New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2577167 | 84 (1.150) | 8 (0.120) | 5/226 | NT | 8.7% | coding (1271/1776 nt) | PP_2259 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 2577215 | 92 (1.380) | coding (1223/1776 nt) | PP_2259 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CAGGTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGGGA > NC_002947/2577067‑2577362 | cAGGTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGt < 1:844604‑M2/150‑2 (MQ=255) gTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtggg > 1:801982‑M2/1‑146 (MQ=255) tGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑TCCTGCAGT‑CGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagt < 1:254207‑M2/150‑9 (MQ=255) aaaGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGCTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCAt < 2:1124392/150‑1 (MQ=255) gcCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCGTAC‑TGCAGT‑CGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGc < 2:254207/150‑1 (MQ=255) gcCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGc > 1:830255/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGcc < 1:381743/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCa < 2:444728/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGCGGGCAGTGGCATGTCGCCa > 2:1308848/1‑150 (MQ=255) gcACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCAt > 1:1584589/1‑150 (MQ=255) cTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCa > 1:406519/1‑150 (MQ=255) gtcgGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGaaa > 1:502091/1‑150 (MQ=255) gTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGcc < 1:428761/150‑1 (MQ=255) ttGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCg < 1:414744/150‑1 (MQ=255) ttGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCg > 2:1820947/1‑150 (MQ=255) cTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtggg < 1:1769933‑M2/101‑5 (MQ=255) tCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCt > 2:1774841/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCt > 2:1510013/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCt > 2:1255048/1‑150 (MQ=255) ccGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc < 1:1272995/150‑1 (MQ=255) ccGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc < 2:1690150/150‑1 (MQ=255) ccGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc < 2:1764236/150‑1 (MQ=255) cacGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGACAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAg > 1:752548/1‑150 (MQ=255) acGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGc > 1:627137/1‑103 (MQ=255) acGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGc < 2:627137/103‑1 (MQ=255) acGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGt > 1:203053/1‑150 (MQ=255) gcgGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAAtc < 2:1546631/106‑1 (MQ=255) gcgGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAAtc > 1:1546631/1‑106 (MQ=255) gcgGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTcc > 2:392313/1‑150 (MQ=255) cgGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTccc < 1:1016806/150‑1 (MQ=255) gATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCgg < 2:78038/150‑1 (MQ=255) caccggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGcc < 1:1533328/150‑1 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCg < 1:106999/142‑1 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCg > 2:106999/1‑142 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGccc < 1:290902/150‑1 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGccc < 1:990295/150‑1 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGCTTGccc > 1:1629459/1‑150 (MQ=255) ggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGtt > 1:1282914/1‑143 (MQ=255) ggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGtt < 2:1282914/143‑1 (MQ=255) gcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTtgt < 2:830255/150‑1 (MQ=255) gcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTtgt > 2:1547613/1‑150 (MQ=255) gcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTtgt > 1:596315/1‑150 (MQ=255) caccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTtgtg < 2:1294366/150‑1 (MQ=255) ccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTgtggt < 2:521605/150‑1 (MQ=255) 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tgctgcGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCAt < 1:1774841/150‑1 (MQ=255) tgcGCGTAC‑TGCAGT‑CGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGt > 2:299988/1‑130 (MQ=255) tgcGCGTAC‑TGCAGT‑CGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGt < 1:299988/130‑1 (MQ=255) tgcGCGTAC‑TGCAGT‑CGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGc > 1:1017175/1‑150 (MQ=255) ggcgcG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGc > 1:635885/2‑150 (MQ=255) ccg‑AT‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGa < 1:1784588/149‑1 (MQ=255) cg‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGaa < 2:203053/150‑1 (MQ=255) cg‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGaa < 2:1584589/150‑1 (MQ=255) g‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAAc > 1:998506/1‑150 (MQ=255) g‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTAGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTgtggtg < 2:1066326/116‑1 (MQ=255) g‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTAGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTgtggtg > 1:1066326/1‑116 (MQ=255) tGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAAt < 1:800431/50‑1 (MQ=255) tGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAAt > 2:800431/1‑50 (MQ=255) tGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATcc > 1:1193152/1‑57 (MQ=255) tGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATcc < 2:1193152/57‑1 (MQ=255) cAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATc > 2:662710/1‑54 (MQ=255) cAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTc < 1:1510013/150‑1 (MQ=255) cAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTc > 1:1256673/1‑150 (MQ=255) cAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTc > 1:944283/1‑150 (MQ=255) gTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCg < 2:255021/82‑1 (MQ=255) gTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCg > 1:255021/1‑82 (MQ=255) aCGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGAc < 1:1255048/150‑1 (MQ=255) aCGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGAc < 1:1547613/150‑1 (MQ=255) cgcAGCAGGCGGGCCTGGGCGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTcc < 1:1308848/150‑1 (MQ=255) gcagGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTccacca > 1:1369729/1‑150 (MQ=255) agGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTGGTAATAGCCTAACGGTTCCGACTCCACCAGt > 2:148202/1‑150 (MQ=255) ccTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCg < 2:406519/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCgg < 2:635885/150‑1 (MQ=255) gggtgggCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGGGa > 1:58446/1‑150 (MQ=255) | CAGGTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑AC‑TGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGGGA > NC_002947/2577067‑2577362 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |