New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 619244 = | 96 (1.320) | 5 (0.070) | 4/236 | NT | 5.1% | coding (757/1329 nt) | pfeS‑I | histidine kinase |
? | NC_002947 | 619271 = | 96 (1.380) | coding (730/1329 nt) | pfeS‑I | histidine kinase |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGATCATCGGCC > NC_002947/619124‑619419 | gctgTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAAtt > 1:1028583/1‑150 (MQ=255) gTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGt < 2:1900735/150‑1 (MQ=255) ttCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTg < 1:539785/150‑1 (MQ=255) tCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGGTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTgc < 2:1330747/150‑2 (MQ=255) tCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGGCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTga < 2:1919711/150‑1 (MQ=255) cGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTgag > 1:642634/1‑150 (MQ=255) gtgtCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTc < 1:1030142/143‑1 (MQ=255) gtgtCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTc > 2:1030142/1‑143 (MQ=255) gtgtCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGAc > 2:13823/1‑150 (MQ=255) atccaGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTgagagatcgga > 2:1492855/1‑143 (MQ=255) tccaGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTgc > 2:774224/1‑150 (MQ=255) caggccaggTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTgagc < 2:1840838/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAAcagcag > 1:1203307/1‑150 (MQ=255) tCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAgg < 2:1415337/150‑1 (MQ=255) gggTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCt < 1:13823/150‑1 (MQ=255) gtgtTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGt > 1:189493/1‑150 (MQ=255) tgtTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGtt < 2:642634/150‑1 (MQ=255) ttttCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGgcgc < 2:1320022/144‑1 (MQ=255) ttttCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTAGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGgcgc > 1:1320022/1‑144 (MQ=255) ccAGCAGCTTCTGACTGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCaa < 2:1321190/150‑1 (MQ=255) cagcagCTTCTGCATGTCGGCTACCTCCCGGTCCGGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCACCAGCAGGCGCTGTTGCTCAAg > 1:154619/1‑150 (MQ=255) cagcagCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTTATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAg > 2:491389/1‑150 (MQ=255) agcagcTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGt < 1:1336208/112‑1 (MQ=255) agcagcTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGt > 2:773400/1‑122 (MQ=255) agcagcTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGt < 1:773400/122‑1 (MQ=255) gcagcTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGc > 1:1553340/1‑150 (MQ=255) cTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGgcg > 2:1041459/1‑150 (MQ=255) cATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAAca > 2:313478/1‑119 (MQ=255) cATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAAca < 1:313478/119‑1 (MQ=255) tCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGgcgc < 2:1013111/150‑1 (MQ=255) ggCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGccc > 2:1712177/1‑150 (MQ=255) aCCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGcc > 2:1207945/1‑150 (MQ=255) gatCACAGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAACGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCACTGGCGAAGGCGCCCGGCCa > 2:42500/3‑150 (MQ=255) cTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAt < 2:328293/150‑1 (MQ=255) cTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAt < 2:458109/150‑1 (MQ=255) tCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAtg > 1:455048/1‑150 (MQ=255) tCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAtg > 1:983710/1‑150 (MQ=255) tCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAtg > 2:356958/1‑150 (MQ=255) tCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAtg > 2:761332/1‑150 (MQ=255) cACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAtgt > 1:308720/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAAc < 2:133359/97‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGaa < 1:356958/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGaa > 1:727544/1‑150 (MQ=255) ggCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGt > 1:1381922/1‑78 (MQ=255) ggCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGt < 2:1381922/78‑1 (MQ=255) ggCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAgg > 2:96450/1‑150 (MQ=255) cttgagcaacagcgcctgctgttgcgcacgctgtctcacgaatTGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGt > 2:1720186‑M1/44‑76 (MQ=255) cttgagcaacagcgcctgctgttgcgcacgctgtctcacgaatTGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGt < 1:1720186‑M1/33‑1 (MQ=255) gcTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCt > 1:151095/1‑150 (MQ=255) cTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTg > 2:252428/1‑150 (MQ=255) gcAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCa > 2:1223591/1‑150 (MQ=255) gcAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCa > 2:1356413/1‑150 (MQ=255) cAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCTTGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAg < 1:887193/150‑1 (MQ=255) cAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGTCAg < 2:308720/150‑1 (MQ=255) cAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAg < 1:484054/150‑1 (MQ=255) cAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAg > 1:439813/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCa > 2:1630974/1‑150 (MQ=255) cggcggTGTCAAGTCGCTGTCATGGGTGTTGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGGAACAGCAGGCGGTTTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCAcc < 2:228968/150‑1 (MQ=255) cggcggTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCAcc < 1:1041459/150‑1 (MQ=255) cggTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAg < 2:455048/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCtc > 1:1666975/1‑150 (MQ=255) ggCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGt < 1:841688/84‑1 (MQ=255) ggCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGt > 2:841688/1‑84 (MQ=255) cAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAACTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCtcatc < 1:1424199/150‑1 (MQ=255) aaGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAAtt < 1:1835818/49‑1 (MQ=255) aaGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAAtt > 2:1835818/1‑49 (MQ=255) gTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCAcg > 2:680923/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCAcg > 1:143165/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCAcgc > 1:1619779/1‑150 (MQ=255) gCTGTCATGGGCGATGTGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCAGAGCGGAAGAGCGATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCAcgccg > 2:543183/1‑150 (MQ=255) cTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCAcgccgc < 2:1619779/150‑1 (MQ=255) gTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTc < 1:1072518/150‑1 (MQ=255) aTGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑g > 2:154125/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑g > 2:1248899/1‑150 (MQ=255) gggCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑gca < 1:154125/150‑1 (MQ=255) acgaattgcgcacgccgctggcgcggctgcgcaATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAg < 1:1720186‑M2/43‑1 (MQ=255) gtcGATGCGCAGCCGCGCCAGCGAAGTGCACCAATAGTGAGATAGTGTGGTTTACATCAGTCTCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑gcag < 2:1773115/148‑1 (MQ=255) ggCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑gcag < 2:116422/150‑1 (MQ=255) ggCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAAGCCGGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑gcag > 1:1773115/1‑150 (MQ=255) gCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAt > 2:1332490/1‑98 (MQ=255) gCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCAt < 1:1332490/98‑1 (MQ=255) gATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGCACCTGCGTGCTCAACTTCAGGCGCTGTTTCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑gcagggg < 1:435917/150‑1 (MQ=255) GCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑gcaggggcag < 1:1527498‑M1/150‑1 (MQ=255) gcacgccgctggcgcggctgcgcaATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTc < 1:10937‑M2/40‑1 (MQ=255) gcacgccgctggcgcggctgcgcaATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTc > 2:10937‑M2/25‑64 (MQ=255) gcacgccgctggcgcggctgcgcaATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑gcaggggcaggg > 2:588781‑M2/25‑150 (MQ=255) GCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGGGCCAGCTCACCCAGCtcatc > 1:1292280‑M1/1‑127 (MQ=255) GCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑gcaggggcaggg < 2:1813841‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCgg > 2:336816/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCgg < 2:439813/150‑1 (MQ=255) cgcgCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAGGGCCTGATCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCgggg < 1:1207945/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCa < 2:151095/150‑1 (MQ=255) ggcgTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGa < 2:1553340/150‑1 (MQ=255) gcgTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCC‑CGCTTGGCTGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGat < 1:543183/150‑1 (MQ=255) tgcgcaATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGatcat > 1:60442‑M2/7‑150 (MQ=255) tgcgcaATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGatcat > 2:1575446‑M2/7‑150 (MQ=255) cgcaATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGATCATCg > 2:1059514‑M2/5‑150 (MQ=255) gcaATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGATCATCgg > 1:774388‑M2/4‑150 (MQ=255) gcaATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGATCATCgg > 2:1605448‑M2/4‑150 (MQ=255) aATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGATCATCGGcc > 2:1806810‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCTGTTCGGTGTCCATCCAGGCCAGGTCGAGGGTGTTTTCCAGCAGCTTCTGCATGTCGGCTACCTCACGGTCCAGGCGCTCGCGCAGCTGCGGCGGTGGCAAGTCGCTGTCATGGGCGATGCGCAGCCGCGCCAGCGGCGTGCGCAATTCGTGAGACAGCGTGCGCAACAGCAGGCGCTGTTGCTCAAGGCTCTGGCGCAGGCGCCCGGCCATGTGCTCGAAGGCCTGAGCCAGCTCACCCAGCTCATCACGCCGCTCCT‑GCAGGGGCAGGGCGGGGCTGTCCAGATCATCGGCC > NC_002947/619124‑619419 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |