New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5681938 | 54 (0.740) | 4 (0.060) | 4/232 | NT | 7.5% | coding (78/474 nt) | PP_4987 | putative Chemotaxis protein |
? | NC_002947 | = 5681955 | 48 (0.700) | coding (61/474 nt) | PP_4987 | putative Chemotaxis protein |
CACGGCGTCTCACCACCGCACGCGGCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGCTCTGCAACAGCAGCGATTCCTGGTACGGCTTGCCCAGGTATTCGTTGA > NC_002947/5681789‑5682087 | aacGGCGTCCCACCACCGACCGCGGCCGCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCGCACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGC < 2:913598‑M1/149‑1 (MQ=255) gCGTCTCACCACCGCACGCGGCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAaca < 2:1746376/150‑1 (MQ=255) gCGTCTCACCACCGCACGCGGCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAaca > 1:762286/1‑150 (MQ=255) tcACGACCGCACGCGGCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑Gc > 2:518996/1‑150 (MQ=255) tcACCACCGCGGGCGGCCGCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCCGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTTGGCAACACCA‑Gc > 2:519008/1‑150 (MQ=255) tcACAACCGCACGCGGCCTCGAAAGCAATAAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCAAGGTGCCCGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCTCCACGTTGGTCAACACCA‑Gc > 2:214580/1‑150 (MQ=255) caccacCGCACGCGGCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCg > 1:804221/1‑150 (MQ=255) caccGCACGCGGCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGc > 1:1488842/1‑150 (MQ=255) gCACGCGGCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTc < 2:1588207/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCCGCGAAACCGATCAACGGCGCTCCTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCGATGCGGCGTCGCCCTGGTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTGGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCgc > 2:114493‑M2/1‑148 (MQ=255) gcgGCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCgaccgcacgctggtgttgccc > 1:887304‑M1/1‑129 (MQ=255) ggCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCgcccaa < 1:1799755‑M2/150‑7 (MQ=255) tcgAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGc < 2:1799755‑M2/147‑1 (MQ=255) cgAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCa < 1:1280482‑M2/148‑1 (MQ=255) cgAAACCGATCAACGGCAGGCGTTACTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGCTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCa < 1:1612339‑M2/148‑1 (MQ=255) gactaccGGCAGGCGTTGCTGACCCCAGTCTATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCCGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACNGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAg < 1:819174/144‑1 (MQ=255) gATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAg > 2:657997/1‑150 (MQ=255) aTCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGc < 2:737990/150‑1 (MQ=255) aaCGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCg < 1:1649305/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCGACCGCACGC‑TGGTGTTgcccaacgtggcggtggccgagt > 2:887304‑M2/1‑127 (MQ=255) aCGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCa < 2:743196/117‑1 (MQ=255) aCGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCa > 1:743196/1‑117 (MQ=255) aCGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCgg > 1:1409139/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACCCTGCCCGCCCACCTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCCGTCTCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGgc < 1:1324516/150‑1 (MQ=255) cTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGAGAGACTGTAAACAGCTACTATTTGACGCTGCTTTCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGTCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTgcg > 1:822130/1‑150 (MQ=255) cAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCg < 1:720544/150‑1 (MQ=255) aGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCgg < 2:840463/150‑1 (MQ=255) gTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGa > 2:870709/1‑150 (MQ=255) gTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGa > 1:1342319/1‑150 (MQ=255) tCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGaa > 2:1281068/1‑150 (MQ=255) aTCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATc > 1:573310/1‑150 (MQ=255) aCCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGgca < 1:838840/108‑1 (MQ=255) aCCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGgca > 2:838840/1‑108 (MQ=255) aCCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGtt > 1:681927/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCGACCGCA‑CGCTGGTGTTgcccaacgtggcggtggccgagttgagcgggcagc < 2:102692‑M2/125‑36 (MQ=255) gTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCGACCGCA‑CGCTGGTGTTgcccaacgtggcggtggccgagttgagcgggcagc > 1:102692‑M2/1‑90 (MQ=255) ggCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGATGCTGACCCAGCAGGCTGCTGCACTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCt > 2:50286/1‑150 (MQ=255) ggggTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAac > 2:1871763/1‑67 (MQ=255) ggggTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAac < 1:1871763/67‑1 (MQ=255) ggggTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGc < 2:292326/150‑1 (MQ=255) cGCCATGCTGGCACCCCAGGTTACCCTGCCTGCTCAACTCGGCCAGCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCaa < 2:822130/150‑1 (MQ=255) gCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATggg < 1:1798987/138‑1 (MQ=255) gCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATggg > 2:1798987/1‑138 (MQ=255) ccATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATg > 1:451070/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATggg > 1:1486117/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATggg < 1:1870642/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATggg > 2:1211594/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATggg < 2:1486117/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCgcc > 1:1344754‑M2/1‑71 (MQ=255) tGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCgcc < 2:1344754‑M2/74‑4 (MQ=255) tGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGc < 1:846534/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGc < 1:657997/150‑1 (MQ=255) ggCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATg > 2:1362610/1‑150 (MQ=255) gCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGgca < 2:145901/77‑1 (MQ=255) gCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGgca > 1:145901/1‑77 (MQ=255) ccccAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGctct < 1:1248752/148‑1 (MQ=255) cacCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGctct < 2:1488842/150‑1 (MQ=255) cacCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGctct > 1:1527908/1‑150 (MQ=255) gTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGtt < 2:1056574/110‑1 (MQ=255) gTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGtt > 1:1056574/1‑110 (MQ=255) gCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCaacaccagcgtgcggtcgcccaacgtggcggtggccgagttgagcgggcagcgtaacctggtgtgccagcatggcgaccccgcctggcac < 2:102692‑M1/125‑91 (MQ=255) gCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCaacaccagcgtgcggtcgcccaacgtggcggtggccgagttgagcgggcagcgtaacctggtgtgccagcatggcgaccccgcctggcac > 1:102692‑M1/1‑35 (MQ=255) gCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGctct > 2:750111/1‑132 (MQ=255) gCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGctct < 1:750111/132‑1 (MQ=255) cTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGCTCTGCAACAGCAGCGATTCCTg < 1:518996/150‑1 (MQ=255) cTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGCTCTGCAACAGCAGCGATTCCTg < 1:519008/150‑1 (MQ=255) aCTCGGCCACCGCCACGTTGGGCaacaccagcgtgcggtcgcccaacgtggcggtggccgagttgagcgggcagcgtaacctggtgtgccagcatggcgaccccgcctggcacctggggtggatcgactggcgtcagcaacgcctgccgt > 2:887304‑M1/1‑23 (MQ=255) tCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTgcgc < 2:802295/75‑1 (MQ=255) tCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTgcgc > 1:802295/1‑75 (MQ=255) ccACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGCTCTGCAACAGCAGCGATTCCTGGTACGGCTTg < 1:1281068/150‑1 (MQ=255) aCCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGctct < 1:198079/119‑1 (MQ=255) aCCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGctct > 2:198079/1‑119 (MQ=255) cGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGAAACAGCGCGGTCAGGCTGATGCGGTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGTCGATGCTCTGCAACAGCAGCGATTCCTGGTACGGCTTGCCCAGGTAt < 2:406447/150‑1 (MQ=255) ttGGGCgaccgcacgctggtgttgcccaacgtggcggtggccgagttgagcgggcagcgtaacctggtgtgccagcatggcgaccccgcctggcacctggggtggatcgactggcgtcagcaacgcctgccgttgatcggtttcgaggcc < 1:1799755‑M1/150‑145 (MQ=255) gggCAACACCA‑GCGTGCGGTCgcccaacgtggcggtggccgagttgagcgggcagcgtaacctggtgtgccagcatggcgaccccgcctggcacctggggtggatcgactggcgtcagcaacgcctgccgttgatcggtttcgaggccgc > 1:887304‑M2/1‑21 (MQ=255) ggCgaccgcacgctggtgttgcccaacgtggcggtggccgagttgagcgggcagcgtaacctggtgtgccagca > 1:1344754‑M1/1‑3 (MQ=255) ggCgaccgcacgctggtgttgcccaacgtggcggtggccgagttgagcgggcagcgtaacctggtgtgccagca < 2:1344754‑M1/74‑72 (MQ=255) gCgaccgcacgctggtgttgccccacgtggcggtggccgagttgagcgggcagcgtaacctggtgtgccaccagggcgacgccgcatcgcacctggggtggatcgactggcgtcagcaaggagcgccgttgatcggtttcgcggccgcgt > 2:114493‑M1/1‑2 (MQ=255) cAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGCTCTGCAACAGCAGCGATTCCTGGTACGGCTTGCCCAGGTATTCGTTGa < 2:455142/150‑1 (MQ=255) | CACGGCGTCTCACCACCGCACGCGGCCTCGAAACCGATCAACGGCAGGCGTTGCTGACGCCAGTCGATCCACCCCAGGTGCCAGGCGGGGTCGCCATGCTGGCACACCAGGTTACGCTGCCCGCTCAACTCGGCCACCGCCACGTTGGGCAACACCA‑GCGTGCGGTCGCCCAACGGCAGCAACAGCCCGGTCAGGCTGCTGCGCTGGCCGGAAATCAGTTCAAGCATGGGCCTGGCTCCAATGGGCGATGCTCTGCAACAGCAGCGATTCCTGGTACGGCTTGCCCAGGTATTCGTTGA > NC_002947/5681789‑5682087 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |