| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6002391 = | 120 (1.640) | 6 (0.090) | 6/228 | NT | 5.8% | intergenic (‑35/+111) | amaA/amaB | L‑pipecolate oxidase/L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 6002465 = | 85 (1.270) | intergenic (‑109/+37) | amaA/amaB | L‑pipecolate oxidase/L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGCTCGC > NC_002947/6002245‑6002539 | tCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCAACGGCCAGCCCCTACGCGGCGCAGATCGGTTTGGTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTcg > 1:1307260/1‑150 (MQ=255) cacacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTcgc < 1:1741347/150‑1 (MQ=255) acacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGGTTCGTG‑GGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTcgcg > 1:1372144/1‑150 (MQ=255) acacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTcgcg > 2:509781/1‑150 (MQ=255) acacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTcgc < 2:1541142/149‑1 (MQ=255) acacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTcgc > 1:1540981/1‑149 (MQ=255) cacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg > 1:1005203/1‑150 (MQ=255) cacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg > 2:1803953/1‑150 (MQ=255) cacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg < 2:228674/150‑1 (MQ=255) ccgtgagtcgggctcggatgcctggaaaggctacatgcgtcgccagaccaacaccgtgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtcttgttgctgcatggccgggggcctggcccccggTTCGCgg > 1:1214578‑M1/144‑150 (MQ=255) ccgtgagtcgggctcggatgcctggaaaggctacatgcgtcgccagaccaacaccgtgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggTTCGCgg > 2:819696‑M1/144‑150 (MQ=255) cgtgagtcgggctcggatgcctggaaaggctacatgcgtcgccagaccaacaccgtgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggTTcgc > 1:1640830‑M1/143‑147 (MQ=255) cgtgagtcgggctcggatgcctggaaaggctacatgcgtcgccagaccaacaccgtgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggTTcgc < 2:1640830‑M1/5‑1 (MQ=255) aGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg > 2:1459906/1‑147 (MQ=255) aGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTa < 2:71026/150‑1 (MQ=255) gACATCGGCCTTGTGCTACCCTGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTaa > 2:477803/1‑150 (MQ=255) cATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCCGACGCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAc < 1:1457744/150‑1 (MQ=255) cATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAc < 1:509781/150‑1 (MQ=255) cATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAc < 2:682467/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAcc < 2:1444320/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1165285/150‑1 (MQ=255) gCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 1:1243120/1‑150 (MQ=255) gCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 1:351332/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg > 2:1768955/1‑150 (MQ=255) aCCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCAGAGGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGt > 1:451073/1‑150 (MQ=255) aCCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGTGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGt > 2:413816/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCTGGGCGGCGACGATCCGGTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGgtgt < 1:99815/150‑1 (MQ=255) aGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGTCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 2:1373271/1‑139 (MQ=255) aGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 1:1373271/139‑1 (MQ=255) gCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCt > 2:159235/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCt > 1:586447/1‑150 (MQ=255) gggCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGa < 1:563790/150‑1 (MQ=255) gcggcgACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACg > 1:834781/1‑150 (MQ=255) gACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAAccc > 2:1733290/1‑150 (MQ=255) gtcggtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTa < 2:351332/150‑1 (MQ=255) tcggtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAg < 1:712531/150‑1 (MQ=255) tcggtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAg > 2:712531/1‑150 (MQ=255) tcggtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAg < 2:915669/150‑1 (MQ=255) tcggtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAg > 1:1837775/1‑150 (MQ=255) tttGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTAGTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGc < 1:1879568/150‑1 (MQ=255) cTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTa > 1:1704993/1‑141 (MQ=255) cTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTa < 2:1704993/141‑1 (MQ=255) aCGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGAc < 1:206297/128‑1 (MQ=255) aCGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGAc > 2:206297/1‑128 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ccACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGaa < 2:1784061/150‑1 (MQ=255) gcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggTTcgcg < 1:892670‑M1/6‑1 (MQ=255) gcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggTTcgcg > 2:892670‑M1/76‑81 (MQ=255) aaGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCgg < 2:606587/150‑1 (MQ=255) aGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCggg < 2:1837775/150‑1 (MQ=255) aGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCggg < 1:1733290/150‑1 (MQ=255) 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2:963514/1‑100 (MQ=255) ccGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCTGGCCCCCggttc > 1:850552/1‑137 (MQ=255) cGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCGGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCaa < 2:1243120/150‑1 (MQ=255) tCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACa > 1:1618991/1‑150 (MQ=255) aGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGaa > 2:1556246/1‑83 (MQ=255) aGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGaa < 1:1556246/83‑1 (MQ=255) aGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAgg > 1:91906/1‑122 (MQ=255) aGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCa < 2:14685/150‑1 (MQ=255) aaTTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGCGGCATGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTc > 2:1423551/1‑150 (MQ=255) aTTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTCGGACGAACCCTGTAGGAGCgg > 2:742960/1‑93 (MQ=255) gTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAaca > 1:472531/1‑150 (MQ=255) ttCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAacac < 2:727828/150‑1 (MQ=255) ttCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACACGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAacac > 1:1416945/1‑150 (MQ=255) tCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACAGCAGTCGAACACg > 1:399971/1‑150 (MQ=255) cTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGa < 1:322421/150‑1 (MQ=255) ttgttgGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGAt > 2:1754239/1‑150 (MQ=255) gttgGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATAc > 2:250879/1‑150 (MQ=255) ttgGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATAcc < 1:1370886/150‑1 (MQ=255) ggggCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGCAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGTCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACCCGATAcccc > 1:1669034/1‑149 (MQ=255) gggCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCtt > 2:365736/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCa > 1:970039/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAg > 2:1257963/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCGGTGGCGGCAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGc > 1:50497/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATgcagca < 2:1153504/114‑1 (MQ=255) aGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATgcagca > 1:1153504/1‑114 (MQ=255) cggcCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCa < 2:1890891/150‑1 (MQ=255) cccTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCGAGctgccgct > 2:573718/1‑143 (MQ=255) tttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTAGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGCTcgc > 1:1855883/1‑150 (MQ=255) | TCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTT‑GTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGCTCGC > NC_002947/6002245‑6002539 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |