| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5463197 | 59 (0.810) | 5 (0.080) | 5/226 | NT | 7.6% | coding (201/939 nt) | PP_4799 | muramoyltetrapeptide carboxypeptidase |
| ? | NC_002947 | = 5463225 | 68 (1.020) | coding (173/939 nt) | PP_4799 | muramoyltetrapeptide carboxypeptidase | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTT > NC_002947/5463049‑5463346 | cGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCgct < 2:1528557/150‑1 (MQ=255) cTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCggc < 2:256546‑M1/150‑4 (MQ=255) gCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGGTCAAATTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCAAGAATGCACAGGATGGGGTGTAGTGGCGTACCGTCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTc > 2:1876528/1‑150 (MQ=255) gATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCgg < 2:213095/150‑1 (MQ=255) gCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATTGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCACGTCCTGCAGGCGCtggactacctggcggg > 2:110348‑M1/1‑134 (MQ=255) gCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTcc < 1:1739386/143‑1 (MQ=255) gCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTcc > 2:1739386/1‑143 (MQ=255) gCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCg > 1:1045878/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGcc > 1:267975/1‑150 (MQ=255) cGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCCGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcc < 2:1298618‑M2/150‑6 (MQ=255) gATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctg > 1:578957‑M2/1‑143 (MQ=255) tCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATTGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCagggctacctggcggggccggaccagcagcgcctgca < 1:110348‑M1/150‑38 (MQ=255) tCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgca < 2:777764‑M2/150‑10 (MQ=255) gTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTGGCCCTGCGCCTGCAggg > 2:544465/1‑150 (MQ=255) gTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgca > 1:1921401‑M2/1‑138 (MQ=255) gTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgca < 2:1921401‑M2/147‑10 (MQ=255) gTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAggg < 1:1725191/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGc > 2:904030/1‑150 (MQ=255) 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cTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCcgc < 1:1934907/80‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCgggg < 2:1737133/137‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCgggg > 1:1737133/1‑137 (MQ=255) tGCAGGCGCagggctacctggcggggccggaccagcagcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgccatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgcttgaccagctcgactttgaactga < 2:777764‑M1/150‑142 (MQ=255) tGCAGGCGCagggctacctggcggggccggaccagcagcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgccatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgcttgaccagctcgactttgaac > 1:1921401‑M1/1‑9 (MQ=255) tGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgcaatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgcttgaccagctcgactttgaactga < 1:110348‑M2/150‑114 (MQ=255) tGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAgccgc > 2:1718643/1‑120 (MQ=255) tGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAgccgc < 1:1718643/120‑1 (MQ=255) tGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCaaaa > 2:244998/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCagggctacctggcggggccggaccagcagcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgccatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgcttgaccagctcgactttgaactgatc > 1:578957‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCGCagggctacctggcggggccggaccagcagcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgcggatccggccatggacgccatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgcttgaccagctcgactttgaactgatccg < 2:1298618‑M1/150‑146 (MQ=255) gctgctGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCgg < 2:1067511/74‑1 (MQ=255) gctgctGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCgg > 1:1067511/1‑74 (MQ=255) gctgctGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGt < 2:1816206/150‑1 (MQ=255) gctgctGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGt > 1:1738827/1‑150 (MQ=255) gcagggctacctggcggggccggaccagcagcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgccatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgctt > 1:834373‑M1/1‑2 (MQ=255) gcagggctacctggcggggccggaccagcagcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgccatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgctt < 2:834373‑M1/121‑120 (MQ=255) gcagggctacctggcggggccggaccagcagcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggac < 2:1836977‑M1/76‑75 (MQ=255) gcagggctacctggcggggccggaccagcagcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggac > 1:1836977‑M1/1‑2 (MQ=255) ctgctgGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGtt < 2:267975/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGtt < 1:777764/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGtt < 1:276875/150‑1 (MQ=255) | CGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTT > NC_002947/5463049‑5463346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |