New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4933279 = | 63 (0.860) | 4 (0.060) | 4/238 | NT | 6.8% | coding (1215/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
? | NC_002947 | 4933306 = | 49 (0.700) | coding (1188/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
GTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGAT > NC_002947/4933133‑4933425 | gTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCAccgcccgc > 2:1709913/1‑150 (MQ=255) aGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGt < 1:206016/150‑1 (MQ=255) gCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCAAGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTACTGCACATTCACCGCCCGCGTGAc > 2:1801473/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCa > 2:336522/1‑150 (MQ=255) ttCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTTCACATTCACCGCCCGCGTGACCAAc > 2:893258/1‑150 (MQ=255) ttCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAAc > 2:962562/1‑150 (MQ=255) tGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTTATGGTCAACCCGCTCTCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTATTGGCTGGGCTCGTCCTGCTACTTCACATTCACCGCCCGCGTGATCAACttg > 2:243289/1‑148 (MQ=255) gCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACtggt < 2:1844852/150‑1 (MQ=255) gTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACtggtgg < 2:970099/150‑1 (MQ=255) ctggccggctgcatcctgaccaaactcgatgaaacggcaagccttggcgatgtgttgagccttgccatcagtcatgaactgccagtggcatatcttaccgatggcccacgcattcctgacgacctgcacctgCCGCGTGACCAACtggtg < 2:1468393‑M1/18‑1 (MQ=255) ccatGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCcg > 1:1941119/4‑150 (MQ=255) ccTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCcg > 2:164019/1‑150 (MQ=255) cTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCcgc > 2:1727900/1‑150 (MQ=255) cTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCcgc > 1:90373/1‑150 (MQ=255) gCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgca > 2:1102026/1‑150 (MQ=255) gaTAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GCCCATAGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCTCGgcag > 2:281092/2‑150 (MQ=255) aTAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcagg > 2:1619843/1‑150 (MQ=255) tAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggt < 1:1709913/150‑1 (MQ=255) tAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCATCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggt < 1:1591367/150‑1 (MQ=255) gCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGt < 1:554730/122‑1 (MQ=255) gCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGt > 2:554730/1‑122 (MQ=255) cTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACtggtg < 1:1401183/130‑1 (MQ=255) cTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATGCACCGCCCGCGTGACCAACtggtg > 2:1401183/1‑130 (MQ=255) cGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGaa < 1:1727900/150‑1 (MQ=255) aTGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTg < 1:1034169/150‑1 (MQ=255) tGGTCAACCCGCTCTCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGATCTTGGGACCAACTGGTGCCTCTTCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTgg < 1:243289/150‑1 (MQ=255) tGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTgg < 1:962562/150‑1 (MQ=255) gTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGgtc < 2:1539600/133‑1 (MQ=255) gTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGgtc > 1:1539600/1‑133 (MQ=255) aaCCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCAt < 1:1619843/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTACAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCAt < 2:1778028/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCgg > 1:979515/1‑150 (MQ=255) tCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAg > 2:467738/1‑128 (MQ=255) tCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAg < 1:467738/128‑1 (MQ=255) cGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCCCCTTGACCGCCCGCGTGACCACCTGGTAACCCCGCGTCAGGTGCAGGGCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAg > 1:1400659/1‑150 (MQ=255) gcagcagcaggacgagccCAGCGAAGAGGCCATGGCC‑‑GACATGTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAgg < 1:1062699‑M1/132‑1 (MQ=255) gTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAgg < 1:781262/150‑1 (MQ=255) ggTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCa < 1:1102026/150‑1 (MQ=255) gTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCAc < 2:1742257/150‑1 (MQ=255) ccgatcttAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCAc < 1:216979/143‑1 (MQ=255) tgATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCACGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGc > 1:1455756/1‑150 (MQ=255) aTAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAg > 2:1796973/1‑150 (MQ=255) agagATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGtt > 2:1655148/1‑150 (MQ=255) agagATCAGCGAACATGGC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCTTCCGCGAGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGAAGGGCATGAGGAATAAGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACtagagcgg > 2:216979/1‑143 (MQ=255) gagaTCAGCGAACATTTC‑‑GGCCATGGCCTCTGCGTTGTGTTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTTACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTc < 1:336522/150‑1 (MQ=255) tCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGa < 2:979515/150‑1 (MQ=255) gcccagcgaagaggccatggccgacatgttcgctgGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCAt < 2:1062699‑M2/115‑1 (MQ=255) ccagcgaaaaggccatggccgacatgttcgctgGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggtgcag > 2:619129‑M2/34‑98 (MQ=255) ccagcgaaaaggccatggccgacatgttcgctgGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggtgcag < 1:619129‑M2/65‑1 (MQ=255) AGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTggg > 1:1499981‑M1/1‑115 (MQ=255) AGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTggg < 2:1499981‑M1/115‑1 (MQ=255) AGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCAt > 2:233721‑M1/1‑146 (MQ=255) AGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCAt < 1:233721‑M1/146‑1 (MQ=255) AGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACt < 2:94944‑M1/150‑1 (MQ=255) AACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCCGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATg > 2:1612451‑M1/1‑150 (MQ=255) ACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATgg > 2:236863‑M1/1‑150 (MQ=255) ACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATgg < 1:1218280‑M1/150‑1 (MQ=255) ACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCACGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATgg > 2:1455756‑M1/1‑150 (MQ=255) tGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCaa > 1:167344/1‑150 (MQ=255) gTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAg < 1:1655148/150‑1 (MQ=255) tC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAgg < 1:893258/150‑1 (MQ=255) ggCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCt > 2:1559284/1‑150 (MQ=255) ccATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCa > 1:1913282/1‑150 (MQ=255) cATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCaa < 1:38896/150‑1 (MQ=255) cATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCaa < 2:1218280/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAaca < 1:164019/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAaca > 1:1815785/1‑150 (MQ=255) tctTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAAGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCg > 1:346382/1‑150 (MQ=255) ttcgctgGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGcc < 2:1400659‑M2/143‑1 (MQ=255) tgGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAAGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGc < 2:346382‑M2/148‑1 (MQ=255) tCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGcc < 1:1819450/150‑1 (MQ=255) cGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTTACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCg > 1:1226951/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTgg < 2:1429064/101‑1 (MQ=255) tCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTgg > 1:1429064/1‑101 (MQ=255) ctgctgctgCACATTCACCGCCCGCGTTACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTc < 2:1226951/150‑1 (MQ=255) ctgctgctgCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggtgca < 1:1354863/56‑1 (MQ=255) ctgctgctgCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggtgca > 2:1354863/1‑56 (MQ=255) gacgacctgcacctgCCGCGGGGCCACCAGTTGGTCACGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATATGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAg < 1:1468393‑M1/135‑1 (MQ=255) acctgcacctgCCGCGGGGCCACCAGTTGGTCGCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGtt < 2:1568114‑M1/127‑1 (MQ=255) acctgcacctgCCGCGGGGCCACCAGTTGGTCGCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACGGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGtt > 1:1568114‑M1/12‑138 (MQ=255) cgatctccgcccgcGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTgg < 2:924899/144‑1 (MQ=255) caTTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCTGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTgg > 1:1217960/1‑150 (MQ=255) ttCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTc < 2:1609266/150‑1 (MQ=255) tCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCa < 1:94944/150‑1 (MQ=255) cgcccgcGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGAAGATCGACAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGTGAGGACCCTGGCCAGCGACGCCTTATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGtagatcg > 1:924899/1‑144 (MQ=255) | GTAGGGCAATTCTGCGTGCCCCTTGGCATAGCGACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTC‑‑GGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGAT > NC_002947/4933133‑4933425 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |