| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5463197 | 59 (0.810) | 5 (0.080) | 5/226 | NT | 7.6% | coding (201/939 nt) | PP_4799 | muramoyltetrapeptide carboxypeptidase |
| ? | NC_002947 | = 5463225 | 68 (1.020) | coding (173/939 nt) | PP_4799 | muramoyltetrapeptide carboxypeptidase | |||||
CGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGG > NC_002947/5463081‑5463373 | cGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCCGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcc < 2:1298618‑M2/150‑6 (MQ=255) gATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctg > 1:578957‑M2/1‑143 (MQ=255) tCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgca < 2:777764‑M2/150‑10 (MQ=255) gTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTGGCCCTGCGCCTGCAggg > 2:544465/1‑150 (MQ=255) gTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgca > 1:1921401‑M2/1‑138 (MQ=255) gTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgca < 2:1921401‑M2/147‑10 (MQ=255) gTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAggg < 1:1725191/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGc > 2:904030/1‑150 (MQ=255) aaGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCAccc > 2:1127433/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCAAGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTa > 1:1571396/1‑150 (MQ=255) tGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATa < 1:86435/150‑1 (MQ=255) gTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgcagg < 1:1389125‑M2/133‑12 (MQ=255) gTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgcagg > 2:1389125‑M2/1‑122 (MQ=255) aaGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgc < 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gATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTtgtg > 1:1816206/1‑150 (MQ=255) ggCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTgcgc > 1:191096/1‑150 (MQ=255) cGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCAt < 2:1264231/150‑1 (MQ=255) gTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgc > 1:1836977‑M2/1‑74 (MQ=255) gTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgc < 2:1836977‑M2/76‑3 (MQ=255) gTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATc > 1:1763464/1‑150 (MQ=255) ccATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCTCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGTGCATCaa < 2:68955/150‑1 (MQ=255) ccATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCaa < 1:52666/150‑1 (MQ=255) ggATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAgccgcgcc < 1:904030/150‑1 (MQ=255) gATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAgccgcgccg > 2:276875/1‑150 (MQ=255) aTCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAAc < 2:248110/95‑1 (MQ=255) aTCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAAc > 1:248110/1‑95 (MQ=255) 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aaGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgccatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgcttgacca < 2:1596374‑M2/139‑97 (MQ=255) aaGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgccatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgcttgacca > 1:1596374‑M2/1‑43 (MQ=255) aaGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAgccgcgccgc > 1:1661151/1‑131 (MQ=255) aaGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAgccgcgccgc < 2:1661151/131‑1 (MQ=255) aaGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATg > 1:1318610/1‑150 (MQ=255) aaGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATg > 2:1167871/1‑150 (MQ=255) aaGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATg > 2:496029/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCcgc < 1:1934907/80‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCcgc > 2:1934907/1‑80 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCgggg > 1:1737133/1‑137 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCgggg < 2:1737133/137‑1 (MQ=255) tGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgcctgcaggacttgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgcaatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgcttgaccagctcgactttgaactga < 1:110348‑M2/150‑114 (MQ=255) tGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAgccgc > 2:1718643/1‑120 (MQ=255) tGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAgccgc < 1:1718643/120‑1 (MQ=255) tGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCaaaa > 2:244998/1‑150 (MQ=255) gctgctGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCgg > 1:1067511/1‑74 (MQ=255) gctgctGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCgg < 2:1067511/74‑1 (MQ=255) gctgctGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGt < 2:1816206/150‑1 (MQ=255) 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cGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAg > 2:390223/1‑150 (MQ=255) ccccGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAgcgc < 2:1605690/150‑1 (MQ=255) cccGCCAGGTAGTCCAgcgcctgcaggacgtgcatgcagcgtttgccgatccggccatggacgcaatcctgtgcatgcgtgggggctacggcagcatgcgcctgcttgaccagctcgactttgaactgatccggcgcaaccccaagccgc > 2:110348‑M2/1‑16 (MQ=255) ccGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCaa > 1:1696605/1‑47 (MQ=255) ccGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCaa < 2:1696605/47‑1 (MQ=255) ccGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCgg > 1:390221/1‑150 (MQ=255) ccAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTg < 1:244998/150‑1 (MQ=255) cAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCt < 1:767265/148‑1 (MQ=255) cAGGTAGCCATGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCt > 2:767265/1‑148 (MQ=255) tAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGAAACGGTTGATCGAGTTAGCTTAGTACTGGCTAACCTTAACAGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAgg < 1:1400232/150‑1 (MQ=255) aGCCCTGCGCCTGGAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAggg < 1:1298618/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAgggt < 2:390221/150‑1 (MQ=255) cccTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAgggtg < 2:1606552/150‑1 (MQ=255) cccTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAgggtg > 2:407493/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGc < 2:809591/139‑1 (MQ=255) ccTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGc > 1:809591/1‑139 (MQ=255) ccTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAgggtgg > 1:1246022/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAgggtgg > 2:207230/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCagggaggg > 1:1727362/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAgggtggg > 1:1286591/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAgggtggg > 2:1723962/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAgggtggg > 1:1422136/1‑150 (MQ=255) | CGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGG > NC_002947/5463081‑5463373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |