122 (MQ=255) gCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGt < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |